Protein–RNA interactions for Protein: B2RPU8

Zbed5, MCG130675, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed5B2RPU8 AC108846.4-201ENSMUST00000216783 341 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Zbed5B2RPU8 Gm32105-201ENSMUST00000218512 511 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Zbed5B2RPU8 AC127242.3-201ENSMUST00000222009 580 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Zbed5B2RPU8 AC165157.1-201ENSMUST00000222981 580 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Zbed5B2RPU8 AC167013.4-201ENSMUST00000226712 317 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Zbed5B2RPU8 Cypt1-201ENSMUST00000024026 672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Zbed5B2RPU8 Prss23os-201ENSMUST00000032858 334 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Zbed5B2RPU8 Vmn1r37-201ENSMUST00000077482 909 ntAPPRIS P2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Zbed5B2RPU8 Gm22684-201ENSMUST00000082849 132 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Zbed5B2RPU8 Olfr1254-201ENSMUST00000099764 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Zbed5B2RPU8 Zkscan7-204ENSMUST00000214957 5650 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Zbed5B2RPU8 Gimap9-201ENSMUST00000054050 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Platr23-201ENSMUST00000180797 2439 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Zfp110-205ENSMUST00000168247 2499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Slc17a8-201ENSMUST00000020102 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Vcam1-203ENSMUST00000196449 2532 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Gm37902-201ENSMUST00000192839 1683 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 4933411E08Rik-201ENSMUST00000217950 1689 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 G6pc2-202ENSMUST00000112317 1749 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Gm44620-201ENSMUST00000209183 2887 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Fmr1-203ENSMUST00000114654 4061 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Gm27179-201ENSMUST00000184652 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Olfr571-203ENSMUST00000215773 5153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Mapk10-205ENSMUST00000128869 2518 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Zfp799-205ENSMUST00000202988 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Copa-201ENSMUST00000027833 4351 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 AC154597.1-201ENSMUST00000224095 2713 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Gm44584-201ENSMUST00000208395 2880 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Zim1-201ENSMUST00000002336 7693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Nyap2-204ENSMUST00000123720 3471 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Gm10840-201ENSMUST00000100326 309 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Zfp616-203ENSMUST00000116546 531 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Rpl22-ps1-201ENSMUST00000118652 386 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Gm14796-201ENSMUST00000121216 959 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Gm5834-201ENSMUST00000126680 1026 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Gm16284-201ENSMUST00000140995 400 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Tbata-208ENSMUST00000143207 982 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Gm25395-201ENSMUST00000157343 272 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Mir1953-201ENSMUST00000157866 89 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Spink10-205ENSMUST00000162365 1076 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Ms4a2-202ENSMUST00000164792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Obox3-204ENSMUST00000173912 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Gm5871-201ENSMUST00000176461 718 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Gm10428-201ENSMUST00000178750 399 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Gm8192-201ENSMUST00000182196 958 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Rian-215ENSMUST00000183180 633 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Gm29043-201ENSMUST00000186371 623 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Gm28147-201ENSMUST00000187133 621 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Gm28258-201ENSMUST00000189033 587 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Gm29363-201ENSMUST00000189365 621 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Gm7867-201ENSMUST00000189856 546 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 9430087J23Rik-201ENSMUST00000195414 1152 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Gm44342-201ENSMUST00000196874 129 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Gm9710-201ENSMUST00000198053 499 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Gm44383-201ENSMUST00000198940 129 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Gm44411-201ENSMUST00000204172 349 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 4930513N20Rik-201ENSMUST00000207466 1265 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 4933402C06Rik-203ENSMUST00000207559 1227 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Gm33586-201ENSMUST00000210768 892 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Gm20234-201ENSMUST00000214134 717 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 CT009742.1-201ENSMUST00000222507 702 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 CT009711.2-201ENSMUST00000225352 934 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 AC156790.1-201ENSMUST00000226572 559 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Olfr109-201ENSMUST00000031086 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 AC132465.1-201ENSMUST00000219938 1307 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Ccdc83-203ENSMUST00000107221 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Gm9874-202ENSMUST00000194957 1464 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Pja2-204ENSMUST00000172818 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Sp110-201ENSMUST00000093508 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Zfp51-201ENSMUST00000039577 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Olfr1513-202ENSMUST00000215147 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Gm43577-201ENSMUST00000197090 3344 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Nlrp1c-ps-202ENSMUST00000174668 3422 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Ftx-205ENSMUST00000156211 4215 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Ptbp3-212ENSMUST00000174586 6640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Olfr1410-203ENSMUST00000217316 7927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Cmah-208ENSMUST00000224819 9482 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Gm37945-201ENSMUST00000192536 4367 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 C130075A20Rik-201ENSMUST00000198178 4176 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Utrn-201ENSMUST00000076817 12382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 AC129085.2-201ENSMUST00000223763 2800 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Gm42668-201ENSMUST00000200747 2487 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 AC124183.1-201ENSMUST00000222367 2135 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Tank-205ENSMUST00000112502 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Tank-201ENSMUST00000078074 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Gm17540-201ENSMUST00000181617 1528 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Gm5512-202ENSMUST00000220222 1522 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Usp17lb-201ENSMUST00000076501 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Gm45290-201ENSMUST00000211177 3890 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Iglc2-201ENSMUST00000103749 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Prl8a2-202ENSMUST00000110363 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Kat6b-203ENSMUST00000112458 997 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Gm22953-201ENSMUST00000116724 101 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Rps12-ps10-201ENSMUST00000117447 399 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Gm14116-201ENSMUST00000117733 805 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Gm4886-201ENSMUST00000121874 1176 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Gm23430-201ENSMUST00000122490 314 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Gm14272-201ENSMUST00000133525 484 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Gm14747-201ENSMUST00000149888 984 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Zbed5B2RPU8 Sox5os4-201ENSMUST00000155562 365 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms