Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Gm15473-201ENSMUST00000140746 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccdc18Q640L5 Gm26211-201ENSMUST00000158578 129 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccdc18Q640L5 Mir199b-201ENSMUST00000175066 110 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccdc18Q640L5 Gm21560-202ENSMUST00000177670 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccdc18Q640L5 Gm3269-202ENSMUST00000178137 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccdc18Q640L5 Gm3099-202ENSMUST00000178274 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccdc18Q640L5 Gm3642-202ENSMUST00000179296 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccdc18Q640L5 Gm3594-203ENSMUST00000179747 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccdc18Q640L5 1700094M23Rik-201ENSMUST00000197695 695 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccdc18Q640L5 Gm42865-201ENSMUST00000197981 613 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccdc18Q640L5 AC132232.1-201ENSMUST00000214667 1019 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccdc18Q640L5 Tgm4-206ENSMUST00000215247 951 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccdc18Q640L5 Gm26797-203ENSMUST00000216452 706 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccdc18Q640L5 Glipr1l3-201ENSMUST00000220085 892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccdc18Q640L5 Gm46401-201ENSMUST00000221291 1089 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccdc18Q640L5 AC122459.2-201ENSMUST00000227099 638 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccdc18Q640L5 Ctag2-201ENSMUST00000033524 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccdc18Q640L5 Gm45017-201ENSMUST00000206842 1777 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccdc18Q640L5 Pecam1-202ENSMUST00000080853 3283 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccdc18Q640L5 Olfr54-203ENSMUST00000217480 5048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccdc18Q640L5 Slmap-202ENSMUST00000090359 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccdc18Q640L5 Wdfy4-202ENSMUST00000130509 10158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccdc18Q640L5 Ash1l-202ENSMUST00000186583 11644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccdc18Q640L5 Gm5524-201ENSMUST00000185409 2002 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccdc18Q640L5 Gm43681-201ENSMUST00000201581 1903 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccdc18Q640L5 CT025642.2-201ENSMUST00000225009 1649 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccdc18Q640L5 Mcm7-208ENSMUST00000148879 1351 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccdc18Q640L5 Gm7146-201ENSMUST00000116079 739 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccdc18Q640L5 Gm7580-201ENSMUST00000132826 497 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccdc18Q640L5 Rpl28-ps4-201ENSMUST00000170447 377 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccdc18Q640L5 Gm26969-201ENSMUST00000183203 648 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccdc18Q640L5 Gm37609-201ENSMUST00000191778 678 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccdc18Q640L5 Gm2453-201ENSMUST00000193383 357 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccdc18Q640L5 A830029E22Rik-201ENSMUST00000193672 1194 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccdc18Q640L5 Pilrb2-202ENSMUST00000196162 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccdc18Q640L5 Trav23-201ENSMUST00000199137 347 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccdc18Q640L5 Gm42886-201ENSMUST00000199214 466 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccdc18Q640L5 Gm45069-201ENSMUST00000208604 317 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccdc18Q640L5 Vmn1r11-201ENSMUST00000071304 900 ntAPPRIS P2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccdc18Q640L5 Spag17os-202ENSMUST00000145279 3219 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccdc18Q640L5 Rab1a-206ENSMUST00000163483 2657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccdc18Q640L5 4930545L23Rik-201ENSMUST00000138303 2502 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccdc18Q640L5 Vmn1r51-208ENSMUST00000227876 4160 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccdc18Q640L5 Rassf9-202ENSMUST00000219445 5294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccdc18Q640L5 Gm38028-201ENSMUST00000193309 2169 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccdc18Q640L5 Cyp2b23-201ENSMUST00000077356 2189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccdc18Q640L5 D030045P18Rik-203ENSMUST00000214947 1938 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccdc18Q640L5 Gm11217-201ENSMUST00000141162 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccdc18Q640L5 Aspa-201ENSMUST00000021119 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccdc18Q640L5 4732416N19Rik-201ENSMUST00000203932 3479 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccdc18Q640L5 Gm5949-201ENSMUST00000213468 1421 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccdc18Q640L5 Gm28587-201ENSMUST00000187181 3005 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccdc18Q640L5 Olfr1362-201ENSMUST00000051874 3045 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccdc18Q640L5 Gm23910-201ENSMUST00000104597 132 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccdc18Q640L5 Smim24-202ENSMUST00000118206 949 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccdc18Q640L5 Gm23995-201ENSMUST00000158060 129 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccdc18Q640L5 1700120O09Rik-201ENSMUST00000177127 977 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccdc18Q640L5 Ighv5-3-201ENSMUST00000195336 322 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccdc18Q640L5 Gm44553-201ENSMUST00000206316 2037 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccdc18Q640L5 Slc22a19-201ENSMUST00000025666 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccdc18Q640L5 Gprasp1-206ENSMUST00000166554 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccdc18Q640L5 Smc5-201ENSMUST00000087556 5683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Ccdc18Q640L5 Mtif2-201ENSMUST00000020749 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc18Q640L5 St18-212ENSMUST00000151281 3533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Ccdc18Q640L5 Gm15462-201ENSMUST00000133653 4580 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Ccdc18Q640L5 Mob1b-202ENSMUST00000113229 8967 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc18Q640L5 Cep85-202ENSMUST00000121566 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc18Q640L5 Zfp37-204ENSMUST00000220873 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc18Q640L5 Clrn1-202ENSMUST00000055636 3083 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc18Q640L5 Gm42679-201ENSMUST00000197086 2906 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc18Q640L5 Gm2012-202ENSMUST00000163263 892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc18Q640L5 Gm6121-202ENSMUST00000167438 893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc18Q640L5 Znrd1-203ENSMUST00000172823 454 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc18Q640L5 Mir3572-201ENSMUST00000175549 86 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc18Q640L5 Vmn2r-ps131-201ENSMUST00000176094 1046 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc18Q640L5 Gm27219-201ENSMUST00000184633 742 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc18Q640L5 Gm29357-201ENSMUST00000186877 698 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc18Q640L5 Gm8419-201ENSMUST00000189886 412 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc18Q640L5 Gm8009-201ENSMUST00000191672 436 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc18Q640L5 Gm31925-202ENSMUST00000194266 537 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc18Q640L5 Gm4742-201ENSMUST00000200261 771 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc18Q640L5 Ghrl-202ENSMUST00000203363 400 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc18Q640L5 Gm17918-201ENSMUST00000205315 574 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc18Q640L5 AC133207.2-201ENSMUST00000218430 237 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc18Q640L5 AC121788.1-201ENSMUST00000218514 1046 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc18Q640L5 Olfr447-201ENSMUST00000055763 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc18Q640L5 Synj2-204ENSMUST00000115785 3778 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc18Q640L5 Pfkfb3-201ENSMUST00000028114 4712 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc18Q640L5 Gm12021-201ENSMUST00000121061 1746 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc18Q640L5 Tubgcp6-202ENSMUST00000109353 7635 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc18Q640L5 Gm8844-201ENSMUST00000119460 2614 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc18Q640L5 Gm17173-201ENSMUST00000168000 2867 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc18Q640L5 Vmn1r84-204ENSMUST00000227427 2880 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc18Q640L5 Gm29198-201ENSMUST00000190102 1512 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc18Q640L5 Ccdc14-201ENSMUST00000023532 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc18Q640L5 Olfr1232-203ENSMUST00000215679 2389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
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