Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Olfr1342-201ENSMUST00000060562 1002 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxa13Q62424 Fpr2-201ENSMUST00000064068 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxa13Q62424 Sox6-201ENSMUST00000072804 8227 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxa13Q62424 Gm45949-201ENSMUST00000221550 1895 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxa13Q62424 Acox1-202ENSMUST00000072948 3743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxa13Q62424 Olfr1259-202ENSMUST00000214846 4325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxa13Q62424 Gm30329-201ENSMUST00000211572 3077 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxa13Q62424 Trim43c-202ENSMUST00000186363 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxa13Q62424 Enpep-201ENSMUST00000029658 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxa13Q62424 AC129308.2-203ENSMUST00000224109 2385 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxa13Q62424 Rgsl1-203ENSMUST00000141249 1752 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxa13Q62424 Zcchc18-201ENSMUST00000033804 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxa13Q62424 Scaper-202ENSMUST00000214747 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxa13Q62424 Odf2l-203ENSMUST00000098539 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxa13Q62424 Slc17a8-201ENSMUST00000020102 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxa13Q62424 Olfr325-202ENSMUST00000203418 1649 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxa13Q62424 Synj2-204ENSMUST00000115785 3778 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxa13Q62424 Nlrp3-202ENSMUST00000101148 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxa13Q62424 Cyp4a14-201ENSMUST00000030487 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxa13Q62424 Gm37420-201ENSMUST00000195332 2912 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxa13Q62424 Nsun4-202ENSMUST00000030475 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxa13Q62424 Zkscan1-202ENSMUST00000066617 8042 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxa13Q62424 Myh8-202ENSMUST00000108685 2306 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxa13Q62424 Gm13769-202ENSMUST00000214797 2340 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxa13Q62424 Apobec1-202ENSMUST00000112586 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxa13Q62424 Piwil2-201ENSMUST00000048129 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxa13Q62424 Slc22a6-201ENSMUST00000010250 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxa13Q62424 9330158H04Rik-206ENSMUST00000161161 3103 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxa13Q62424 Tdrkh-207ENSMUST00000197901 2652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxa13Q62424 Gm28667-201ENSMUST00000189873 2171 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxa13Q62424 2810021J22Rik-201ENSMUST00000073924 3866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxa13Q62424 Gm22267-201ENSMUST00000104008 131 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxa13Q62424 Gm12101-201ENSMUST00000121590 390 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxa13Q62424 Gm12670-201ENSMUST00000123606 576 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxa13Q62424 Gm13598-201ENSMUST00000147939 625 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxa13Q62424 Ttc39aos1-201ENSMUST00000150239 796 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxa13Q62424 Gm20615-201ENSMUST00000177503 705 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxa13Q62424 Gtpbp4-ps3-201ENSMUST00000184093 136 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxa13Q62424 Gm27299-201ENSMUST00000184593 103 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxa13Q62424 6030442E23Rik-201ENSMUST00000186618 642 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxa13Q62424 Nanog-ps2-201ENSMUST00000190988 529 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxa13Q62424 Gm37614-201ENSMUST00000195645 210 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxa13Q62424 Gm6077-201ENSMUST00000196008 499 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxa13Q62424 Gm40330-201ENSMUST00000196498 669 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxa13Q62424 Gm43576-201ENSMUST00000197937 871 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxa13Q62424 Gm43091-201ENSMUST00000198157 423 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxa13Q62424 Gm44332-201ENSMUST00000203712 433 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxa13Q62424 Hddc3-209ENSMUST00000206480 454 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxa13Q62424 Gm44837-201ENSMUST00000206863 717 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxa13Q62424 Olfr1439-ps1-201ENSMUST00000207089 824 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxa13Q62424 Olfr1295-201ENSMUST00000207283 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxa13Q62424 Olfr1315-ps1-201ENSMUST00000207542 1230 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxa13Q62424 Gm7769-201ENSMUST00000212900 933 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxa13Q62424 AC126043.1-201ENSMUST00000221304 1141 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxa13Q62424 Gm21994-201ENSMUST00000063463 990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxa13Q62424 Tas2r134-201ENSMUST00000070028 898 ntAPPRIS P1 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxa13Q62424 CT009757.4-201ENSMUST00000221520 2541 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxa13Q62424 Gm15638-203ENSMUST00000154775 2945 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxa13Q62424 Meis2-205ENSMUST00000110907 3718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxa13Q62424 Hspg2-201ENSMUST00000030547 14187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxa13Q62424 Zfp266-201ENSMUST00000068296 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxa13Q62424 Itih4-201ENSMUST00000006703 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxa13Q62424 Itih4-202ENSMUST00000078490 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxa13Q62424 Scaper-201ENSMUST00000037408 5158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxa13Q62424 Cd59a-203ENSMUST00000168176 1806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxa13Q62424 Uba1y-ps2-201ENSMUST00000190871 2544 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxa13Q62424 T2-201ENSMUST00000163578 1755 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxa13Q62424 AC158115.1-201ENSMUST00000222830 3182 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxa13Q62424 Slco1c1-201ENSMUST00000032362 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxa13Q62424 Bdnf-204ENSMUST00000111044 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxa13Q62424 Olfr462-203ENSMUST00000213928 5598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxa13Q62424 Gm12187-201ENSMUST00000119584 1375 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxa13Q62424 D830026I12Rik-203ENSMUST00000151170 1607 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxa13Q62424 Dock9-208ENSMUST00000212376 8107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxa13Q62424 Stc1-201ENSMUST00000014957 4197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxa13Q62424 Gm10184-201ENSMUST00000086423 1939 ntAPPRIS P1 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxa13Q62424 Igkv6-20-201ENSMUST00000103388 375 ntAPPRIS P1 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxa13Q62424 Ighv14-4-201ENSMUST00000103475 333 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxa13Q62424 Gm14579-201ENSMUST00000117068 283 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxa13Q62424 Gm12653-201ENSMUST00000117778 561 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxa13Q62424 Gm15103-201ENSMUST00000119893 871 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxa13Q62424 Gm14840-201ENSMUST00000122135 594 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxa13Q62424 Gm15164-201ENSMUST00000122203 271 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxa13Q62424 2310081O03Rik-201ENSMUST00000128591 759 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxa13Q62424 1700047F07Rik-201ENSMUST00000140321 543 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxa13Q62424 Gm15902-201ENSMUST00000146949 469 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxa13Q62424 Gm25435-201ENSMUST00000158277 267 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxa13Q62424 Olfr772-201ENSMUST00000169800 1004 ntAPPRIS P1 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxa13Q62424 Gm18808-201ENSMUST00000173316 462 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxa13Q62424 Platr5-202ENSMUST00000181016 479 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxa13Q62424 Gm21614-201ENSMUST00000183260 1005 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxa13Q62424 Mrps36-ps3-201ENSMUST00000183899 305 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxa13Q62424 1810026B05Rik-201ENSMUST00000183916 432 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxa13Q62424 Gm27427-201ENSMUST00000185134 193 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxa13Q62424 Gm29357-201ENSMUST00000186877 698 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxa13Q62424 Gm20822-202ENSMUST00000188422 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxa13Q62424 Gm3489-201ENSMUST00000190083 528 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxa13Q62424 Gm20828-202ENSMUST00000190516 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxa13Q62424 Gm28086-201ENSMUST00000191586 317 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxa13Q62424 Gm7270-201ENSMUST00000195818 1128 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms