Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43762-201ENSMUST00000201521 295 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 AC133207.2-201ENSMUST00000218430 237 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 AC079680.1-202ENSMUST00000219835 654 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7986-201ENSMUST00000221336 551 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5426-201ENSMUST00000074615 312 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm21731-201ENSMUST00000079524 489 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Adamdec1-201ENSMUST00000022641 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44956-201ENSMUST00000208277 2887 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43176-201ENSMUST00000199653 2989 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 5228 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Pdlim5-205ENSMUST00000170361 2010 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Dab2-201ENSMUST00000078019 3793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 CT025619.1-201ENSMUST00000214294 2331 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Papola-215ENSMUST00000170002 2605 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 C530043A13Rik-202ENSMUST00000188155 1512 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1183-202ENSMUST00000213115 8258 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Myof-211ENSMUST00000226068 6633 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Spta1-201ENSMUST00000027817 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr76-202ENSMUST00000213471 3109 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Ctage5-217ENSMUST00000176892 2784 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Ighv12-3-201ENSMUST00000103485 353 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Traj18-201ENSMUST00000103723 66 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm23485-201ENSMUST00000104181 155 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Rbpsuh-ps1-201ENSMUST00000119456 1006 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13578-201ENSMUST00000120849 590 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15471-201ENSMUST00000145893 625 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5125-201ENSMUST00000148614 624 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16226-201ENSMUST00000159950 760 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 2310043O21Rik-201ENSMUST00000185323 622 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Ms4a12-201ENSMUST00000186228 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8506-201ENSMUST00000186661 829 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37310-201ENSMUST00000195237 2968 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42799-201ENSMUST00000201331 328 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm30933-201ENSMUST00000217174 381 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm35619-201ENSMUST00000222548 600 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Sbpl-201ENSMUST00000024939 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm24695-201ENSMUST00000083877 83 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr461-201ENSMUST00000089490 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37772-201ENSMUST00000191635 1394 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Dnajb7-201ENSMUST00000057236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Pcsk2os1-201ENSMUST00000126735 4233 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 AC135083.2-201ENSMUST00000228599 1456 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Chn1-202ENSMUST00000102677 3760 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 F5-201ENSMUST00000086040 7430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1386-202ENSMUST00000204518 2553 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Mef2c-227ENSMUST00000199432 3498 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Adgre1-202ENSMUST00000086763 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37372-201ENSMUST00000193577 3311 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Ankub1-201ENSMUST00000099091 2696 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm38124-201ENSMUST00000191710 2581 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Lrrc6-201ENSMUST00000023006 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r26-202ENSMUST00000228040 4546 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm22374-201ENSMUST00000104583 132 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13176-201ENSMUST00000117910 477 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Adgrl3-211ENSMUST00000120128 6370 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12229-201ENSMUST00000120487 468 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15696-201ENSMUST00000121730 445 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12438-201ENSMUST00000122034 336 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Dnah2os-201ENSMUST00000124108 859 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13179-202ENSMUST00000151994 978 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16269-201ENSMUST00000160532 409 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20490-201ENSMUST00000173622 198 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm18006-201ENSMUST00000177411 662 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm21542-201ENSMUST00000182307 993 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37177-201ENSMUST00000193768 417 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Rps12-ps4-201ENSMUST00000208689 397 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr109-201ENSMUST00000031086 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Amot-201ENSMUST00000112835 6519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 AC153152.1-201ENSMUST00000221105 2742 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Uba1y-202ENSMUST00000190013 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15880-201ENSMUST00000142678 2884 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp87-204ENSMUST00000181767 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Rnf180-202ENSMUST00000224011 3785 ntAPPRIS P2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr645-201ENSMUST00000057104 3677 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14870-201ENSMUST00000118414 156 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Scgb2b23-ps-201ENSMUST00000122094 330 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14950-201ENSMUST00000149500 1155 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm25675-201ENSMUST00000174979 118 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29586-201ENSMUST00000185225 1104 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28253-201ENSMUST00000186071 712 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29178-203ENSMUST00000186312 1104 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29624-202ENSMUST00000190185 1104 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29179-209ENSMUST00000190621 1100 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Pilrb2-202ENSMUST00000196162 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 AC165292.1-201ENSMUST00000215218 620 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Fkbp1a-ps2-201ENSMUST00000219474 311 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 CT009713.1-201ENSMUST00000224828 853 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Pifo-202ENSMUST00000066319 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Nms-201ENSMUST00000088029 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 n-R5s58-201ENSMUST00000093682 119 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm38381-201ENSMUST00000193594 2275 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Mdc1-201ENSMUST00000082337 7335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 AC152922.2-201ENSMUST00000213353 3879 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15475-201ENSMUST00000137673 3757 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Elavl2-209ENSMUST00000107124 4127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Zmynd11-205ENSMUST00000110636 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 AC153955.2-201ENSMUST00000216739 4129 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Ctnnd1-208ENSMUST00000111677 5789 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 C1s1-203ENSMUST00000160505 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr11-202ENSMUST00000205631 3265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.2 ms