Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Zc4h2-202ENSMUST00000119640 2075 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Pds5b-202ENSMUST00000038900 7315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Gm44950-201ENSMUST00000206403 2296 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Gm5524-201ENSMUST00000185409 2002 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Gm9752-201ENSMUST00000048965 2659 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Gm6786-201ENSMUST00000203165 1915 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 AC159264.1-201ENSMUST00000224844 4257 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Vmn2r45-201ENSMUST00000164845 3619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 4930503H13Rik-201ENSMUST00000118320 725 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Gm25374-201ENSMUST00000158158 101 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Gm17366-201ENSMUST00000167629 187 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Gm5225-201ENSMUST00000178572 324 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Rpl31-ps23-201ENSMUST00000180440 388 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Gm9658-201ENSMUST00000182757 1012 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Gm27152-201ENSMUST00000183828 99 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Slamf7-205ENSMUST00000194791 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Gm20223-201ENSMUST00000199932 805 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Gm34066-201ENSMUST00000210156 825 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Olfr809-203ENSMUST00000218237 1100 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 AC154795.1-201ENSMUST00000225611 364 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 AC113125.2-201ENSMUST00000226837 362 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Olfr809-201ENSMUST00000059891 1100 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Tlr11-201ENSMUST00000063570 2993 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Rpl27a-ps2-201ENSMUST00000080234 450 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Gm23456-201ENSMUST00000083335 137 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Nr1h5-203ENSMUST00000196983 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Rad21l-202ENSMUST00000180195 1659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Plch1-213ENSMUST00000177143 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Grip1-208ENSMUST00000138410 3532 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Gm45902-201ENSMUST00000124331 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Gm45807-201ENSMUST00000209142 2874 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Rps15a-207ENSMUST00000172457 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Esrrg-202ENSMUST00000110938 5373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 Mfap1a-201ENSMUST00000089926 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 Gm26656-201ENSMUST00000181825 2972 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 Armcx3-201ENSMUST00000081834 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 Gm45537-201ENSMUST00000211539 2708 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 AC164623.1-201ENSMUST00000217947 2709 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 Gm42994-201ENSMUST00000195964 2549 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 Abcb11-204ENSMUST00000180142 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 Mmp13-201ENSMUST00000015394 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 Ttf1-201ENSMUST00000100237 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 Gucy1b3-201ENSMUST00000029635 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 4930547M16Rik-201ENSMUST00000181590 2400 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 Map1b-201ENSMUST00000064762 11808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 Sgip1-205ENSMUST00000106882 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 Sox6-205ENSMUST00000169129 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 Mlh3-201ENSMUST00000019378 5463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 Gm15781-201ENSMUST00000120216 323 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 Gm14038-201ENSMUST00000121500 807 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 AI646519-201ENSMUST00000140987 351 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 Gm13598-201ENSMUST00000147939 625 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 Rd3l-201ENSMUST00000170525 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 Gm7008-203ENSMUST00000171356 476 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 Gm20615-201ENSMUST00000177503 705 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 Eif4a2-224ENSMUST00000187168 1238 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
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Hoxd10P28359 1700093K21Rik-201ENSMUST00000020527 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 4921513I08Rik-201ENSMUST00000206993 866 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 Gm39078-201ENSMUST00000207973 704 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 Gm17950-201ENSMUST00000214617 646 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
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Hoxd10P28359 Zfp780b-203ENSMUST00000205874 1907 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 CT025675.1-201ENSMUST00000228171 1567 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 Olfr645-201ENSMUST00000057104 3677 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 Clasp1-210ENSMUST00000188710 10265 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 Tmem167b-202ENSMUST00000106622 2752 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 Tgfbr1-203ENSMUST00000107725 1713 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 Gprasp1-206ENSMUST00000166554 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 AC117608.1-201ENSMUST00000225500 3418 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 Synb-201ENSMUST00000059362 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 Olfr1426-204ENSMUST00000219005 2507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 A330076C08Rik-201ENSMUST00000220765 5020 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 Slc7a2-204ENSMUST00000118432 3681 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 Ubxn7-201ENSMUST00000115151 10318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 Nrcam-201ENSMUST00000020939 4469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 Adamts12-201ENSMUST00000061318 8579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 4930480E11Rik-201ENSMUST00000035626 1486 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 Mybpc1-202ENSMUST00000121629 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 Rnf213-203ENSMUST00000172235 2422 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 Bpifc-201ENSMUST00000061699 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 Gm12169-201ENSMUST00000109228 1065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 Gm13489-201ENSMUST00000121234 971 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 Gm3810-201ENSMUST00000122413 476 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 4933405E24Rik-201ENSMUST00000131019 1078 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 Il4-203ENSMUST00000140684 530 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 4930405D11Rik-203ENSMUST00000142521 645 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 Mir3097-201ENSMUST00000175356 67 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 Raet1e-202ENSMUST00000178026 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 D13Ertd608e-201ENSMUST00000179131 417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Hoxd10P28359 Olfr1025-ps1-201ENSMUST00000188749 921 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.5 ms