Protein–RNA interactions for Protein: P0C1T1

Hoxb2, Homeobox protein Hox-B2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb2P0C1T1 4930453H23Rik-201ENSMUST00000125569 1719 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Gm14226-201ENSMUST00000130870 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 4930548K13Rik-201ENSMUST00000154459 561 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Gm10680-201ENSMUST00000156612 702 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Gm23228-201ENSMUST00000157296 270 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Gm23533-201ENSMUST00000157540 245 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Gm23259-201ENSMUST00000158318 303 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Wnk1-218ENSMUST00000161512 1426 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Gm21293-201ENSMUST00000170919 864 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Gm20430-201ENSMUST00000172474 207 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Gm24080-201ENSMUST00000175178 232 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Gm15251-201ENSMUST00000177947 883 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Pkd1l1-203ENSMUST00000178195 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Gm5327-201ENSMUST00000182864 1009 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Mir8099-2-201ENSMUST00000183568 127 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Nxf1-205ENSMUST00000183939 1017 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Mir8099-1-201ENSMUST00000184238 127 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Serpina3a-203ENSMUST00000185595 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Gm28548-201ENSMUST00000191599 409 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Gm18296-201ENSMUST00000192475 783 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Gm38303-201ENSMUST00000192603 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Gm38063-201ENSMUST00000193990 342 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Gm37735-201ENSMUST00000193995 1406 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Gm43096-201ENSMUST00000196173 421 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Gm43608-201ENSMUST00000197703 687 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Tmigd3-204ENSMUST00000198080 832 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Gm43080-201ENSMUST00000199006 2643 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Gm7542-201ENSMUST00000201140 777 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Gm42963-201ENSMUST00000202943 1217 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Gm44245-201ENSMUST00000204304 232 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 A730082K24Rik-202ENSMUST00000205795 658 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Snhg1-208ENSMUST00000206029 408 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 A930030B08Rik-201ENSMUST00000207625 3965 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 A330076H08Rik-203ENSMUST00000208822 1164 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Gm45145-203ENSMUST00000208872 958 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Gm4247-201ENSMUST00000211441 1042 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Gm39336-201ENSMUST00000214933 260 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Prl2c2-203ENSMUST00000221612 596 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 AC164117.2-201ENSMUST00000222090 327 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 AC099934.5-201ENSMUST00000222699 945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Gm2544-201ENSMUST00000222702 756 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Ints4-201ENSMUST00000026126 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Hepacam2-201ENSMUST00000049985 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Olfr732-201ENSMUST00000071208 1044 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Defb4-201ENSMUST00000081017 454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Gm25404-201ENSMUST00000082970 107 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Gm24696-201ENSMUST00000083878 134 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Krtap31-1-201ENSMUST00000093935 973 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Bcl2a1a-201ENSMUST00000098485 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Nyap2-202ENSMUST00000113494 4540 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Cpb1-201ENSMUST00000011607 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Mecp2-205ENSMUST00000170481 10175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Osbpl6-203ENSMUST00000111930 3853 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Olfr799-203ENSMUST00000214182 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Gm4767-202ENSMUST00000188096 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Gm43059-201ENSMUST00000202437 1388 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Nat2-201ENSMUST00000093470 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Antxrl-201ENSMUST00000058725 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Trpv5-201ENSMUST00000031901 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Stab2-201ENSMUST00000035288 8228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Cep170-201ENSMUST00000057037 6930 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Ccnyl1-201ENSMUST00000094898 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Glce-201ENSMUST00000034785 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Gm6356-201ENSMUST00000166618 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Slc13a1-201ENSMUST00000031713 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Olfr122-202ENSMUST00000172582 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Ephb2-202ENSMUST00000105845 10902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Net1-202ENSMUST00000099946 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Pcdh9-204ENSMUST00000193901 6127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Tnfrsf23-202ENSMUST00000152703 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Gm38505-201ENSMUST00000174005 1326 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 AC153143.1-201ENSMUST00000222966 1340 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Cntn5-205ENSMUST00000179049 2682 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 CT573016.1-201ENSMUST00000224814 2103 ntAPPRIS P5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Slc13a2os-201ENSMUST00000149865 3627 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Gm13415-201ENSMUST00000131886 3089 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Gm16433-201ENSMUST00000062429 1984 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Aoah-201ENSMUST00000021757 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Gsdmc-202ENSMUST00000173503 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Crisp3-201ENSMUST00000026499 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Adam18-201ENSMUST00000033957 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Adgrd1-203ENSMUST00000156437 4141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Kbtbd3-201ENSMUST00000049648 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Smarca1-203ENSMUST00000101616 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 n-R5s1-201ENSMUST00000101925 119 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Mir688-201ENSMUST00000102055 75 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Kpna2-202ENSMUST00000106768 541 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Prh1-202ENSMUST00000111972 870 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Xlr5d-ps-201ENSMUST00000117501 782 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Gm15192-201ENSMUST00000121005 293 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Gm12903-201ENSMUST00000121015 544 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Gm14053-201ENSMUST00000121662 470 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Gm16189-201ENSMUST00000123707 997 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Clec5a-203ENSMUST00000129948 858 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Gm15351-203ENSMUST00000153095 406 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Gm22080-201ENSMUST00000157591 106 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Gm20396-201ENSMUST00000173358 745 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Gm21754-201ENSMUST00000177550 479 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Gm21820-201ENSMUST00000179056 1083 ntAPPRIS P1 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Hoxb2P0C1T1 Esp24-201ENSMUST00000180245 207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.1 ms