Protein–RNA interactions for Protein: P55066

Ncan, Neurocan core protein, mousemouse

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Length 1,268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcanP55066 Psg22-201ENSMUST00000051973 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
NcanP55066 Gm2762-207ENSMUST00000202739 2665 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
NcanP55066 Gm37735-201ENSMUST00000193995 1406 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
NcanP55066 Olfr1146-ps1-201ENSMUST00000117180 943 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
NcanP55066 Gm12319-201ENSMUST00000131642 357 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
NcanP55066 Gm15265-201ENSMUST00000133494 551 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
NcanP55066 Gm11820-201ENSMUST00000139614 664 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
NcanP55066 Lrrc75aos1-201ENSMUST00000142492 779 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
NcanP55066 Gm13166-203ENSMUST00000144166 326 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
NcanP55066 Gm24179-201ENSMUST00000158925 127 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
NcanP55066 Ulbp1-201ENSMUST00000169796 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
NcanP55066 Gm18700-201ENSMUST00000185791 553 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
NcanP55066 Gm28934-201ENSMUST00000186491 346 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
NcanP55066 AV026068-210ENSMUST00000189169 877 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
NcanP55066 Gm28985-201ENSMUST00000189261 356 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
NcanP55066 Gm18348-201ENSMUST00000191227 820 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
NcanP55066 Gm37024-201ENSMUST00000192224 868 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
NcanP55066 Trav7-1-201ENSMUST00000198019 337 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
NcanP55066 4933401H06Rik-201ENSMUST00000199058 827 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
NcanP55066 Olfr812-202ENSMUST00000203571 1232 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
NcanP55066 Gm18805-201ENSMUST00000206872 655 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
NcanP55066 Mrpl42-203ENSMUST00000218893 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
NcanP55066 AC164567.4-201ENSMUST00000219708 483 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
NcanP55066 Il9-201ENSMUST00000022019 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
NcanP55066 4930529N20Rik-201ENSMUST00000220538 639 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
NcanP55066 Spata9-201ENSMUST00000022081 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
NcanP55066 AV026068-220ENSMUST00000224153 1147 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
NcanP55066 AV026068-224ENSMUST00000224827 928 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
NcanP55066 AC139197.1-201ENSMUST00000228332 813 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
NcanP55066 Gm8256-203ENSMUST00000228692 591 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
NcanP55066 Pifo-202ENSMUST00000066319 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
NcanP55066 Akap7-201ENSMUST00000041984 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
NcanP55066 Cflar-205ENSMUST00000114313 6572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
NcanP55066 9930111J21Rik2-201ENSMUST00000093152 2403 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
NcanP55066 9930111J21Rik1-201ENSMUST00000093153 2403 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
NcanP55066 Zfp14-203ENSMUST00000207873 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
NcanP55066 Brox-201ENSMUST00000057062 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
NcanP55066 Nt5c1b-205ENSMUST00000217944 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
NcanP55066 Gm46123-201ENSMUST00000217447 6424 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
NcanP55066 Slfn9-201ENSMUST00000038211 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
NcanP55066 Abca4-201ENSMUST00000013995 7263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
NcanP55066 Pak7-202ENSMUST00000077200 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
NcanP55066 Gm10513-201ENSMUST00000194203 6468 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
NcanP55066 Naip2-202ENSMUST00000117913 4823 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
NcanP55066 Trim60-201ENSMUST00000048565 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
NcanP55066 4930590J08Rik-203ENSMUST00000205686 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
NcanP55066 Cdc14b-202ENSMUST00000109769 2886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
NcanP55066 Osbpl9-201ENSMUST00000030288 2871 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
NcanP55066 Zfp661-202ENSMUST00000110366 4912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
NcanP55066 Oxsm-203ENSMUST00000112625 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
NcanP55066 Vmn2r88-201ENSMUST00000022438 2574 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
NcanP55066 Inpp5d-208ENSMUST00000167032 4125 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
NcanP55066 Clasp1-218ENSMUST00000190571 7910 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
NcanP55066 Adcy10-202ENSMUST00000111439 5193 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
NcanP55066 C8a-202ENSMUST00000064873 3617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
NcanP55066 Gm39321-201ENSMUST00000216597 2075 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
NcanP55066 Vmn1r44-206ENSMUST00000226760 2070 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.25
NcanP55066 Adarb2-202ENSMUST00000123187 4002 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
NcanP55066 Gm26807-201ENSMUST00000181132 4363 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
NcanP55066 Zc3h12b-201ENSMUST00000082183 2831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
NcanP55066 Olfr523-206ENSMUST00000216023 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
NcanP55066 Mpdz-203ENSMUST00000107262 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
NcanP55066 Map2-205ENSMUST00000114015 5440 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
NcanP55066 Efl1-205ENSMUST00000179489 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
NcanP55066 Gstm7-202ENSMUST00000106687 743 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
NcanP55066 4930402F06Rik-201ENSMUST00000113009 1150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
NcanP55066 Gm12643-201ENSMUST00000116078 374 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
NcanP55066 Gm13033-201ENSMUST00000117591 1057 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
NcanP55066 Gm13114-201ENSMUST00000117605 106 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
NcanP55066 Dnajc5b-203ENSMUST00000118968 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
NcanP55066 Gm5353-201ENSMUST00000139800 793 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
NcanP55066 Gm12409-201ENSMUST00000147231 646 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
NcanP55066 Gm25459-201ENSMUST00000157953 114 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
NcanP55066 Gm27252-201ENSMUST00000183782 689 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
NcanP55066 Gm29586-201ENSMUST00000185225 1104 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
NcanP55066 Gm28253-201ENSMUST00000186071 712 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
NcanP55066 Gm29178-203ENSMUST00000186312 1104 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
NcanP55066 Gm28377-201ENSMUST00000189695 720 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
NcanP55066 Gm29624-202ENSMUST00000190185 1104 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
NcanP55066 Gm29179-209ENSMUST00000190621 1100 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
NcanP55066 A830029E22Rik-201ENSMUST00000193672 1194 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
NcanP55066 Gm17824-201ENSMUST00000197690 805 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
NcanP55066 Gm18007-201ENSMUST00000205019 844 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
NcanP55066 Gm18469-201ENSMUST00000208850 439 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
NcanP55066 4933432G23Rik-201ENSMUST00000213675 840 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
NcanP55066 Cryab-203ENSMUST00000214962 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
NcanP55066 Gm34081-201ENSMUST00000221332 690 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
NcanP55066 Olfr178-201ENSMUST00000058564 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
NcanP55066 Sntn-201ENSMUST00000061045 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
NcanP55066 Gm5142-201ENSMUST00000066558 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
NcanP55066 Gm25587-201ENSMUST00000082498 166 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
NcanP55066 Olfr598-201ENSMUST00000098202 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
NcanP55066 Prl2c3-201ENSMUST00000099805 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
NcanP55066 Mnd1-ps-202ENSMUST00000224435 2574 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
NcanP55066 Tmcc3-203ENSMUST00000117929 3317 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
NcanP55066 Pum1-204ENSMUST00000105991 4614 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
NcanP55066 Dusp3-206ENSMUST00000151678 4084 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
NcanP55066 Erc1-201ENSMUST00000032279 8356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
NcanP55066 Cacna1e-201ENSMUST00000004214 12697 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
NcanP55066 Ccr4-201ENSMUST00000054414 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
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