Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Cd209b-201ENSMUST00000084086 2039 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Trim39Q9ESN2 Fastkd1-202ENSMUST00000102706 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Trim39Q9ESN2 4932413F04Rik-201ENSMUST00000190332 2765 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Trim39Q9ESN2 Grip1-215ENSMUST00000148954 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Trim39Q9ESN2 Tex26-205ENSMUST00000201683 1456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Trim39Q9ESN2 Osbpl3-202ENSMUST00000090019 4039 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Trim39Q9ESN2 Grip1-211ENSMUST00000144959 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim39Q9ESN2 Ehf-202ENSMUST00000111174 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim39Q9ESN2 AC159624.1-201ENSMUST00000217762 1344 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim39Q9ESN2 Tmem87a-203ENSMUST00000110729 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim39Q9ESN2 Gm30382-202ENSMUST00000199007 1801 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim39Q9ESN2 Tnik-214ENSMUST00000162485 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim39Q9ESN2 Nrf1-204ENSMUST00000115199 2296 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim39Q9ESN2 Cnot2-204ENSMUST00000164088 2618 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim39Q9ESN2 Gm28485-201ENSMUST00000185300 1500 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim39Q9ESN2 Gm28684-201ENSMUST00000185586 1500 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim39Q9ESN2 Gm17791-201ENSMUST00000185660 1501 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim39Q9ESN2 Gm28422-201ENSMUST00000186112 1500 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim39Q9ESN2 Gm29447-201ENSMUST00000186407 1500 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim39Q9ESN2 Gm29628-201ENSMUST00000187206 1500 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim39Q9ESN2 Gm28316-201ENSMUST00000187576 1500 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim39Q9ESN2 Gm29313-201ENSMUST00000187866 1500 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim39Q9ESN2 Gm28252-201ENSMUST00000188457 1500 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim39Q9ESN2 Gm28950-203ENSMUST00000188826 1500 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim39Q9ESN2 Gm29303-201ENSMUST00000189215 1500 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim39Q9ESN2 Gm28220-201ENSMUST00000189607 1500 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim39Q9ESN2 Gm29342-202ENSMUST00000189689 1500 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim39Q9ESN2 Gm29116-202ENSMUST00000189963 1500 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim39Q9ESN2 Gm29081-203ENSMUST00000190140 1500 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim39Q9ESN2 Gm28726-201ENSMUST00000190994 1500 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim39Q9ESN2 Gm29386-203ENSMUST00000191185 1500 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim39Q9ESN2 Gm33954-202ENSMUST00000195188 1500 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim39Q9ESN2 Zfp773-202ENSMUST00000211240 4073 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim39Q9ESN2 Gm25762-201ENSMUST00000103984 132 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim39Q9ESN2 Gm6181-201ENSMUST00000117187 264 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim39Q9ESN2 Gm14099-201ENSMUST00000117769 605 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim39Q9ESN2 Vmn1r-ps2-201ENSMUST00000118464 834 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim39Q9ESN2 Gm15616-201ENSMUST00000118662 375 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim39Q9ESN2 Gm12375-201ENSMUST00000119331 921 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim39Q9ESN2 Gm13508-201ENSMUST00000121639 775 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim39Q9ESN2 Pgbd1-202ENSMUST00000122872 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim39Q9ESN2 Ttc9c-204ENSMUST00000153281 1192 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim39Q9ESN2 Gm25981-201ENSMUST00000157921 295 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim39Q9ESN2 Gm22202-201ENSMUST00000158608 311 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim39Q9ESN2 Sult2a4-202ENSMUST00000165167 964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim39Q9ESN2 Gm17177-201ENSMUST00000169144 483 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim39Q9ESN2 Vmn1r-ps86-201ENSMUST00000174052 547 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim39Q9ESN2 4930438E09Rik-201ENSMUST00000176841 776 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim39Q9ESN2 Gm7132-201ENSMUST00000182302 984 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim39Q9ESN2 Gm27197-201ENSMUST00000184325 479 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim39Q9ESN2 Gm29561-201ENSMUST00000187838 631 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim39Q9ESN2 Scgb2b5-ps-201ENSMUST00000190227 270 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim39Q9ESN2 Gm29138-201ENSMUST00000191444 348 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim39Q9ESN2 Gm8407-201ENSMUST00000192719 427 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim39Q9ESN2 Gm38329-201ENSMUST00000193473 427 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim39Q9ESN2 Gm43568-202ENSMUST00000198427 476 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim39Q9ESN2 Gm44003-201ENSMUST00000203024 490 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim39Q9ESN2 Gm43979-201ENSMUST00000203179 475 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim39Q9ESN2 Speer9-ps1-201ENSMUST00000203447 775 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
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Trim39Q9ESN2 4933432K03Rik-201ENSMUST00000205739 1247 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim39Q9ESN2 Gm36371-201ENSMUST00000209043 1103 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
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Trim39Q9ESN2 AC163296.1-201ENSMUST00000220004 1266 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim39Q9ESN2 1700104L18Rik-201ENSMUST00000220132 598 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim39Q9ESN2 Gm46313-201ENSMUST00000220463 547 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim39Q9ESN2 AC132587.1-201ENSMUST00000220562 166 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim39Q9ESN2 9130015A21Rik-202ENSMUST00000222153 837 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
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Trim39Q9ESN2 Tex30-201ENSMUST00000027215 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
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Trim39Q9ESN2 Slurp2-201ENSMUST00000057932 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim39Q9ESN2 Mill2-202ENSMUST00000072415 1075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim39Q9ESN2 Rps7-201ENSMUST00000074267 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim39Q9ESN2 Gm6083-201ENSMUST00000075518 357 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
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Trim39Q9ESN2 Olfr1220-201ENSMUST00000099789 1026 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim39Q9ESN2 Olfr1220-202ENSMUST00000099806 1201 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim39Q9ESN2 Armcx3-201ENSMUST00000081834 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim39Q9ESN2 Gucy2g-201ENSMUST00000069183 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim39Q9ESN2 Gm33843-201ENSMUST00000219313 1637 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim39Q9ESN2 Polk-204ENSMUST00000221645 1644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim39Q9ESN2 Naa11-201ENSMUST00000060265 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim39Q9ESN2 Gm5177-202ENSMUST00000183337 3785 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim39Q9ESN2 Cd44-208ENSMUST00000111198 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim39Q9ESN2 Olfr605-202ENSMUST00000215417 2921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim39Q9ESN2 Rasef-202ENSMUST00000102837 5158 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim39Q9ESN2 Gm42772-201ENSMUST00000199945 3041 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim39Q9ESN2 Zfp661-201ENSMUST00000077422 2765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim39Q9ESN2 Gm14120-201ENSMUST00000129067 2869 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim39Q9ESN2 Abraxas2-201ENSMUST00000084497 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim39Q9ESN2 Marf1-201ENSMUST00000090300 7765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim39Q9ESN2 Zscan18-203ENSMUST00000210650 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Trim39Q9ESN2 Gm26876-201ENSMUST00000180875 2387 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim39Q9ESN2 Jakmip2-201ENSMUST00000082254 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim39Q9ESN2 4933431G14Rik-201ENSMUST00000205571 1670 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim39Q9ESN2 Pafah2-202ENSMUST00000105870 3180 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Trim39Q9ESN2 Itga1-201ENSMUST00000061673 10967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
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