Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Gm42543-201ENSMUST00000198756 353 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ttc39dQ0VF76 Gm43929-201ENSMUST00000203025 409 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Ttc39dQ0VF76 Gm20136-201ENSMUST00000207501 891 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Ttc39dQ0VF76 Gm6145-202ENSMUST00000210292 787 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ttc39dQ0VF76 Rpl17-ps6-201ENSMUST00000222192 532 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Ttc39dQ0VF76 AC131710.2-201ENSMUST00000226773 683 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Ttc39dQ0VF76 Gm15169-201ENSMUST00000126095 2753 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ttc39dQ0VF76 Olfr195-202ENSMUST00000216957 2077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ttc39dQ0VF76 Gm17173-201ENSMUST00000168000 2867 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ttc39dQ0VF76 Olfr1513-202ENSMUST00000215147 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ttc39dQ0VF76 Olfr645-201ENSMUST00000057104 3677 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ttc39dQ0VF76 Trp63-208ENSMUST00000115310 5366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ttc39dQ0VF76 Vmn1r220-202ENSMUST00000226651 6252 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ttc39dQ0VF76 Gm15448-205ENSMUST00000189095 1905 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ttc39dQ0VF76 Gm28874-201ENSMUST00000190917 3134 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Ttc39dQ0VF76 Ctnna3-202ENSMUST00000105440 3682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ttc39dQ0VF76 Pcdh15-234ENSMUST00000191854 9104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ttc39dQ0VF76 Cntnap3-201ENSMUST00000091554 6344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ttc39dQ0VF76 A430110C17Rik-201ENSMUST00000195666 4348 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Ttc39dQ0VF76 Gm44231-201ENSMUST00000204106 4075 ntBASIC7.02□□□□□ -1.28
Ttc39dQ0VF76 Gm42994-201ENSMUST00000195964 2549 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Gm9839-201ENSMUST00000195252 1437 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Dnah10-203ENSMUST00000141137 13862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Sdcbp-202ENSMUST00000103008 2086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Vmn1r17-203ENSMUST00000228156 2090 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 AC098728.1-202ENSMUST00000226656 2198 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Olfr770-203ENSMUST00000204250 1644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Nexn-201ENSMUST00000046045 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Cfap221-202ENSMUST00000174370 2871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Ighv12-3-201ENSMUST00000103485 353 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Tex35-203ENSMUST00000119526 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Vamp7-ps-201ENSMUST00000120334 655 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 M6pr-ps-201ENSMUST00000120481 830 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 A330102I10Rik-201ENSMUST00000130109 501 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Dcaf1-203ENSMUST00000161758 5539 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Gm20432-201ENSMUST00000173716 250 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 B230104I21Rik-201ENSMUST00000181143 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Rpl31-ps25-201ENSMUST00000181557 379 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Mir8105-201ENSMUST00000184718 89 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Gm27238-201ENSMUST00000185180 417 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Gm28929-201ENSMUST00000185330 1193 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Gm8506-201ENSMUST00000186661 829 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Gm28846-201ENSMUST00000189161 368 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Gm37152-201ENSMUST00000193369 1175 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 4930533L02Rik-201ENSMUST00000194425 1160 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Gm38102-202ENSMUST00000196428 174 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Gm45196-201ENSMUST00000206751 825 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Gm9652-201ENSMUST00000209345 163 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Gm45693-201ENSMUST00000211391 1157 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 AC155270.1-202ENSMUST00000221503 352 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 AC124450.1-201ENSMUST00000225569 495 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Arhgdib-201ENSMUST00000032344 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Olfr410-201ENSMUST00000052254 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Faddos-201ENSMUST00000097928 1053 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Ms4a1-201ENSMUST00000169159 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Gm37216-201ENSMUST00000193817 3478 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Zfp420-201ENSMUST00000057652 2744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Zfp934-208ENSMUST00000222429 1653 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Atp2b4-202ENSMUST00000112264 3324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Clrn3-201ENSMUST00000053716 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Zfp799-205ENSMUST00000202988 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Tns4-201ENSMUST00000017751 4755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Xrn1-201ENSMUST00000034981 5499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 4930422C21Rik-201ENSMUST00000212419 2362 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Gm12258-202ENSMUST00000139337 4100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Gm10610-202ENSMUST00000207184 2693 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Gm37347-201ENSMUST00000193969 3071 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Pcdh15-237ENSMUST00000193361 7881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 AC159624.1-201ENSMUST00000217762 1344 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Lrrc3b-202ENSMUST00000163937 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Gm42613-201ENSMUST00000199975 1931 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Pecam1-204ENSMUST00000106796 3441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 AC153971.1-201ENSMUST00000215097 3811 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 AC159006.2-201ENSMUST00000228734 4144 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Ndnf-201ENSMUST00000054351 10101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Mtus1-201ENSMUST00000051379 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Gm26538-201ENSMUST00000180512 3498 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Trip12-201ENSMUST00000027421 9632 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Sptlc3-201ENSMUST00000047370 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Ptbp3-212ENSMUST00000174586 6640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Pde1a-202ENSMUST00000102651 1673 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Pde1a-201ENSMUST00000090756 1661 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Crtam-203ENSMUST00000180872 4443 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 AC022682.2-202ENSMUST00000224394 3943 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Mettl6-201ENSMUST00000055303 3946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Trbv29-201ENSMUST00000103281 353 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Igkv6-14-201ENSMUST00000103394 347 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Gm3476-201ENSMUST00000112742 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Gm7821-201ENSMUST00000117111 788 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Gm11501-201ENSMUST00000118039 581 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Gm13207-201ENSMUST00000119862 773 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Gm14614-201ENSMUST00000119873 384 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Mgst1-204ENSMUST00000120302 559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Gm13877-201ENSMUST00000120614 417 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Gm14300-201ENSMUST00000120800 946 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Gm15586-201ENSMUST00000121218 528 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Gm11787-201ENSMUST00000121996 1050 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Amy2-ps1-201ENSMUST00000122117 1117 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Selenok-ps1-201ENSMUST00000125204 785 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 St8sia3os-203ENSMUST00000127716 667 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.6 ms