Protein–RNA interactions for Protein: F8VQM8

Xntrpc, Xndc1-transient receptor potential cation channel, subfamily C, member 2 readthrough, mousemouse

Predictions only

Length 1,264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XntrpcF8VQM8 Rab1a-206ENSMUST00000163483 2657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
XntrpcF8VQM8 Tdrkh-207ENSMUST00000197901 2652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
XntrpcF8VQM8 AC160966.1-202ENSMUST00000216860 1318 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
XntrpcF8VQM8 Dnajc18-201ENSMUST00000025208 5169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
XntrpcF8VQM8 Gm24790-201ENSMUST00000104285 132 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
XntrpcF8VQM8 Plscr2-202ENSMUST00000113044 1239 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
XntrpcF8VQM8 Gm13176-201ENSMUST00000117910 477 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
XntrpcF8VQM8 Gm13930-201ENSMUST00000118569 368 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
XntrpcF8VQM8 Gm4992-201ENSMUST00000120256 768 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
XntrpcF8VQM8 Gm13357-201ENSMUST00000120528 537 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
XntrpcF8VQM8 Gm8089-201ENSMUST00000122463 968 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
XntrpcF8VQM8 Hmgb4os-201ENSMUST00000131581 518 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
XntrpcF8VQM8 Gm11820-201ENSMUST00000139614 664 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
XntrpcF8VQM8 4933401B06Rik-202ENSMUST00000142024 1219 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
XntrpcF8VQM8 Gm17046-201ENSMUST00000168078 850 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
XntrpcF8VQM8 1700054K02Rik-201ENSMUST00000181755 376 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
XntrpcF8VQM8 Scgb1b21-202ENSMUST00000182901 278 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
XntrpcF8VQM8 Gm21614-201ENSMUST00000183260 1005 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
XntrpcF8VQM8 Gm27507-201ENSMUST00000184199 93 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
XntrpcF8VQM8 Gm21877-201ENSMUST00000185640 694 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
XntrpcF8VQM8 Mhrt-202ENSMUST00000185798 447 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
XntrpcF8VQM8 Gm6077-201ENSMUST00000196008 499 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
XntrpcF8VQM8 Gm42707-202ENSMUST00000196668 618 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
XntrpcF8VQM8 Trav13n-1-201ENSMUST00000198359 331 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
XntrpcF8VQM8 Gm43124-201ENSMUST00000201878 278 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
XntrpcF8VQM8 Gm45024-201ENSMUST00000208274 623 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
XntrpcF8VQM8 Gm44911-201ENSMUST00000208436 1062 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
XntrpcF8VQM8 Gm7986-201ENSMUST00000221336 551 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
XntrpcF8VQM8 Il20-201ENSMUST00000027673 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
XntrpcF8VQM8 Orm1-201ENSMUST00000030044 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
XntrpcF8VQM8 Sprr2b-201ENSMUST00000061038 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
XntrpcF8VQM8 Fpr2-201ENSMUST00000064068 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
XntrpcF8VQM8 Orm2-201ENSMUST00000075341 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
XntrpcF8VQM8 Sprr2a3-201ENSMUST00000090872 682 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
XntrpcF8VQM8 Urb2-201ENSMUST00000034457 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
XntrpcF8VQM8 Smc1a-201ENSMUST00000045312 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
XntrpcF8VQM8 Ikzf5-201ENSMUST00000046306 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
XntrpcF8VQM8 Mapk10-201ENSMUST00000086854 6630 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
XntrpcF8VQM8 Psg17-201ENSMUST00000004655 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
XntrpcF8VQM8 Crtam-204ENSMUST00000188848 5001 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
XntrpcF8VQM8 Olfr976-204ENSMUST00000217630 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
XntrpcF8VQM8 4930509K18Rik-201ENSMUST00000144039 1810 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
XntrpcF8VQM8 Rgsl1-203ENSMUST00000141249 1752 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
XntrpcF8VQM8 Cyp2c68-201ENSMUST00000099472 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
XntrpcF8VQM8 Pcdhb13-201ENSMUST00000056915 3710 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
XntrpcF8VQM8 Itch-201ENSMUST00000029126 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
XntrpcF8VQM8 4933425L06Rik-201ENSMUST00000022232 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
XntrpcF8VQM8 Psd4-210ENSMUST00000166388 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
XntrpcF8VQM8 Gm9226-201ENSMUST00000188352 3489 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
XntrpcF8VQM8 Psg21-202ENSMUST00000182128 2066 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
XntrpcF8VQM8 Psg21-201ENSMUST00000094793 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
XntrpcF8VQM8 AC210924.1-201ENSMUST00000221183 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
XntrpcF8VQM8 AC121504.1-201ENSMUST00000221385 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
XntrpcF8VQM8 AC139758.3-201ENSMUST00000226853 2704 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
XntrpcF8VQM8 Gm22267-201ENSMUST00000104008 131 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
XntrpcF8VQM8 Gm25785-201ENSMUST00000104129 125 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
XntrpcF8VQM8 Gm12886-201ENSMUST00000106266 1149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
XntrpcF8VQM8 Gm11077-201ENSMUST00000111844 84 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
XntrpcF8VQM8 Gm12135-201ENSMUST00000119170 466 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
XntrpcF8VQM8 Gm15712-201ENSMUST00000120369 1156 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
XntrpcF8VQM8 Gm12531-201ENSMUST00000126099 487 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
XntrpcF8VQM8 Gm14022-201ENSMUST00000143857 691 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
XntrpcF8VQM8 Gm13727-201ENSMUST00000154480 424 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
XntrpcF8VQM8 Ulbp1-201ENSMUST00000169796 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
XntrpcF8VQM8 Gm18808-201ENSMUST00000173316 462 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
XntrpcF8VQM8 Gm20615-201ENSMUST00000177503 705 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
XntrpcF8VQM8 Gm43091-201ENSMUST00000198157 423 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
XntrpcF8VQM8 Pip-202ENSMUST00000203244 736 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
XntrpcF8VQM8 Hddc3-209ENSMUST00000206480 454 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
XntrpcF8VQM8 Smarca2-231ENSMUST00000208091 1140 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
XntrpcF8VQM8 Gm45626-201ENSMUST00000210093 361 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
XntrpcF8VQM8 Olfr291-201ENSMUST00000211582 1159 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
XntrpcF8VQM8 Gm18955-201ENSMUST00000223173 649 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
XntrpcF8VQM8 Cypt1-201ENSMUST00000024026 672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
XntrpcF8VQM8 4930522N08Rik-201ENSMUST00000031274 916 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
XntrpcF8VQM8 Olfr1440-201ENSMUST00000054567 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
XntrpcF8VQM8 Olfr691-201ENSMUST00000057528 969 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
XntrpcF8VQM8 Olfr933-201ENSMUST00000075680 1003 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
XntrpcF8VQM8 Nsun4-202ENSMUST00000030475 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
XntrpcF8VQM8 AC122828.2-201ENSMUST00000222511 2880 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
XntrpcF8VQM8 4930550L24Rik-202ENSMUST00000118305 1684 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
XntrpcF8VQM8 AC156636.1-201ENSMUST00000218639 2229 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
XntrpcF8VQM8 Cep70-201ENSMUST00000093795 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
XntrpcF8VQM8 CT009757.4-201ENSMUST00000221520 2541 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
XntrpcF8VQM8 Trrap-203ENSMUST00000100467 12479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
XntrpcF8VQM8 Trrap-202ENSMUST00000094120 12456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
XntrpcF8VQM8 Itih4-201ENSMUST00000006703 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
XntrpcF8VQM8 Itih4-202ENSMUST00000078490 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
XntrpcF8VQM8 Trim12a-203ENSMUST00000106839 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
XntrpcF8VQM8 Gm10735-201ENSMUST00000099162 2943 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
XntrpcF8VQM8 Ccr2-203ENSMUST00000168841 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
XntrpcF8VQM8 Gm43335-201ENSMUST00000198299 3276 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
XntrpcF8VQM8 Fmr1-204ENSMUST00000114655 4199 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
XntrpcF8VQM8 Krt222-202ENSMUST00000103132 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
XntrpcF8VQM8 Gm43189-201ENSMUST00000196040 3069 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
XntrpcF8VQM8 Gm30329-201ENSMUST00000211572 3077 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
XntrpcF8VQM8 Olfr1500-205ENSMUST00000216287 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
XntrpcF8VQM8 Mum1l1-201ENSMUST00000113041 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
XntrpcF8VQM8 Cep112-202ENSMUST00000106715 1161 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
XntrpcF8VQM8 Gm13598-201ENSMUST00000147939 625 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.9 ms