Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

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Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 CT030657.2-201ENSMUST00000220710 792 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Gm19047-201ENSMUST00000220922 1099 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Gm6563-201ENSMUST00000056396 869 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Gm19272-202ENSMUST00000185181 2217 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Adcy10-203ENSMUST00000111440 5078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 A330023F24Rik-202ENSMUST00000181273 4217 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Emcn-202ENSMUST00000122064 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Olfr60-205ENSMUST00000216027 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Csde1-206ENSMUST00000197488 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Mrpl1-201ENSMUST00000036437 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Gm10610-202ENSMUST00000207184 2693 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Tek-202ENSMUST00000073939 4549 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Tmem182-201ENSMUST00000114765 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 4921534A09Rik-201ENSMUST00000213976 2495 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Klrc2-205ENSMUST00000145984 2811 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Vmn2r111-201ENSMUST00000092491 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Gm15348-201ENSMUST00000151188 3655 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Smarca2-242ENSMUST00000208751 1846 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Ttc41-201ENSMUST00000061458 1815 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Ddx19b-201ENSMUST00000040241 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Ighv1-18-201ENSMUST00000103504 306 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Gm13566-201ENSMUST00000117428 1142 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Gm14353-201ENSMUST00000122200 869 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
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Usp49Q6P9L4 4930405H06Rik-201ENSMUST00000159244 791 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
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Usp49Q6P9L4 Odaph-201ENSMUST00000178614 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
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Usp49Q6P9L4 Halr1-203ENSMUST00000189071 511 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
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Usp49Q6P9L4 Gm43033-201ENSMUST00000199682 425 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Gm44911-201ENSMUST00000208436 1062 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Helt-202ENSMUST00000210652 1282 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Tecr-214ENSMUST00000212990 648 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Tipin-201ENSMUST00000034964 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Nup43-201ENSMUST00000040135 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
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Usp49Q6P9L4 Gm5941-201ENSMUST00000096371 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Bglap2-201ENSMUST00000098956 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Olfr1305-201ENSMUST00000099608 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
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Usp49Q6P9L4 Aox1-201ENSMUST00000001027 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Sytl5-201ENSMUST00000067529 2301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Cnr1-202ENSMUST00000084736 5761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
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Usp49Q6P9L4 Trappc8-201ENSMUST00000025177 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Usp17la-201ENSMUST00000067695 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Olfr701-202ENSMUST00000166880 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Vmn2r55-201ENSMUST00000167771 1407 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Gimd1-203ENSMUST00000212594 1432 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Atp2b4-207ENSMUST00000165602 8101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Birc6-223ENSMUST00000183224 14562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Gm1965-202ENSMUST00000161362 2405 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
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Usp49Q6P9L4 Gm29071-201ENSMUST00000185729 1488 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
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Usp49Q6P9L4 Gm28663-201ENSMUST00000186567 1498 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Gm28470-201ENSMUST00000186912 1498 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Gm28971-201ENSMUST00000187506 1498 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
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Usp49Q6P9L4 Gm28332-203ENSMUST00000191389 1498 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Gm37346-201ENSMUST00000191665 1498 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Gm37454-202ENSMUST00000193918 1498 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Gm38371-202ENSMUST00000193996 1498 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Gm37434-203ENSMUST00000194239 1498 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Gm37840-202ENSMUST00000194805 1498 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Gm37687-203ENSMUST00000195020 1498 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Gm37071-203ENSMUST00000195814 1498 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Gm44286-201ENSMUST00000204098 1487 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Trps1-201ENSMUST00000077935 4436 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Coro2a-203ENSMUST00000107757 4124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Vmn1r86-204ENSMUST00000227700 5487 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Cpsf6-201ENSMUST00000069168 6526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Med12l-204ENSMUST00000164225 10264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Olfr531-204ENSMUST00000217167 3874 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Lilra6-204ENSMUST00000206077 2281 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Tcf7l2-213ENSMUST00000111662 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Spag9-203ENSMUST00000075695 6910 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Gm15621-201ENSMUST00000119162 364 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Gm15007-201ENSMUST00000119982 710 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Rps13-ps6-201ENSMUST00000120038 428 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Vamp7-ps-201ENSMUST00000120334 655 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Gm12804-201ENSMUST00000121030 999 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
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