Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 1700013H16Rik-201ENSMUST00000067940 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Kel-201ENSMUST00000031899 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Gm44104-201ENSMUST00000204736 3777 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 4930431P03Rik-204ENSMUST00000228169 1967 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Zcchc18-201ENSMUST00000033804 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Slfn10-ps-202ENSMUST00000152760 2673 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Gm37984-201ENSMUST00000191641 3733 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 AU015836-202ENSMUST00000121565 2997 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Musk-202ENSMUST00000084578 3347 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Gm28440-201ENSMUST00000186328 1499 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Gm12794-201ENSMUST00000052027 1452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Vmn1r181-204ENSMUST00000227637 4587 ntAPPRIS P1 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Elovl6-201ENSMUST00000071402 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Zfp106-201ENSMUST00000055241 9085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Atp2b4-201ENSMUST00000048953 8292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Cfap69-210ENSMUST00000196165 4408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Olfr1388-202ENSMUST00000215226 3034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Gm31410-201ENSMUST00000217302 4048 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 AC153564.1-201ENSMUST00000217771 3607 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Gm18716-201ENSMUST00000204507 1603 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 9230009I02Rik-201ENSMUST00000101255 1148 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Gm24434-201ENSMUST00000104081 132 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Gstm6-203ENSMUST00000106683 745 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Msn-201ENSMUST00000117399 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Gm13352-201ENSMUST00000117515 262 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Gm14202-201ENSMUST00000120121 311 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Gm16057-201ENSMUST00000120811 759 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Gm12630-201ENSMUST00000121575 784 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 St8sia3os-203ENSMUST00000127716 667 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Gm17217-201ENSMUST00000166613 469 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Fam47e-207ENSMUST00000176621 746 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Rpl31-ps16-201ENSMUST00000181130 376 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 1700064J06Rik-201ENSMUST00000187551 386 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Gm29289-201ENSMUST00000188358 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Gm28985-201ENSMUST00000189261 356 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Gm6693-201ENSMUST00000189583 813 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 4930403P22Rik-201ENSMUST00000192234 713 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Gm19211-201ENSMUST00000200251 1206 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Gm38584-201ENSMUST00000207361 517 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Gm5324-201ENSMUST00000208115 476 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Lncbate1-201ENSMUST00000211953 812 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Gm34574-201ENSMUST00000217795 1240 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 AC140930.1-201ENSMUST00000221889 389 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Snrpd1-201ENSMUST00000002551 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Olfr1307-202ENSMUST00000099606 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 BC051142-203ENSMUST00000114175 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Gm10778-202ENSMUST00000189672 4735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Slc22a6-201ENSMUST00000010250 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Efcab14-201ENSMUST00000074425 4300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Gm18879-201ENSMUST00000221187 1537 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Tbp-211ENSMUST00000162505 12794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Olfr97-206ENSMUST00000216225 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Gm13619-201ENSMUST00000155722 2138 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Zfp473-207ENSMUST00000149011 9230 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Gm45061-201ENSMUST00000204395 2095 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 6720489N17Rik-203ENSMUST00000223338 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Gm37945-201ENSMUST00000192536 4367 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Kirrel3os-201ENSMUST00000066604 3799 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Gm42397-201ENSMUST00000207472 2002 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Agl-203ENSMUST00000159742 4344 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Ctsr-201ENSMUST00000021889 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 4933411E08Rik-201ENSMUST00000217950 1689 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Masp1-201ENSMUST00000089883 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Tlr1-202ENSMUST00000197315 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Gm20075-201ENSMUST00000220449 2161 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 AC174797.5-201ENSMUST00000225055 1860 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Pde10a-207ENSMUST00000115722 3673 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Gm3460-201ENSMUST00000167882 1809 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Ggta1-205ENSMUST00000113002 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Cavin4-201ENSMUST00000030033 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Malat1-201ENSMUST00000172812 6983 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Gm45904-201ENSMUST00000213082 2330 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 AC153955.2-201ENSMUST00000216739 4129 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Gm12262-201ENSMUST00000119915 305 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Gm15122-201ENSMUST00000135434 462 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 4930448H16Rik-201ENSMUST00000159838 580 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Vmn2r-ps37-201ENSMUST00000174682 1044 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Zfp572-202ENSMUST00000184208 1078 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Gm28377-201ENSMUST00000189695 720 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Gm37430-201ENSMUST00000193039 196 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Gm42880-201ENSMUST00000198028 459 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Gm43382-201ENSMUST00000198954 838 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Gm43945-201ENSMUST00000203595 754 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Gm45448-201ENSMUST00000211739 209 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Gm30676-202ENSMUST00000214464 793 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Gm3266-201ENSMUST00000217832 591 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 AC211878.6-201ENSMUST00000221896 358 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 AV026068-216ENSMUST00000223874 328 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 AV026068-218ENSMUST00000223980 575 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 AL669819.1-201ENSMUST00000225143 330 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Vmn1r41-202ENSMUST00000226337 888 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Vmn1r41-203ENSMUST00000226562 1046 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 AC111010.1-203ENSMUST00000227287 1548 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Mep1b-201ENSMUST00000082235 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Cdhr3-201ENSMUST00000095774 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Cntnap3-201ENSMUST00000091554 6344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Zc3h11a-201ENSMUST00000027736 4395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Kat7-201ENSMUST00000072621 3324 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Olfr610-203ENSMUST00000217627 1643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Gm37499-201ENSMUST00000194683 3478 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 139.9 ms