Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Alkbh8-202ENSMUST00000165105 2256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Olfr191-202ENSMUST00000215647 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 9830132P13Rik-201ENSMUST00000198240 4187 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Gm25396-201ENSMUST00000103981 133 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Gm26146-201ENSMUST00000104478 185 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Uros-202ENSMUST00000106144 1045 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Rps12-ps10-201ENSMUST00000117447 399 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Gm15739-201ENSMUST00000118049 872 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Gm14631-201ENSMUST00000119067 594 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Gm11263-201ENSMUST00000121853 749 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Gm12027-201ENSMUST00000146531 949 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Casp12-204ENSMUST00000151332 1065 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Mcpt2-201ENSMUST00000015576 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Gm23276-201ENSMUST00000157913 138 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Gm7420-201ENSMUST00000162836 842 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Gm7244-201ENSMUST00000164658 455 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Gm21182-201ENSMUST00000178899 794 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Gm17660-202ENSMUST00000178967 337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Gm28952-201ENSMUST00000189285 681 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Gm37293-201ENSMUST00000191658 295 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Gm43905-201ENSMUST00000204516 204 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Gm44258-201ENSMUST00000204925 301 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Gm44892-201ENSMUST00000208595 488 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Gm39158-201ENSMUST00000210178 856 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Gm45497-201ENSMUST00000211701 740 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Gm6581-201ENSMUST00000214545 260 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 AC122539.1-201ENSMUST00000219925 329 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 1700040E09Rik-201ENSMUST00000222440 606 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 AC122295.1-201ENSMUST00000223476 388 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 AV026068-219ENSMUST00000224148 933 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 AC121997.2-202ENSMUST00000227158 939 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 AC131997.2-201ENSMUST00000227452 362 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Olfr683-201ENSMUST00000061284 960 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Olfr644-201ENSMUST00000077417 1071 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Pabpc4l-201ENSMUST00000166505 5218 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Gm34921-201ENSMUST00000219528 1406 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 9230106D20Rik-201ENSMUST00000052806 1406 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Sorbs2-209ENSMUST00000132139 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Zfp729a-201ENSMUST00000012314 9455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Gm3752-201ENSMUST00000164366 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Scd4-201ENSMUST00000058856 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Gm17690-201ENSMUST00000180958 3467 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 C3ar1-201ENSMUST00000042081 4305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Gm12763-201ENSMUST00000151344 1939 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 4933402E13Rik-202ENSMUST00000178085 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Olfr132-202ENSMUST00000216804 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Svs2-202ENSMUST00000109374 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Ubl7-209ENSMUST00000216925 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Gm40778-201ENSMUST00000217825 1344 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Ceacam1-201ENSMUST00000098666 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Zfp2-201ENSMUST00000109128 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Vps50-201ENSMUST00000001412 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Golga3-202ENSMUST00000112512 8132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Birc6-204ENSMUST00000182133 14604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Birc6-215ENSMUST00000182597 14649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Birc6-220ENSMUST00000182944 14610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 AC163354.1-204ENSMUST00000222226 2033 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 A2m-201ENSMUST00000032203 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Wdr37-202ENSMUST00000054251 4626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Gm45290-201ENSMUST00000211177 3890 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Cep85l-201ENSMUST00000095691 2560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Sgms2-201ENSMUST00000090246 5801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Gm14180-201ENSMUST00000105066 78 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Skint8-201ENSMUST00000106572 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Gm15203-201ENSMUST00000117668 455 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Halr1-201ENSMUST00000125374 391 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Gm2709-201ENSMUST00000142979 350 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Erich2os-201ENSMUST00000150702 608 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Gm3159-201ENSMUST00000164038 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Gm21999-201ENSMUST00000165985 387 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Gm3127-201ENSMUST00000167839 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Gm3208-201ENSMUST00000168281 427 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Gm20461-201ENSMUST00000174600 305 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Obox4-ps31-201ENSMUST00000177210 1137 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Gm20690-201ENSMUST00000177341 315 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Gm26801-201ENSMUST00000180591 1219 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Rd3l-204ENSMUST00000190536 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 4930403P22Rik-201ENSMUST00000192234 713 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Gm44623-201ENSMUST00000207934 434 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Olfr1245-201ENSMUST00000214870 1062 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 AC153971.1-201ENSMUST00000215097 3811 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Gm19217-201ENSMUST00000218238 328 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 AC105167.1-201ENSMUST00000219966 253 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Tbca-204ENSMUST00000220825 497 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Gm18960-201ENSMUST00000222962 713 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Gm21762-202ENSMUST00000225881 830 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Cwc15-201ENSMUST00000004200 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Tas2r144-201ENSMUST00000063489 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Gm13769-201ENSMUST00000077123 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Rnase6-201ENSMUST00000095923 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Olfr716-201ENSMUST00000098137 1104 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Olfr1275-201ENSMUST00000099620 1020 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Zwint-202ENSMUST00000105431 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Gm2245-201ENSMUST00000160698 3376 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Gm40518-202ENSMUST00000214538 4080 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Nyap2-204ENSMUST00000123720 3471 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 A530046M15Rik-201ENSMUST00000221778 1538 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Olfr657-202ENSMUST00000213297 1948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Lgi1-206ENSMUST00000198045 1483 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Adgb-204ENSMUST00000172530 5215 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms