Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Sirpb1c-201ENSMUST00000050623 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Actn1Q7TPR4 Gm10855-201ENSMUST00000100426 2541 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Actn1Q7TPR4 Gm44626-201ENSMUST00000207035 2715 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Actn1Q7TPR4 Zfp712-201ENSMUST00000167565 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Actn1Q7TPR4 1700014D04Rik-203ENSMUST00000180139 3231 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Actn1Q7TPR4 Trrap-203ENSMUST00000100467 12479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Actn1Q7TPR4 Trrap-202ENSMUST00000094120 12456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Actn1Q7TPR4 5430421F17Rik-202ENSMUST00000210268 2295 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Actn1Q7TPR4 Olfr62-202ENSMUST00000213189 2570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Actn1Q7TPR4 Ndnf-201ENSMUST00000054351 10101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Actn1Q7TPR4 Zfp473-204ENSMUST00000120798 3559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Actn1Q7TPR4 Gm13749-201ENSMUST00000133244 1432 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Actn1Q7TPR4 Gm7980-201ENSMUST00000168107 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
Actn1Q7TPR4 Gm37595-201ENSMUST00000192668 1742 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
Actn1Q7TPR4 4833413G10Rik-201ENSMUST00000199632 1946 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
Actn1Q7TPR4 Gja10-201ENSMUST00000056517 2117 ntAPPRIS P2 BASIC7.52□□□□□ -1.2
Actn1Q7TPR4 Gm5600-202ENSMUST00000211589 2331 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Actn1Q7TPR4 CT025566.1-202ENSMUST00000224800 2511 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 Zfp449-201ENSMUST00000101560 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 Eya4-202ENSMUST00000092665 5304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 Plch1-206ENSMUST00000159676 6560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 Gm20749-201ENSMUST00000186319 3492 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 A630001G21Rik-202ENSMUST00000159122 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 Olfr457-202ENSMUST00000203396 4404 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 Gimap9-201ENSMUST00000054050 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 Trdv2-2-201ENSMUST00000103678 397 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 Gm12842-201ENSMUST00000117298 476 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 Defb28-201ENSMUST00000121912 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 Gm11581-201ENSMUST00000122024 763 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 Gm15471-201ENSMUST00000145893 625 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 Gm11335-201ENSMUST00000148743 1080 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 Gm22530-201ENSMUST00000158820 118 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 1700003I22Rik-201ENSMUST00000186048 424 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 1700031M16Rik-205ENSMUST00000189907 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 Gm28996-201ENSMUST00000190316 721 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 Gm43538-201ENSMUST00000200416 849 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 Olfr195-201ENSMUST00000075381 995 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 Olfr933-201ENSMUST00000075680 1003 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 Gm24032-201ENSMUST00000083932 159 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 Olfr1224-ps1-202ENSMUST00000099793 1212 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 Nr2c1-203ENSMUST00000105290 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 Slc4a4-203ENSMUST00000130041 3335 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 Gm43251-201ENSMUST00000198339 2712 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 Lmbrd2-204ENSMUST00000227556 8099 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 Nudt12-201ENSMUST00000025065 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 Rgs22-203ENSMUST00000172831 4006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 Apobec3-209ENSMUST00000176325 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 Gm14418-201ENSMUST00000108955 1415 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 Olfr60-202ENSMUST00000210932 2383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 Olfr115-203ENSMUST00000223366 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 Ampd3-201ENSMUST00000005829 4094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 Gm19024-201ENSMUST00000194681 1319 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 Mroh4-201ENSMUST00000023271 3583 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 4930432O09Rik-201ENSMUST00000219710 1986 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 Olfr452-203ENSMUST00000215719 2728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 Tex11-201ENSMUST00000009814 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 Rgsl1-203ENSMUST00000141249 1752 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 9930111J21Rik2-201ENSMUST00000093152 2403 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 9930111J21Rik1-201ENSMUST00000093153 2403 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 4921539H07Rik-201ENSMUST00000197200 2985 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 AC124421.1-201ENSMUST00000219114 4154 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 Mbd3l2-202ENSMUST00000213777 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 Zwint-202ENSMUST00000105431 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 Tarm1-202ENSMUST00000203020 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 Olfr54-202ENSMUST00000215409 4782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 Gm14466-201ENSMUST00000119028 451 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 Gm15096-201ENSMUST00000121918 878 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 Gm12963-203ENSMUST00000156271 388 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 Cfhr3-201ENSMUST00000170441 1022 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 Gm22132-201ENSMUST00000175316 100 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 Gm4956-202ENSMUST00000178869 672 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 BC035044-202ENSMUST00000178918 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 4930467D21Rik-202ENSMUST00000181724 570 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 Mir8097-201ENSMUST00000185150 119 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 Gm38237-201ENSMUST00000193366 376 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 1700015C17Rik-201ENSMUST00000197297 239 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 Gm43141-201ENSMUST00000199695 274 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 Mrln-201ENSMUST00000020090 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 U90926-202ENSMUST00000201332 524 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 Gm20426-202ENSMUST00000204789 399 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 AC138329.1-201ENSMUST00000225040 471 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 Dpm2-201ENSMUST00000028151 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 Gm22053-201ENSMUST00000083394 200 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 Mir484-201ENSMUST00000093566 67 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 Bdnf-201ENSMUST00000053317 4266 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 Asap1-206ENSMUST00000175799 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 Gm9049-201ENSMUST00000178998 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 Gm9030-201ENSMUST00000218405 2410 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 Gm32717-201ENSMUST00000219147 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 Gm9029-201ENSMUST00000219232 2410 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 Gm32802-201ENSMUST00000219565 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 Gm9045-201ENSMUST00000219760 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 Chil3-201ENSMUST00000063062 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 Ccdc7a-201ENSMUST00000095158 1547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 Ttll6-201ENSMUST00000107680 3485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 T2-201ENSMUST00000163578 1755 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 Mapre2-202ENSMUST00000115830 2496 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 Gin1-201ENSMUST00000027571 2494 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 Gm35850-201ENSMUST00000210956 4653 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 Ncoa2-202ENSMUST00000068304 8006 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms