Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Trps1-204ENSMUST00000183757 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rb1cc1Q9ESK9 Gm44620-201ENSMUST00000209183 2887 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rb1cc1Q9ESK9 Ssr1-201ENSMUST00000021864 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rb1cc1Q9ESK9 Ep400-203ENSMUST00000112435 10420 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rb1cc1Q9ESK9 Gm3286-202ENSMUST00000200932 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rb1cc1Q9ESK9 9330158H04Rik-206ENSMUST00000161161 3103 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rb1cc1Q9ESK9 CT030185.1-201ENSMUST00000222940 2289 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rb1cc1Q9ESK9 Fmo9-202ENSMUST00000148677 2462 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rb1cc1Q9ESK9 Gm32305-201ENSMUST00000221742 1899 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rb1cc1Q9ESK9 Ear1-201ENSMUST00000100691 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rb1cc1Q9ESK9 Ighv1-53-201ENSMUST00000103523 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rb1cc1Q9ESK9 Ighv1-69-201ENSMUST00000103539 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rb1cc1Q9ESK9 4930402F06Rik-201ENSMUST00000113009 1150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15781-201ENSMUST00000120216 323 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rb1cc1Q9ESK9 Gm16269-201ENSMUST00000160532 409 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rb1cc1Q9ESK9 Znrd1-203ENSMUST00000172823 454 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rb1cc1Q9ESK9 Rpl31-ps16-201ENSMUST00000181130 376 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rb1cc1Q9ESK9 Igkv19-93-201ENSMUST00000183936 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rb1cc1Q9ESK9 Gm28998-201ENSMUST00000186194 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rb1cc1Q9ESK9 Gm28576-201ENSMUST00000189007 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rb1cc1Q9ESK9 A830029E22Rik-201ENSMUST00000193672 1194 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rb1cc1Q9ESK9 4933424M12Rik-202ENSMUST00000203451 1100 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rb1cc1Q9ESK9 Gm44795-201ENSMUST00000205496 319 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rb1cc1Q9ESK9 Gm31409-201ENSMUST00000209894 710 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10688-201ENSMUST00000214985 520 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rb1cc1Q9ESK9 AC140409.4-201ENSMUST00000215757 538 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rb1cc1Q9ESK9 Gm3942-201ENSMUST00000218495 666 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rb1cc1Q9ESK9 Gm46401-201ENSMUST00000221291 1089 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rb1cc1Q9ESK9 AC158525.1-201ENSMUST00000223806 576 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rb1cc1Q9ESK9 AC163743.1-201ENSMUST00000224309 270 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rb1cc1Q9ESK9 Cypt4-201ENSMUST00000053956 629 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr195-201ENSMUST00000075381 995 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rb1cc1Q9ESK9 Pard3-220ENSMUST00000162456 3204 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rb1cc1Q9ESK9 Gm33167-201ENSMUST00000201933 2643 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rb1cc1Q9ESK9 Gm42462-201ENSMUST00000196543 1363 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rb1cc1Q9ESK9 Ank3-230ENSMUST00000182795 3557 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rb1cc1Q9ESK9 Vmn2r121-201ENSMUST00000094491 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rb1cc1Q9ESK9 Flna-203ENSMUST00000114299 8456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rb1cc1Q9ESK9 Pln-201ENSMUST00000046221 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rb1cc1Q9ESK9 Bdnf-207ENSMUST00000111047 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rb1cc1Q9ESK9 Adgrl3-206ENSMUST00000118034 4947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rb1cc1Q9ESK9 Arid5b-204ENSMUST00000219238 7581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10184-201ENSMUST00000086423 1939 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rb1cc1Q9ESK9 AC156645.1-201ENSMUST00000223066 5194 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Rb1cc1Q9ESK9 AC125409.2-201ENSMUST00000221888 2158 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Rb1cc1Q9ESK9 2410089E03Rik-201ENSMUST00000110617 10469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rb1cc1Q9ESK9 Ganc-205ENSMUST00000135074 4780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13222-201ENSMUST00000119638 138 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Rb1cc1Q9ESK9 Gm14746-201ENSMUST00000120309 741 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Rb1cc1Q9ESK9 Gm22724-201ENSMUST00000158091 127 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Rb1cc1Q9ESK9 Gm27970-201ENSMUST00000184854 407 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Rb1cc1Q9ESK9 AC153566.2-201ENSMUST00000213841 330 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rb1cc1Q9ESK9 AC115793.1-201ENSMUST00000216605 215 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Rb1cc1Q9ESK9 Ccdc54-201ENSMUST00000062439 1296 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr1447-201ENSMUST00000071484 1113 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rb1cc1Q9ESK9 Vmn1r40-201ENSMUST00000075158 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rb1cc1Q9ESK9 4933404O12Rik-202ENSMUST00000181190 4058 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rb1cc1Q9ESK9 Gm3424-201ENSMUST00000164585 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rb1cc1Q9ESK9 A730017C20Rik-201ENSMUST00000058633 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rb1cc1Q9ESK9 Gabra1-205ENSMUST00000205546 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rb1cc1Q9ESK9 Prdm16-204ENSMUST00000105636 8426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rb1cc1Q9ESK9 Kif9-202ENSMUST00000084952 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rb1cc1Q9ESK9 Card6-201ENSMUST00000118365 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rb1cc1Q9ESK9 Gjc1-203ENSMUST00000107075 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rb1cc1Q9ESK9 A730017C20Rik-203ENSMUST00000118510 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rb1cc1Q9ESK9 Gm7931-201ENSMUST00000121537 271 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Rb1cc1Q9ESK9 1700047A11Rik-201ENSMUST00000144750 427 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rb1cc1Q9ESK9 Gm28237-201ENSMUST00000186563 641 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rb1cc1Q9ESK9 Gm37376-201ENSMUST00000192176 453 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Rb1cc1Q9ESK9 Gm18405-201ENSMUST00000220743 511 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Rb1cc1Q9ESK9 AC124426.2-201ENSMUST00000220886 404 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rb1cc1Q9ESK9 Gm9292-201ENSMUST00000222008 710 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Rb1cc1Q9ESK9 Usp17ld-201ENSMUST00000073394 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr1076-201ENSMUST00000076263 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr826-201ENSMUST00000078322 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rb1cc1Q9ESK9 Gm24454-201ENSMUST00000083349 132 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26163-201ENSMUST00000083792 178 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Rb1cc1Q9ESK9 Alms1-205ENSMUST00000213058 11163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rb1cc1Q9ESK9 Gprasp1-206ENSMUST00000166554 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr1340-204ENSMUST00000217334 2001 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rb1cc1Q9ESK9 Sytl2-207ENSMUST00000190837 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rb1cc1Q9ESK9 A530076I17Rik-202ENSMUST00000228352 1524 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Rb1cc1Q9ESK9 Ing5-201ENSMUST00000027505 4533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12887-201ENSMUST00000106265 360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rb1cc1Q9ESK9 Sub1-202ENSMUST00000110504 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rb1cc1Q9ESK9 Gm25445-201ENSMUST00000158996 299 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rb1cc1Q9ESK9 Mir3572-201ENSMUST00000175549 86 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5947-201ENSMUST00000179156 714 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5645-201ENSMUST00000179597 714 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5990-201ENSMUST00000203126 746 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5886-201ENSMUST00000203420 641 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5886-202ENSMUST00000203957 522 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rb1cc1Q9ESK9 Gm19182-201ENSMUST00000207139 577 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rb1cc1Q9ESK9 Vps50-201ENSMUST00000001412 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp27-206ENSMUST00000172448 2460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rb1cc1Q9ESK9 Gm38386-201ENSMUST00000194293 3421 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rb1cc1Q9ESK9 Cacna1c-210ENSMUST00000187474 6911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rb1cc1Q9ESK9 Gm37783-201ENSMUST00000192025 1856 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rb1cc1Q9ESK9 Ttc38-203ENSMUST00000146088 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rb1cc1Q9ESK9 Gria1-204ENSMUST00000151045 5361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms