Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 1700054O19Rik-201ENSMUST00000193604 868 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 4930526M16Rik-201ENSMUST00000197305 954 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 U90926-202ENSMUST00000201332 524 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Gm44982-201ENSMUST00000208795 471 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Gm45607-201ENSMUST00000211143 678 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 5430437J10Rik-201ENSMUST00000211750 1234 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Gm18955-201ENSMUST00000223173 649 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 AC163660.1-201ENSMUST00000223696 818 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 AC159267.1-201ENSMUST00000226702 678 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Sbpl-201ENSMUST00000024939 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Nup43-201ENSMUST00000040135 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Bdnf-201ENSMUST00000053317 4266 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Sprr2b-201ENSMUST00000061038 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Mir425-201ENSMUST00000083645 85 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Sema6d-205ENSMUST00000103238 3165 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 AC164567.3-201ENSMUST00000217743 2869 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Ttk-201ENSMUST00000070326 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Med12-203ENSMUST00000117203 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Gm14667-201ENSMUST00000119448 1350 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Hmgn3-203ENSMUST00000185315 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 A730020M07Rik-202ENSMUST00000196621 2370 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Cdh9-202ENSMUST00000228307 3539 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Tek-203ENSMUST00000102798 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Mat2a-202ENSMUST00000205335 3387 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Nlrp1c-ps-201ENSMUST00000171546 3457 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 2810021J22Rik-201ENSMUST00000073924 3866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Nat8f4-201ENSMUST00000095757 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Ifi207-202ENSMUST00000127730 3145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Olfr293-203ENSMUST00000215280 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Zfp708-202ENSMUST00000109743 2536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Eif4e-201ENSMUST00000029803 4991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Tmem156-204ENSMUST00000212080 1411 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Trim43b-202ENSMUST00000189557 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 4931406B18Rik-201ENSMUST00000013497 3970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Ppp3r2-201ENSMUST00000029991 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Igkv5-43-201ENSMUST00000103368 379 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Gm15216-201ENSMUST00000118058 277 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Gm8722-201ENSMUST00000121466 769 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Gm13462-201ENSMUST00000121472 961 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Gm16248-201ENSMUST00000124238 243 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Lcp1-209ENSMUST00000145303 3841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Cfap61-212ENSMUST00000152515 640 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Gm20454-201ENSMUST00000172713 221 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Gm18808-201ENSMUST00000173316 462 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Gm20713-201ENSMUST00000176344 435 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Gm27158-201ENSMUST00000183813 238 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Gm28564-201ENSMUST00000190864 240 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Gm28086-201ENSMUST00000191586 317 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Gm35323-201ENSMUST00000191836 499 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Gm37349-201ENSMUST00000194205 624 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Gm9504-201ENSMUST00000196322 468 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Gm40330-201ENSMUST00000196498 669 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Gm42443-201ENSMUST00000198084 1155 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Trav13n-1-201ENSMUST00000198359 331 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Gm44111-201ENSMUST00000204649 399 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Smarca2-231ENSMUST00000208091 1140 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 AC172194.1-201ENSMUST00000214246 1020 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Gm46203-201ENSMUST00000218130 478 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 4930545H06Rik-201ENSMUST00000218225 763 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 AC150661.1-201ENSMUST00000222563 495 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 AC160114.2-201ENSMUST00000223021 300 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 AC122251.2-201ENSMUST00000227341 603 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 AC154757.2-201ENSMUST00000228885 743 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Olfr109-201ENSMUST00000031086 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Cetn1-201ENSMUST00000062769 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Olfr177-201ENSMUST00000072853 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Vmn1r53-201ENSMUST00000076086 1122 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Gm25587-201ENSMUST00000082498 166 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Klra1-201ENSMUST00000032288 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Gm26806-201ENSMUST00000180403 1519 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Olfr1504-202ENSMUST00000209192 1514 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Gm44194-201ENSMUST00000204222 3229 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Daw1-203ENSMUST00000113436 1351 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Soat1-207ENSMUST00000189661 8371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Gm10855-201ENSMUST00000100426 2541 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 C87977-204ENSMUST00000105757 1885 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Trim12a-203ENSMUST00000106839 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Qsox2-202ENSMUST00000091263 4011 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Olfr1386-202ENSMUST00000204518 2553 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 AC155234.1-201ENSMUST00000225610 2823 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Zfp459-201ENSMUST00000056470 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Arhgef12-201ENSMUST00000072767 10059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 9830132P13Rik-201ENSMUST00000198240 4187 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Kmo-202ENSMUST00000097458 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Gla-201ENSMUST00000033621 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Gm9048-201ENSMUST00000177744 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Gm9040-201ENSMUST00000177762 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Gm9044-201ENSMUST00000179851 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Gm9046-201ENSMUST00000218329 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 A830010M20Rik-204ENSMUST00000112671 6756 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Usp37-201ENSMUST00000044260 7111 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Vmn1r39-201ENSMUST00000226217 2258 ntAPPRIS P2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Vmn1r39-204ENSMUST00000227555 2297 ntAPPRIS P2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Vmn1r39-205ENSMUST00000228008 2283 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Gm12703-201ENSMUST00000145411 2039 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Gm8279-202ENSMUST00000165713 1760 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Gm5795-203ENSMUST00000171150 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Zfp51-201ENSMUST00000039577 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Igkv4-50-201ENSMUST00000103363 352 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Gm25785-201ENSMUST00000104129 125 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 146 ms