Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Tslrn1-201ENSMUST00000129479 747 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
VdrP48281 Gm16725-201ENSMUST00000138744 1253 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
VdrP48281 Cul1-203ENSMUST00000143941 530 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
VdrP48281 Gm23822-201ENSMUST00000158739 128 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
VdrP48281 Obox4-ps38-201ENSMUST00000175961 724 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
VdrP48281 4930533D04Rik-201ENSMUST00000185478 788 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
VdrP48281 Gm28100-201ENSMUST00000186560 582 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
VdrP48281 Gm29460-201ENSMUST00000188607 714 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
VdrP48281 Gm28788-201ENSMUST00000189717 375 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
VdrP48281 Gm29558-201ENSMUST00000190134 375 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
VdrP48281 Gm6236-201ENSMUST00000193785 1009 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
VdrP48281 Gm43582-201ENSMUST00000196149 343 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
VdrP48281 Gm7631-201ENSMUST00000196935 1100 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
VdrP48281 Gm17977-201ENSMUST00000198743 574 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
VdrP48281 Gm8556-201ENSMUST00000210437 664 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
VdrP48281 Gm32975-201ENSMUST00000211651 584 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
VdrP48281 Gm11427-204ENSMUST00000216233 999 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
VdrP48281 Olfr1139-ps1-201ENSMUST00000217634 168 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
VdrP48281 AC107663.2-201ENSMUST00000225534 1234 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
VdrP48281 CT009711.4-201ENSMUST00000225685 198 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
VdrP48281 AC147096.1-201ENSMUST00000227648 352 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
VdrP48281 AC121114.1-201ENSMUST00000228522 570 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
VdrP48281 Olfr491-201ENSMUST00000053179 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.75□□□□□ -1.17
VdrP48281 Gm5590-201ENSMUST00000059110 345 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
VdrP48281 Gm23623-201ENSMUST00000082461 107 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
VdrP48281 Gm24144-201ENSMUST00000082632 111 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
VdrP48281 Gm25582-201ENSMUST00000083412 110 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
VdrP48281 Gm13301-201ENSMUST00000121728 2446 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
VdrP48281 Olfr934-203ENSMUST00000216823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
VdrP48281 Carf-206ENSMUST00000180952 2157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
VdrP48281 Pabpc4l-202ENSMUST00000192793 5252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
VdrP48281 Wdr76-204ENSMUST00000110603 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
VdrP48281 2610021A01Rik-201ENSMUST00000163475 4004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
VdrP48281 AC165273.1-201ENSMUST00000222780 2452 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
VdrP48281 Apbb2-210ENSMUST00000160870 6526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
VdrP48281 Olfr1388-202ENSMUST00000215226 3034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
VdrP48281 Clasp1-210ENSMUST00000188710 10265 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
VdrP48281 Plch1-203ENSMUST00000084105 6245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
VdrP48281 Olfr726-205ENSMUST00000215278 1324 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
VdrP48281 Trim30c-201ENSMUST00000106828 1716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
VdrP48281 Gm13856-201ENSMUST00000126498 1742 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
VdrP48281 Gm37181-201ENSMUST00000192513 1727 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
VdrP48281 Ppfibp2-201ENSMUST00000040056 3310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
VdrP48281 Polr2b-201ENSMUST00000031167 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
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VdrP48281 Gprasp1-203ENSMUST00000113147 5611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
VdrP48281 4833427F10Rik-201ENSMUST00000172874 1475 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
VdrP48281 Ncr1-201ENSMUST00000006792 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
VdrP48281 Fignl1-202ENSMUST00000109664 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
VdrP48281 Cd247-208ENSMUST00000178336 2807 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
VdrP48281 Ccdc127-201ENSMUST00000022063 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
VdrP48281 Gm39566-201ENSMUST00000210714 3908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
VdrP48281 Atp8b5-204ENSMUST00000107942 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
VdrP48281 Sptssb-201ENSMUST00000051239 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
VdrP48281 Smim15-201ENSMUST00000095458 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
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VdrP48281 Trim43b-202ENSMUST00000189557 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
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VdrP48281 1700113A16Rik-202ENSMUST00000197172 776 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
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VdrP48281 Olfr192-202ENSMUST00000205727 1141 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
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VdrP48281 4930579P08Rik-201ENSMUST00000218193 1227 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
VdrP48281 Gm40418-201ENSMUST00000218806 1013 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
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VdrP48281 RMST_1.1-214ENSMUST00000220389 633 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
VdrP48281 Gm34639-202ENSMUST00000223473 649 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
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VdrP48281 AC129975.2-201ENSMUST00000223705 775 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
VdrP48281 AC137117.3-201ENSMUST00000226265 485 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
VdrP48281 Rpsa-ps2-201ENSMUST00000059546 880 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
VdrP48281 Olfr419-201ENSMUST00000061990 1088 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
VdrP48281 Olfr352-201ENSMUST00000065416 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
VdrP48281 6030452D12Rik-201ENSMUST00000066875 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
VdrP48281 Olfr190-201ENSMUST00000071243 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
VdrP48281 Vmn1r48-201ENSMUST00000073415 909 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
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