Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Gm20530-201ENSMUST00000174261 254 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Gm20924-202ENSMUST00000186910 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Gm28918-201ENSMUST00000188822 699 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Gm28996-201ENSMUST00000190316 721 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Gm18851-201ENSMUST00000210087 1058 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Gm18781-201ENSMUST00000211252 924 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Gm36855-202ENSMUST00000216439 754 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Gm35619-201ENSMUST00000222548 600 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 AC131187.2-201ENSMUST00000223936 994 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Olfr1131-201ENSMUST00000090712 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Gm44661-201ENSMUST00000208830 3503 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Zmat4-206ENSMUST00000207301 4207 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Platr8-201ENSMUST00000146110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Wdr72-205ENSMUST00000215440 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Fbln5-201ENSMUST00000021603 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Slc15a2-208ENSMUST00000165531 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Olfr1299-202ENSMUST00000213511 1783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Fbxw21-203ENSMUST00000198076 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Zscan18-201ENSMUST00000046245 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Gm43279-201ENSMUST00000202376 2512 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 CT025566.1-202ENSMUST00000224800 2511 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Zfp846-202ENSMUST00000115557 12974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Gm14550-201ENSMUST00000117918 407 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Gm15300-201ENSMUST00000122324 279 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Gm25904-201ENSMUST00000158491 143 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Gm20429-202ENSMUST00000174168 820 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Gm26509-201ENSMUST00000180947 948 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Gm21392-201ENSMUST00000182950 972 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 1700104B16Rik-202ENSMUST00000187948 722 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Gm37502-201ENSMUST00000192981 356 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Gm44162-201ENSMUST00000203543 544 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 AC122327.2-201ENSMUST00000220883 120 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 AC122327.3-201ENSMUST00000221852 120 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 AC166341.1-201ENSMUST00000223360 105 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 AL671874.1-201ENSMUST00000223746 1123 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Gm22684-201ENSMUST00000082849 132 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Gm6990-201ENSMUST00000086830 348 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Chrm2-202ENSMUST00000172278 5676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Clasp1-210ENSMUST00000188710 10265 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Fam227a-203ENSMUST00000109648 5187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Ddx24-201ENSMUST00000044923 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Gm37510-201ENSMUST00000194151 4762 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Mageb18-202ENSMUST00000113955 2163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Zfp143-205ENSMUST00000211798 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Itgb6-202ENSMUST00000059888 4806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Rftn2-201ENSMUST00000027121 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Gm136-201ENSMUST00000095129 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Olfr770-204ENSMUST00000204712 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Frs2-201ENSMUST00000020381 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Trpm3-206ENSMUST00000099569 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Olfr1362-201ENSMUST00000051874 3045 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Unc13c-202ENSMUST00000184666 8796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Cyp2c67-201ENSMUST00000067328 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Gm20121-201ENSMUST00000198547 1594 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Arhgef9-205ENSMUST00000113883 5399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Sirpb1c-205ENSMUST00000108354 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Gm21719-201ENSMUST00000115940 693 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Gm14513-201ENSMUST00000117403 123 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Gm14054-201ENSMUST00000120744 704 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Vmn1r-ps111-201ENSMUST00000121014 997 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 D830026I12Rik-201ENSMUST00000124434 935 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Vmn1r208-201ENSMUST00000124841 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Gm12923-201ENSMUST00000127060 667 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 1700109G15Rik-201ENSMUST00000150735 384 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Sox5os2-201ENSMUST00000156443 627 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Gm24435-201ENSMUST00000157886 110 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Gm9529-201ENSMUST00000177598 579 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Gm17048-201ENSMUST00000179266 847 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Gm27348-201ENSMUST00000184511 170 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Gm28527-201ENSMUST00000185210 297 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Gm29586-201ENSMUST00000185225 1104 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Gm28253-201ENSMUST00000186071 712 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Gm29178-203ENSMUST00000186312 1104 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Gm29624-202ENSMUST00000190185 1104 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Gm29179-209ENSMUST00000190621 1100 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Olfr1449-202ENSMUST00000208624 1296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 AC105324.1-201ENSMUST00000227844 386 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 BC147527-201ENSMUST00000081558 504 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Gm24695-201ENSMUST00000083877 83 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Trps1-204ENSMUST00000183757 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Dleu2-207ENSMUST00000182756 3530 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Gm38366-201ENSMUST00000193127 1934 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Prickle2-204ENSMUST00000113447 7679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 AC161884.1-201ENSMUST00000225436 2174 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Poln-201ENSMUST00000042954 2897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Gm19210-201ENSMUST00000199562 1350 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Ddx6-201ENSMUST00000170489 6065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 AC093022.3-201ENSMUST00000226569 1926 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Lars-201ENSMUST00000097590 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Pkd1l1-203ENSMUST00000178195 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Vmn2r-ps103-201ENSMUST00000222960 2349 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Slc17a4-201ENSMUST00000021769 1604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 AC210924.1-201ENSMUST00000221183 2705 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Trav8d-1-201ENSMUST00000103580 400 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Gm16347-201ENSMUST00000131707 622 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Gad1os-201ENSMUST00000151851 889 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Gm14343-201ENSMUST00000154524 731 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
OtofQ9ESF1 Eif4a2-224ENSMUST00000187168 1238 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 166.4 ms