Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gtpbp4-204ENSMUST00000222098 8783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Mbnl2-202ENSMUST00000167459 4534 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Gm45601-201ENSMUST00000211483 6753 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Atp6v0d2-201ENSMUST00000029900 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Map7d2-201ENSMUST00000043151 3087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Coro2a-203ENSMUST00000107757 4124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Nat8f4-201ENSMUST00000095757 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Gm42577-201ENSMUST00000201367 3211 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Mapk9-204ENSMUST00000109178 1302 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Gm30931-202ENSMUST00000211698 1320 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Trim43b-202ENSMUST00000189557 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Zc4h2-202ENSMUST00000119640 2075 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 AC152922.2-201ENSMUST00000213353 3879 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Fam205a4-201ENSMUST00000108026 4130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Ank3-230ENSMUST00000182795 3557 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Gm23979-201ENSMUST00000104071 128 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Rps12-ps10-201ENSMUST00000117447 399 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Gm15164-201ENSMUST00000122203 271 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Mir1907-201ENSMUST00000122509 90 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Gm16152-201ENSMUST00000131663 872 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Nlrc3-204ENSMUST00000180200 3842 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Scgb1b17-201ENSMUST00000187081 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Scgb1b10-201ENSMUST00000187257 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Scgb1b15-201ENSMUST00000189118 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Gm21301-201ENSMUST00000189476 699 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Gm37189-201ENSMUST00000192131 298 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 AC117240.1-201ENSMUST00000199436 61 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Gm44712-201ENSMUST00000206250 1076 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 311 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Lncbate1-201ENSMUST00000211953 812 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Gm5080-201ENSMUST00000220341 743 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 A1cf-203ENSMUST00000224400 1204 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Olfr933-201ENSMUST00000075680 1003 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Sprr2a3-201ENSMUST00000090872 682 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Rpl29-202ENSMUST00000098994 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Olfr338-201ENSMUST00000072114 5780 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Lilra6-202ENSMUST00000090689 1977 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Tarm1-202ENSMUST00000203020 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Aktip-204ENSMUST00000120426 1687 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Sec24a-201ENSMUST00000038210 3800 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Trim71Q1PSW8 Olfr66-202ENSMUST00000216303 3080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Kif6-207ENSMUST00000162854 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Xpnpep3-203ENSMUST00000163754 5383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Gm42711-201ENSMUST00000197060 2302 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Atf2-203ENSMUST00000100009 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Gm18632-201ENSMUST00000222597 2087 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Olfr671-203ENSMUST00000217091 3225 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Slc6a14-201ENSMUST00000033414 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Tnik-215ENSMUST00000162777 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Clock-205ENSMUST00000202651 9744 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 4930503L19Rik-204ENSMUST00000212155 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Fam90a1b-203ENSMUST00000113903 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Olfr510-202ENSMUST00000213979 2898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 9405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Anks4b-201ENSMUST00000033201 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 BC030870-201ENSMUST00000098713 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Pramel4-202ENSMUST00000091676 2399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Gm37595-201ENSMUST00000192668 1742 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Olfr62-202ENSMUST00000213189 2570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Fmr1-203ENSMUST00000114654 4061 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Mir760-201ENSMUST00000103257 119 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Gm25785-201ENSMUST00000104129 125 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Gm12439-201ENSMUST00000117162 365 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Fabp12-202ENSMUST00000117917 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Top3b-203ENSMUST00000119787 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Mgst1-204ENSMUST00000120302 559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Gm12369-201ENSMUST00000121343 942 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Gm12101-201ENSMUST00000121590 390 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Gm5809-201ENSMUST00000121854 529 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Gm26877-201ENSMUST00000180728 633 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Gm5345-201ENSMUST00000183076 1014 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Nanog-ps2-201ENSMUST00000190988 529 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Gm17895-201ENSMUST00000194028 874 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Gm42580-201ENSMUST00000197223 753 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Gm43091-201ENSMUST00000198157 423 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Gm19088-201ENSMUST00000198800 566 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Gm43089-201ENSMUST00000199162 275 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Zfp799-202ENSMUST00000201499 651 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Gm43459-201ENSMUST00000202093 331 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 1810014B01Rik-204ENSMUST00000218536 204 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Gm7252-201ENSMUST00000223284 456 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 AC154640.1-202ENSMUST00000227828 496 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 AC138765.3-201ENSMUST00000227981 423 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 AC154806.5-204ENSMUST00000228900 867 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Cetn1-201ENSMUST00000062769 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Cct8-203ENSMUST00000175977 1470 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Zdhhc11-201ENSMUST00000091493 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Macrod2os2-201ENSMUST00000143227 3566 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Col6a6-201ENSMUST00000060896 3954 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Afm-202ENSMUST00000128740 2465 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Gdpd4-201ENSMUST00000041860 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Tmem236-201ENSMUST00000077517 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Gm36527-201ENSMUST00000195500 3029 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Rgsl1-203ENSMUST00000141249 1752 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Phxr4-202ENSMUST00000216590 1391 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Ampd1-201ENSMUST00000090715 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 BC080695-201ENSMUST00000105765 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Gm26691-201ENSMUST00000180471 4401 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Mpv17l-203ENSMUST00000128757 3089 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Olfr702-201ENSMUST00000080899 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
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