Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Rnd3-203ENSMUST00000154545 2967 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
ChmQ9QXG2 Rps15a-207ENSMUST00000172457 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
ChmQ9QXG2 Gm26742-201ENSMUST00000181829 3340 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
ChmQ9QXG2 9930111J21Rik2-201ENSMUST00000093152 2403 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
ChmQ9QXG2 9930111J21Rik1-201ENSMUST00000093153 2403 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
ChmQ9QXG2 Robo2-202ENSMUST00000117200 5988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
ChmQ9QXG2 AC121094.1-201ENSMUST00000224766 1345 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
ChmQ9QXG2 Trove2-202ENSMUST00000159879 8738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
ChmQ9QXG2 Catsperg2-209ENSMUST00000209126 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
ChmQ9QXG2 Gm29021-201ENSMUST00000185451 1498 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
ChmQ9QXG2 Gm29071-201ENSMUST00000185729 1488 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
ChmQ9QXG2 Gm28799-201ENSMUST00000186506 1498 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
ChmQ9QXG2 Gm28663-201ENSMUST00000186567 1498 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
ChmQ9QXG2 Gm28470-201ENSMUST00000186912 1498 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
ChmQ9QXG2 Gm28971-201ENSMUST00000187506 1498 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
ChmQ9QXG2 Gm28733-202ENSMUST00000187597 1498 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
ChmQ9QXG2 Gm28820-201ENSMUST00000188530 1498 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
ChmQ9QXG2 Gm29606-202ENSMUST00000188564 1498 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
ChmQ9QXG2 Gm29225-202ENSMUST00000188647 1498 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
ChmQ9QXG2 Gm28152-201ENSMUST00000188694 1498 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
ChmQ9QXG2 Gm28771-202ENSMUST00000189399 1499 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
ChmQ9QXG2 Gm28741-201ENSMUST00000189417 1498 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
ChmQ9QXG2 Gm28540-202ENSMUST00000189573 1498 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
ChmQ9QXG2 Gm29122-203ENSMUST00000189609 1498 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
ChmQ9QXG2 Gm28613-201ENSMUST00000189627 1498 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
ChmQ9QXG2 Gm28816-202ENSMUST00000189686 1498 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
ChmQ9QXG2 Gm29584-202ENSMUST00000190181 1498 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
ChmQ9QXG2 Gm28293-202ENSMUST00000190417 1498 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
ChmQ9QXG2 Gm28463-203ENSMUST00000191085 1498 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
ChmQ9QXG2 Gm28124-202ENSMUST00000191099 1498 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
ChmQ9QXG2 Gm29217-202ENSMUST00000191270 1498 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
ChmQ9QXG2 Gm28332-203ENSMUST00000191389 1498 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
ChmQ9QXG2 Gm37346-201ENSMUST00000191665 1498 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
ChmQ9QXG2 Gm37454-202ENSMUST00000193918 1498 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
ChmQ9QXG2 Gm38371-202ENSMUST00000193996 1498 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
ChmQ9QXG2 Gm37434-203ENSMUST00000194239 1498 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
ChmQ9QXG2 Gm37840-202ENSMUST00000194805 1498 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
ChmQ9QXG2 Gm37687-203ENSMUST00000195020 1498 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
ChmQ9QXG2 Gm37071-203ENSMUST00000195814 1498 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
ChmQ9QXG2 1110059G10Rik-201ENSMUST00000035154 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
ChmQ9QXG2 Gm17767-202ENSMUST00000190169 3049 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
ChmQ9QXG2 Adgrl2-215ENSMUST00000199750 4399 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
ChmQ9QXG2 Tceal1-201ENSMUST00000055104 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
ChmQ9QXG2 Nxpe4-203ENSMUST00000216998 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
ChmQ9QXG2 Gm23484-201ENSMUST00000104178 131 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
ChmQ9QXG2 Olfr1396-202ENSMUST00000109201 1170 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
ChmQ9QXG2 Vgll1-202ENSMUST00000114745 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
ChmQ9QXG2 Mgst1-202ENSMUST00000118091 1030 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
ChmQ9QXG2 Gm14610-201ENSMUST00000118358 966 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
ChmQ9QXG2 Gm11558-201ENSMUST00000118454 459 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
ChmQ9QXG2 Mgst1-203ENSMUST00000120230 1027 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
ChmQ9QXG2 Gm15712-201ENSMUST00000120369 1156 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
ChmQ9QXG2 Gm22915-201ENSMUST00000157615 136 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
ChmQ9QXG2 Gm25332-201ENSMUST00000158038 105 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
ChmQ9QXG2 Gm5656-201ENSMUST00000171020 1096 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
ChmQ9QXG2 Klrb1a-202ENSMUST00000171306 989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
ChmQ9QXG2 Gm20490-201ENSMUST00000173622 198 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
ChmQ9QXG2 Gm29529-201ENSMUST00000187154 714 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
ChmQ9QXG2 Gm28285-204ENSMUST00000187793 601 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
ChmQ9QXG2 Gm2979-201ENSMUST00000193442 463 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
ChmQ9QXG2 1700047N06Rik-201ENSMUST00000194474 920 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
ChmQ9QXG2 Gm19739-201ENSMUST00000195941 153 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
ChmQ9QXG2 E230032D23Rik-202ENSMUST00000207959 451 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
ChmQ9QXG2 Gm36435-201ENSMUST00000213341 1178 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
ChmQ9QXG2 B230303A05Rik-202ENSMUST00000220728 478 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
ChmQ9QXG2 Olfr716-205ENSMUST00000214819 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
ChmQ9QXG2 Gm45117-201ENSMUST00000207250 1774 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
ChmQ9QXG2 Bnc2-201ENSMUST00000102820 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
ChmQ9QXG2 Rnf180-202ENSMUST00000224011 3785 ntAPPRIS P2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
ChmQ9QXG2 Pcdh15-234ENSMUST00000191854 9104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
ChmQ9QXG2 4930544L04Rik-202ENSMUST00000211181 3204 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
ChmQ9QXG2 Gm44242-201ENSMUST00000204212 2721 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
ChmQ9QXG2 Gm44215-201ENSMUST00000204910 2711 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
ChmQ9QXG2 Ccar1-211ENSMUST00000219527 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
ChmQ9QXG2 Lcp1-209ENSMUST00000145303 3841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
ChmQ9QXG2 Gm15229-201ENSMUST00000146636 1398 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
ChmQ9QXG2 Gm21122-201ENSMUST00000191548 3452 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
ChmQ9QXG2 Fignl1-202ENSMUST00000109664 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
ChmQ9QXG2 Dock10-209ENSMUST00000190983 6672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
ChmQ9QXG2 Fbxw18-201ENSMUST00000098359 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
ChmQ9QXG2 Gm45601-201ENSMUST00000211483 6753 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
ChmQ9QXG2 6720475M21Rik-201ENSMUST00000201755 2753 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
ChmQ9QXG2 Zfp937-201ENSMUST00000073782 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
ChmQ9QXG2 Brwd3-205ENSMUST00000150434 11619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
ChmQ9QXG2 Gm37530-201ENSMUST00000191759 4932 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
ChmQ9QXG2 Olfr293-202ENSMUST00000214401 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
ChmQ9QXG2 Gm28311-201ENSMUST00000185236 1497 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
ChmQ9QXG2 Gm28549-202ENSMUST00000191354 1497 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
ChmQ9QXG2 Gm38366-201ENSMUST00000193127 1934 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
ChmQ9QXG2 Fcrl6-201ENSMUST00000094303 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
ChmQ9QXG2 Vmn1r31-203ENSMUST00000177318 2076 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
ChmQ9QXG2 Gm44046-201ENSMUST00000203145 2678 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
ChmQ9QXG2 Vmn1r34-207ENSMUST00000228647 2979 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
ChmQ9QXG2 Hyal4-201ENSMUST00000031691 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
ChmQ9QXG2 Rbmy-201ENSMUST00000100360 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
ChmQ9QXG2 Olfr1019-201ENSMUST00000102634 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
ChmQ9QXG2 Gm14576-201ENSMUST00000118073 1111 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
ChmQ9QXG2 Gm14053-201ENSMUST00000121662 470 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
ChmQ9QXG2 Cbx5-203ENSMUST00000122182 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
ChmQ9QXG2 Cnih1-202ENSMUST00000146629 789 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
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