Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 AC153548.1-201ENSMUST00000219283 2661 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Fblim1-201ENSMUST00000006381 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Pbdc1-201ENSMUST00000033577 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Pcdh15-236ENSMUST00000193174 5936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Eif4a2-202ENSMUST00000077605 2708 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Mtfr1-202ENSMUST00000117529 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Anapc15-210ENSMUST00000144207 3103 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Slc6a19-201ENSMUST00000022048 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 4932414J04Rik-201ENSMUST00000152483 3059 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm7073-203ENSMUST00000190178 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Psg20-201ENSMUST00000076677 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Ehhadh-201ENSMUST00000023559 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Galnt7-202ENSMUST00000110316 3413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Pecam1-201ENSMUST00000068021 2977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Mas1-206ENSMUST00000162333 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Zfp68-202ENSMUST00000085852 3318 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Olfr75-ps1-202ENSMUST00000141956 2500 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Pfkfb3-214ENSMUST00000179584 4756 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Phactr2-204ENSMUST00000105546 2808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm42837-201ENSMUST00000197071 2829 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Slc12a3-205ENSMUST00000212134 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Jakmip2-201ENSMUST00000082254 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Naip1-204ENSMUST00000222155 5361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm37611-201ENSMUST00000195250 2028 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Entpd5-201ENSMUST00000021662 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Igkv8-28-201ENSMUST00000103380 305 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm13030-201ENSMUST00000105805 655 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm15578-201ENSMUST00000117320 475 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm14985-201ENSMUST00000118693 786 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Kxd1-203ENSMUST00000118850 992 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm12433-201ENSMUST00000119659 255 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm13711-201ENSMUST00000119708 453 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm13815-201ENSMUST00000119963 412 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm15049-201ENSMUST00000120474 463 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm12313-201ENSMUST00000121347 421 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 St8sia3os-201ENSMUST00000123473 652 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm26402-201ENSMUST00000158499 113 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Ggact-204ENSMUST00000161322 524 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm5611-201ENSMUST00000164523 852 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Spanxn4-201ENSMUST00000172433 424 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm24576-201ENSMUST00000175508 248 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm5973-201ENSMUST00000178542 496 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm5974-201ENSMUST00000181607 986 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm5839-201ENSMUST00000182835 1007 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm8167-201ENSMUST00000183320 958 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm21095-202ENSMUST00000185776 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
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Hoxd9P28357 Gm29195-201ENSMUST00000189038 379 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm29387-201ENSMUST00000189074 623 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm28728-201ENSMUST00000189087 405 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 1700016L21Rik-202ENSMUST00000189139 629 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 AV026068-210ENSMUST00000189169 877 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Mrgpra14-201ENSMUST00000189782 913 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm28586-201ENSMUST00000189857 456 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Oaz3-201ENSMUST00000191506 732 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm37892-201ENSMUST00000192018 437 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm4856-201ENSMUST00000192696 1091 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 4933403L11Rik-201ENSMUST00000193857 1121 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 A230098N10Rik-202ENSMUST00000200055 356 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Olfr1389-201ENSMUST00000203369 1073 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm44665-201ENSMUST00000205381 251 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm18207-201ENSMUST00000205486 526 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 A330076H08Rik-203ENSMUST00000208822 1164 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Olfr209-204ENSMUST00000213779 564 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 AC159472.1-201ENSMUST00000218178 463 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 AC155241.1-201ENSMUST00000222709 415 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 AC124687.3-201ENSMUST00000222865 875 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 AV026068-219ENSMUST00000224148 933 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 AV026068-220ENSMUST00000224153 1147 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 AC154727.1-201ENSMUST00000226537 499 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 AC131068.1-201ENSMUST00000226891 482 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 CT025548.1-201ENSMUST00000227459 257 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 AC107452.2-201ENSMUST00000228415 363 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 AC133283.1-201ENSMUST00000228443 859 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Vmn1r25-202ENSMUST00000228585 909 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Krtap3-1-201ENSMUST00000055502 604 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Olfr430-201ENSMUST00000055873 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Olfr299-201ENSMUST00000057734 993 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Olfr530-201ENSMUST00000074177 1080 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm16391-201ENSMUST00000086601 447 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Olfr1254-201ENSMUST00000099764 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Synj2-206ENSMUST00000115787 4013 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Slc38a6-202ENSMUST00000101313 1546 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm29311-202ENSMUST00000189721 1532 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 A530053G22Rik-201ENSMUST00000060147 1526 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 B230354K17Rik-201ENSMUST00000181149 4897 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Vmn1r5-203ENSMUST00000228276 3188 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Olfr6-201ENSMUST00000040983 6834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Slc26a1-201ENSMUST00000051757 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm44249-201ENSMUST00000204538 1805 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Met-201ENSMUST00000080469 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm35392-201ENSMUST00000209934 2121 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm2163-201ENSMUST00000179734 2723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Myh10-202ENSMUST00000092984 7759 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Armcx3-201ENSMUST00000081834 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Wdr72-201ENSMUST00000055879 5196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Ypel2-201ENSMUST00000018571 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Mlip-215ENSMUST00000185144 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Hdac9-204ENSMUST00000209750 3204 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
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