Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Gm43099-201ENSMUST00000198943 5241 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
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Gjb1P28230 Gm7058-201ENSMUST00000119209 902 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Gjb1P28230 Dnah2os-201ENSMUST00000124108 859 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Gjb1P28230 4930448H16Rik-201ENSMUST00000159838 580 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Gjb1P28230 Vmn2r-ps37-201ENSMUST00000174682 1044 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Gjb1P28230 D630011A20Rik-201ENSMUST00000180858 500 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
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Gjb1P28230 Gm18849-201ENSMUST00000189861 560 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Gjb1P28230 Gm20770-201ENSMUST00000193474 694 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Gjb1P28230 4930512P04Rik-201ENSMUST00000197000 424 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Gjb1P28230 Olfr1460-ps1-201ENSMUST00000208975 899 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Gjb1P28230 Stx3-206ENSMUST00000211047 870 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Gjb1P28230 4930434F21Rik-201ENSMUST00000214381 742 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Gjb1P28230 Gm33728-201ENSMUST00000217285 546 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Gjb1P28230 Gm4510-201ENSMUST00000218265 427 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Gjb1P28230 Gm9800-201ENSMUST00000052615 336 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Gjb1P28230 Gm22865-201ENSMUST00000083949 214 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Gjb1P28230 Gm28687-201ENSMUST00000187203 1494 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Gjb1P28230 Gm29373-201ENSMUST00000190660 1494 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Gjb1P28230 Tarm1-202ENSMUST00000203020 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Gjb1P28230 Pter-203ENSMUST00000134794 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Gjb1P28230 Psg20-202ENSMUST00000108482 1871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Gjb1P28230 Inpp5d-208ENSMUST00000167032 4125 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Gjb1P28230 Gm45902-201ENSMUST00000124331 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Gjb1P28230 Gm33027-201ENSMUST00000206093 4664 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Gjb1P28230 AC134577.3-201ENSMUST00000226490 3000 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Gjb1P28230 Gpatch11-201ENSMUST00000170759 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Gm45645-201ENSMUST00000211470 1963 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Lilra6-202ENSMUST00000090689 1977 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Fam205a1-201ENSMUST00000107979 4146 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Erc2-208ENSMUST00000210924 4871 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Fmn1-209ENSMUST00000161731 4262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Gm31410-201ENSMUST00000217302 4048 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Frrs1-202ENSMUST00000195905 6823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Gm19024-201ENSMUST00000194681 1319 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Carf-209ENSMUST00000187978 5463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Cep170-215ENSMUST00000195717 6967 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 CT010470.1-201ENSMUST00000225364 1876 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Lrrc40-201ENSMUST00000072080 4142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Eif4e2-202ENSMUST00000076362 3394 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Gm13301-201ENSMUST00000121728 2446 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Gm7361-201ENSMUST00000074148 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Gm21781-201ENSMUST00000178920 4838 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
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Gjb1P28230 Gm15959-201ENSMUST00000121724 368 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Gm13598-201ENSMUST00000147939 625 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Fam229b-209ENSMUST00000149949 736 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Mir1960-201ENSMUST00000157488 78 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Gm22210-201ENSMUST00000158101 144 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Gm4141-201ENSMUST00000174364 921 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Gm4201-201ENSMUST00000174775 921 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Gm8480-201ENSMUST00000190350 698 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Gm10416-201ENSMUST00000197379 645 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Gm43725-201ENSMUST00000200122 369 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Gm32005-201ENSMUST00000212446 959 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 AC121264.1-201ENSMUST00000214412 269 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
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Gjb1P28230 Gm6056-201ENSMUST00000221253 488 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 CT025523.1-201ENSMUST00000228318 694 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Olfr1509-201ENSMUST00000045066 1010 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
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Gjb1P28230 Gm15907-201ENSMUST00000134284 2309 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Efhb-201ENSMUST00000024725 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
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Gjb1P28230 Ctsr-201ENSMUST00000021889 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
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Gjb1P28230 Kpna2-ps-201ENSMUST00000120025 1569 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Adgrl3-207ENSMUST00000118078 4871 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Olfr12-202ENSMUST00000213247 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Fam60a-209ENSMUST00000203164 2442 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Nt5dc1-203ENSMUST00000105512 2727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Gm42577-201ENSMUST00000201367 3211 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Nlrp3-202ENSMUST00000101148 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Zbtb6-201ENSMUST00000053098 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Mtrr-201ENSMUST00000045827 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Hepacam2-201ENSMUST00000049985 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 AC158388.2-201ENSMUST00000223665 1314 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 AC139750.1-201ENSMUST00000223962 1300 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Tbc1d5-201ENSMUST00000024717 5435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Zbtb18-212ENSMUST00000195612 3790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Oas2-201ENSMUST00000053909 3869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Scd1-201ENSMUST00000041331 4836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 4931406P16Rik-210ENSMUST00000206399 4158 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Skil-202ENSMUST00000117728 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Wdr37-202ENSMUST00000054251 4626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Zfp616-203ENSMUST00000116546 531 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Mir466j-201ENSMUST00000116876 122 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Gm15149-201ENSMUST00000119370 360 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 Gm25178-201ENSMUST00000122633 325 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 St8sia3os-203ENSMUST00000127716 667 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gjb1P28230 4930412B13Rik-201ENSMUST00000149239 1276 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
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