Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Adgrl2-202ENSMUST00000106128 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Top2aQ01320 Pira2-202ENSMUST00000119469 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Top2aQ01320 Mat2a-202ENSMUST00000205335 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Top2aQ01320 Narf-201ENSMUST00000103015 4395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Top2aQ01320 Gm17354-201ENSMUST00000170933 3039 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Top2aQ01320 CT010514.1-201ENSMUST00000214088 2969 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Top2aQ01320 Slc12a1-203ENSMUST00000110495 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Top2aQ01320 Ahcyl2-203ENSMUST00000115238 5129 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Top2aQ01320 Gm12887-201ENSMUST00000106265 360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Top2aQ01320 Gm13890-201ENSMUST00000117578 390 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Top2aQ01320 4933406K04Rik-202ENSMUST00000124363 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Top2aQ01320 Gm27240-201ENSMUST00000183616 677 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Top2aQ01320 Gm37430-201ENSMUST00000193039 196 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Top2aQ01320 Gm20926-201ENSMUST00000194457 696 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Top2aQ01320 Igkv3-8-201ENSMUST00000197635 339 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Top2aQ01320 4930480K02Rik-201ENSMUST00000203679 1054 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Top2aQ01320 Rpl7a-ps14-201ENSMUST00000205097 790 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Top2aQ01320 1700093K21Rik-201ENSMUST00000020527 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Top2aQ01320 Uqcrh-ps1-201ENSMUST00000038391 270 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Top2aQ01320 Olfr516-201ENSMUST00000071410 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Top2aQ01320 1700034E13Rik-201ENSMUST00000091904 439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Top2aQ01320 AW554918-208ENSMUST00000165400 5351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Top2aQ01320 AW554918-202ENSMUST00000097643 5351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Top2aQ01320 Hip1-201ENSMUST00000060311 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Top2aQ01320 Fbxo3-202ENSMUST00000102565 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Top2aQ01320 Acox1-202ENSMUST00000072948 3743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Top2aQ01320 Olfr1380-202ENSMUST00000215360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Top2aQ01320 Vmn1r33-202ENSMUST00000227418 2414 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Top2aQ01320 Ing5-201ENSMUST00000027505 4533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Top2aQ01320 Gria1-204ENSMUST00000151045 5361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Top2aQ01320 Dab2-204ENSMUST00000110664 4450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Top2aQ01320 Srek1ip1-201ENSMUST00000022230 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Top2aQ01320 Ms4a18-201ENSMUST00000177684 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Top2aQ01320 AC158988.1-201ENSMUST00000226731 2624 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Top2aQ01320 Gucy1a3-201ENSMUST00000048976 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Top2aQ01320 Olfr981-202ENSMUST00000215956 8197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Top2aQ01320 Rabep1-202ENSMUST00000081362 2469 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Top2aQ01320 Grik1-210ENSMUST00000228034 2708 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Top2aQ01320 Olfr1170-202ENSMUST00000214386 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Top2aQ01320 Fbxw7-202ENSMUST00000107675 3599 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Top2aQ01320 Gm23910-201ENSMUST00000104597 132 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Top2aQ01320 Gm22342-201ENSMUST00000122647 298 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Top2aQ01320 Gm16164-201ENSMUST00000160078 468 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Top2aQ01320 Rps16-ps3-201ENSMUST00000179126 441 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Top2aQ01320 Gm8506-201ENSMUST00000186661 829 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Top2aQ01320 Scgb1b4-ps-201ENSMUST00000186920 271 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Top2aQ01320 Gm6119-201ENSMUST00000193443 1206 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Top2aQ01320 Gm18290-201ENSMUST00000202900 844 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Top2aQ01320 Gm44366-201ENSMUST00000204933 674 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Top2aQ01320 AC122305.3-201ENSMUST00000214762 361 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Top2aQ01320 AC140288.1-201ENSMUST00000226329 503 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Top2aQ01320 1810011H11Rik-201ENSMUST00000039191 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Top2aQ01320 Sap30bp-203ENSMUST00000140991 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Top2aQ01320 AL450321.1-201ENSMUST00000220600 3550 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Top2aQ01320 Ttc28-201ENSMUST00000040111 10780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Top2aQ01320 Gm18310-201ENSMUST00000206494 3912 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Top2aQ01320 Gm10855-201ENSMUST00000100426 2541 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Top2aQ01320 Flna-203ENSMUST00000114299 8456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Top2aQ01320 Gm43982-201ENSMUST00000204995 1829 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Top2aQ01320 March1-208ENSMUST00000110259 3181 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Top2aQ01320 Cd163-202ENSMUST00000112541 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Top2aQ01320 Pou1f1-204ENSMUST00000176330 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Top2aQ01320 5330409N07Rik-201ENSMUST00000222069 3518 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Top2aQ01320 Trim43c-201ENSMUST00000163255 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Top2aQ01320 Cep85-202ENSMUST00000121566 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Top2aQ01320 Tgfbr1-203ENSMUST00000107725 1713 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Top2aQ01320 Tmigd3-201ENSMUST00000010279 900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Top2aQ01320 Gm14173-201ENSMUST00000117690 278 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Top2aQ01320 D630011A20Rik-201ENSMUST00000180858 500 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Top2aQ01320 Gm37770-201ENSMUST00000192855 772 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Top2aQ01320 4930512P04Rik-201ENSMUST00000197000 424 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Top2aQ01320 Gm18781-201ENSMUST00000211252 924 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Top2aQ01320 AC132232.1-201ENSMUST00000214667 1019 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Top2aQ01320 1190001M18Rik-201ENSMUST00000215937 1270 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Top2aQ01320 AC105950.1-201ENSMUST00000222637 408 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Top2aQ01320 AC139568.1-201ENSMUST00000222878 486 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Top2aQ01320 AC135083.2-201ENSMUST00000228599 1456 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Top2aQ01320 Sis-201ENSMUST00000094190 5887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Top2aQ01320 Zfp455-202ENSMUST00000120861 2712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Top2aQ01320 Gm36011-201ENSMUST00000208671 2719 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Top2aQ01320 Nlrp3-201ENSMUST00000079476 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Top2aQ01320 Wdfy3-205ENSMUST00000174598 10581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Top2aQ01320 CT009696.4-201ENSMUST00000213487 1801 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Top2aQ01320 CAAA01119292.1-201ENSMUST00000226763 2766 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Top2aQ01320 Cyb5r2-201ENSMUST00000052438 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Top2aQ01320 Enpp6-201ENSMUST00000039840 4970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Top2aQ01320 Gm10513-201ENSMUST00000194203 6468 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Top2aQ01320 Lmbrd2-201ENSMUST00000090380 3210 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Top2aQ01320 Gm12388-201ENSMUST00000119112 1887 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Top2aQ01320 Tm4sf1-205ENSMUST00000196979 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Top2aQ01320 Wdr63-201ENSMUST00000160285 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Top2aQ01320 Kcnj15-208ENSMUST00000113862 5705 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Top2aQ01320 4921524L21Rik-201ENSMUST00000044829 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Top2aQ01320 Pcm1-201ENSMUST00000045218 6624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Top2aQ01320 Gm38811-201ENSMUST00000203781 3478 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Top2aQ01320 Eppin-201ENSMUST00000103100 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Top2aQ01320 Ighv1-20-201ENSMUST00000103506 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Top2aQ01320 Trav6-6-201ENSMUST00000103584 344 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Top2aQ01320 Trav6n-5-201ENSMUST00000103611 338 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Top2aQ01320 Amelx-202ENSMUST00000112118 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms