Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Sytl2-203ENSMUST00000107211 3790 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Sytl2-207ENSMUST00000190837 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Cenpf-204ENSMUST00000171929 11130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Gm20716-201ENSMUST00000138667 5288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Tlr11-201ENSMUST00000063570 2993 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Trim12a-203ENSMUST00000106839 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Gm11590-201ENSMUST00000118999 1455 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Fbxw19-201ENSMUST00000076617 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Zc3h11a-204ENSMUST00000191896 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Gm22267-201ENSMUST00000104008 131 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Rpl22-ps1-201ENSMUST00000118652 386 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Gm14796-201ENSMUST00000121216 959 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Gm12181-201ENSMUST00000121448 531 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 4930405D11Rik-203ENSMUST00000142521 645 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Gm12860-201ENSMUST00000148457 957 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Gm6803-201ENSMUST00000178301 435 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Gm4956-202ENSMUST00000178869 672 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Gm2075-201ENSMUST00000180285 435 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Gm8183-201ENSMUST00000183134 980 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Gm28846-201ENSMUST00000189161 368 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Gm37065-201ENSMUST00000191636 444 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Gm18752-201ENSMUST00000192876 608 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Gm37436-201ENSMUST00000193842 1085 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Gm43538-201ENSMUST00000200416 849 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Gm45626-201ENSMUST00000210093 361 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Gm45267-201ENSMUST00000211028 522 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 AC153729.3-201ENSMUST00000213319 781 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Gm7413-201ENSMUST00000219498 462 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 AC153821.2-201ENSMUST00000220253 468 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Gm2022-201ENSMUST00000220585 435 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 AC172989.1-201ENSMUST00000226387 513 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 AC135086.1-201ENSMUST00000228621 817 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Vmn1r74-201ENSMUST00000050416 915 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 1700014D04Rik-201ENSMUST00000055343 795 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 AW822073-201ENSMUST00000075305 555 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Gm22053-201ENSMUST00000083394 200 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Olfr275-201ENSMUST00000095085 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Olfr1312-201ENSMUST00000099600 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 AC154597.1-201ENSMUST00000224095 2713 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Sntg1-210ENSMUST00000191683 4510 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Zwint-202ENSMUST00000105431 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Vmn1r59-201ENSMUST00000074132 1439 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Impg1-202ENSMUST00000113250 2965 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Gm37169-201ENSMUST00000195599 4161 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Cntn1-202ENSMUST00000068378 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 AC107742.1-201ENSMUST00000227769 1390 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Gm20043-201ENSMUST00000222267 2565 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Gm43251-201ENSMUST00000198339 2712 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Rc3h2-201ENSMUST00000100143 8799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Gm43789-201ENSMUST00000199275 2472 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Zfp143-205ENSMUST00000211798 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Gm28175-202ENSMUST00000209336 1477 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Adgrl3-207ENSMUST00000118078 4871 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 AC124414.1-201ENSMUST00000218033 2946 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Olfr961-202ENSMUST00000219295 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Gm8281-201ENSMUST00000100893 612 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Gm26340-201ENSMUST00000102365 99 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Gmfg-203ENSMUST00000108292 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Plscr2-202ENSMUST00000113044 1239 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Crisp4-202ENSMUST00000115340 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Gm15311-201ENSMUST00000119682 282 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Gm15305-201ENSMUST00000120354 288 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Gm13357-201ENSMUST00000120528 537 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Gm15158-201ENSMUST00000120577 570 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Gm15787-203ENSMUST00000130892 1250 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Gm14092-201ENSMUST00000136794 617 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 4933401B06Rik-202ENSMUST00000142024 1219 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Gm12440-201ENSMUST00000155224 1070 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Gm8237-202ENSMUST00000178594 447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Gm10428-201ENSMUST00000178750 399 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Gm29470-201ENSMUST00000188007 696 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Gm45276-201ENSMUST00000209549 1086 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 AC124601.1-201ENSMUST00000220531 135 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Gm5928-201ENSMUST00000221839 466 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 AC125405.2-201ENSMUST00000227862 383 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Tipin-201ENSMUST00000034964 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Fxyd4-201ENSMUST00000005114 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Ccdc54-201ENSMUST00000062439 1296 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 AC154806.2-201ENSMUST00000227212 2385 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Iars-202ENSMUST00000164260 3789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Ifi207-202ENSMUST00000127730 3145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 5228 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Gm37621-201ENSMUST00000194716 5531 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Mtrr-201ENSMUST00000045827 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Gm13219-203ENSMUST00000154223 1843 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Gm26899-201ENSMUST00000181963 3328 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Vps8-207ENSMUST00000122235 2521 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 A4gnt-201ENSMUST00000042553 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Rab11fip2-203ENSMUST00000171986 5363 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Cd244-201ENSMUST00000004829 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 2610021A01Rik-201ENSMUST00000163475 4004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 AC144772.2-201ENSMUST00000228830 2859 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 BC051142-203ENSMUST00000114175 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Gm9049-201ENSMUST00000178998 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Gm9030-201ENSMUST00000218405 2410 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Gm32717-201ENSMUST00000219147 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Gm9029-201ENSMUST00000219232 2410 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Gm32802-201ENSMUST00000219565 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Gm9045-201ENSMUST00000219760 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 AC133207.1-201ENSMUST00000218960 1431 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
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