Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Ftx-205ENSMUST00000156211 4215 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ctnna3Q65CL1 Cul5-202ENSMUST00000120122 5945 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ctnna3Q65CL1 Sbf2-208ENSMUST00000166020 5481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ctnna3Q65CL1 4933421A08Rik-201ENSMUST00000135313 1638 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ctnna3Q65CL1 Nemf-201ENSMUST00000021368 4732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ctnna3Q65CL1 Gm28600-202ENSMUST00000189502 1495 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ctnna3Q65CL1 Gm28175-202ENSMUST00000209336 1477 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ctnna3Q65CL1 B130024G19Rik-203ENSMUST00000190320 5451 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ctnna3Q65CL1 Tmem182-201ENSMUST00000114765 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ctnna3Q65CL1 Gm6327-201ENSMUST00000171185 1335 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ctnna3Q65CL1 Gm37254-201ENSMUST00000193542 3901 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ctnna3Q65CL1 Igkv4-90-201ENSMUST00000103334 352 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ctnna3Q65CL1 Gm2178-201ENSMUST00000104927 357 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ctnna3Q65CL1 Gm12181-201ENSMUST00000121448 531 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ctnna3Q65CL1 Gm12518-201ENSMUST00000122075 779 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ctnna3Q65CL1 Gm24383-201ENSMUST00000122691 333 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ctnna3Q65CL1 Gm13629-202ENSMUST00000152740 645 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ctnna3Q65CL1 Gm25342-201ENSMUST00000157459 122 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ctnna3Q65CL1 Gm17118-201ENSMUST00000164032 335 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ctnna3Q65CL1 Gm3326-201ENSMUST00000164656 1043 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ctnna3Q65CL1 Gm24756-201ENSMUST00000177002 96 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ctnna3Q65CL1 Gm28413-201ENSMUST00000189369 291 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ctnna3Q65CL1 4930518I17Rik-201ENSMUST00000203902 656 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ctnna3Q65CL1 Gm44111-201ENSMUST00000204649 399 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ctnna3Q65CL1 Lair1-209ENSMUST00000205296 412 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ctnna3Q65CL1 Gm2975-201ENSMUST00000209710 820 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ctnna3Q65CL1 AC155941.3-201ENSMUST00000218476 308 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ctnna3Q65CL1 Asf1a-204ENSMUST00000219271 725 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ctnna3Q65CL1 Olfr429-201ENSMUST00000060693 943 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ctnna3Q65CL1 1700084J12Rik-201ENSMUST00000079057 734 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ctnna3Q65CL1 Olfr517-201ENSMUST00000084753 1055 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ctnna3Q65CL1 Crtam-204ENSMUST00000188848 5001 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ctnna3Q65CL1 Nlrp1c-ps-201ENSMUST00000171546 3457 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ctnna3Q65CL1 Olfr60-205ENSMUST00000216027 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ctnna3Q65CL1 Tcaf3-201ENSMUST00000069023 3110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ctnna3Q65CL1 Gm44121-201ENSMUST00000205169 2006 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ctnna3Q65CL1 Olfr1312-204ENSMUST00000215531 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ctnna3Q65CL1 Gm3512-202ENSMUST00000172431 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ctnna3Q65CL1 Akr1e1-202ENSMUST00000110691 3288 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ctnna3Q65CL1 Gm43876-201ENSMUST00000203831 3229 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Ctnna3Q65CL1 Slmap-204ENSMUST00000112330 3962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ctnna3Q65CL1 Ank3-240ENSMUST00000183169 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ctnna3Q65CL1 Tgtp1-201ENSMUST00000068063 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ctnna3Q65CL1 E330011O21Rik-204ENSMUST00000210839 1361 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ctnna3Q65CL1 Usp17la-201ENSMUST00000067695 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ctnna3Q65CL1 AC132465.1-201ENSMUST00000219938 1307 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Ctnna3Q65CL1 Pecam1-202ENSMUST00000080853 3283 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ctnna3Q65CL1 Igkv1-122-201ENSMUST00000103314 383 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ctnna3Q65CL1 Cd209d-201ENSMUST00000011445 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ctnna3Q65CL1 Gm11341-201ENSMUST00000122316 447 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Ctnna3Q65CL1 Gm24286-201ENSMUST00000157632 128 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Ctnna3Q65CL1 Tnik-202ENSMUST00000159308 3831 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ctnna3Q65CL1 Galnt5-203ENSMUST00000166729 3812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ctnna3Q65CL1 Vmn1r-ps78-201ENSMUST00000178185 924 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Ctnna3Q65CL1 Vmn1r-ps76-201ENSMUST00000179492 924 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Ctnna3Q65CL1 Gm18952-201ENSMUST00000194471 846 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Ctnna3Q65CL1 Gm37068-201ENSMUST00000195168 640 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ctnna3Q65CL1 Gm7452-201ENSMUST00000200764 788 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Ctnna3Q65CL1 Gm43377-201ENSMUST00000201640 455 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Ctnna3Q65CL1 4930455C13Rik-201ENSMUST00000218108 1018 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ctnna3Q65CL1 AC154816.1-201ENSMUST00000222688 634 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ctnna3Q65CL1 AC124395.1-201ENSMUST00000225940 707 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Ctnna3Q65CL1 Gsta4-201ENSMUST00000034903 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ctnna3Q65CL1 Olfr574-201ENSMUST00000052997 1041 ntAPPRIS P2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ctnna3Q65CL1 Vmn1r73-201ENSMUST00000055070 912 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ctnna3Q65CL1 Gm24451-201ENSMUST00000083353 133 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Ctnna3Q65CL1 Gm6455-201ENSMUST00000095015 1072 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ctnna3Q65CL1 Slx-201ENSMUST00000096913 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ctnna3Q65CL1 AL607131.1-201ENSMUST00000222575 1835 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ctnna3Q65CL1 Dock10-209ENSMUST00000190983 6672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ctnna3Q65CL1 A130050O07Rik-201ENSMUST00000191963 3023 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Ctnna3Q65CL1 C030029H02Rik-202ENSMUST00000210356 2980 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ctnna3Q65CL1 Smurf2-206ENSMUST00000167787 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ctnna3Q65CL1 Mlh3-203ENSMUST00000220854 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ctnna3Q65CL1 Gm12299-201ENSMUST00000138819 2327 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ctnna3Q65CL1 Gm37525-201ENSMUST00000193499 2871 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Ctnna3Q65CL1 Gm44677-201ENSMUST00000209151 3739 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Ctnna3Q65CL1 Stag2-203ENSMUST00000115073 6171 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ctnna3Q65CL1 Zim1-201ENSMUST00000002336 7693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ctnna3Q65CL1 Gm45843-201ENSMUST00000212317 4597 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Ctnna3Q65CL1 Vcam1-203ENSMUST00000196449 2532 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Ctnna3Q65CL1 CT009757.4-201ENSMUST00000221520 2541 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Ctnna3Q65CL1 Gm28173-201ENSMUST00000191190 1496 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Ctnna3Q65CL1 Gm6614-202ENSMUST00000181628 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Ctnna3Q65CL1 Gm7961-201ENSMUST00000201338 1436 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Ctnna3Q65CL1 6720475M21Rik-201ENSMUST00000201755 2753 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Ctnna3Q65CL1 Kcnj16-201ENSMUST00000106635 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Ctnna3Q65CL1 Gm43638-201ENSMUST00000201519 2297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Ctnna3Q65CL1 Rabgap1l-202ENSMUST00000028052 6338 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Ctnna3Q65CL1 Gm39465-201ENSMUST00000213810 9813 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Ctnna3Q65CL1 AC122024.1-201ENSMUST00000219276 4850 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Ctnna3Q65CL1 Csmd1-201ENSMUST00000082104 14182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Ctnna3Q65CL1 Vmn2r57-201ENSMUST00000165029 2592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Ctnna3Q65CL1 Gm10840-201ENSMUST00000100326 309 ntAPPRIS P1 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Ctnna3Q65CL1 Trav19-201ENSMUST00000103674 446 ntAPPRIS P1 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Ctnna3Q65CL1 Rpl12-ps1-201ENSMUST00000116168 498 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Ctnna3Q65CL1 Gm2200-201ENSMUST00000124814 764 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Ctnna3Q65CL1 Gm2117-201ENSMUST00000130478 764 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Ctnna3Q65CL1 Gm2101-202ENSMUST00000131997 764 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Ctnna3Q65CL1 Gm2165-203ENSMUST00000137981 764 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.1 ms