Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 1700048P04Rik-201ENSMUST00000219825 369 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Uqcrh-ps1-201ENSMUST00000038391 270 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Olfr532-201ENSMUST00000073226 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Daw1-203ENSMUST00000113436 1351 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Gm3555-201ENSMUST00000160287 1395 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Gm42763-201ENSMUST00000199595 2087 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Pcdh19-203ENSMUST00000167944 8407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Map7d2-201ENSMUST00000043151 3087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Ncoa4-202ENSMUST00000163336 4065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Vmn1r51-213ENSMUST00000228880 4353 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Spag17os-202ENSMUST00000145279 3219 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Gm39214-201ENSMUST00000210912 1542 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Gm10825-201ENSMUST00000180537 4478 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Gm26581-201ENSMUST00000181953 4479 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Ctnna3-202ENSMUST00000105440 3682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Olfr62-203ENSMUST00000217013 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Vmn1r51-201ENSMUST00000072859 2567 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Cnot1-203ENSMUST00000211887 8364 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Maml2-201ENSMUST00000034401 2098 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Gm28112-201ENSMUST00000190898 1875 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Serpina7-202ENSMUST00000060824 1895 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 A830082K12Rik-207ENSMUST00000183171 4176 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Gm44777-201ENSMUST00000205941 4052 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Gm43488-201ENSMUST00000198874 2504 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Dnajb7-201ENSMUST00000057236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Myl2-202ENSMUST00000111750 729 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Gm3476-201ENSMUST00000112742 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Gm15149-201ENSMUST00000119370 360 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Gm13373-201ENSMUST00000144634 655 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Gm23903-201ENSMUST00000157566 131 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Gm23386-201ENSMUST00000158585 144 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Gm17140-201ENSMUST00000169163 627 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Gm7008-203ENSMUST00000171356 476 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Gm22548-201ENSMUST00000174899 78 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Scgb1b21-202ENSMUST00000182901 278 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Mir7082-201ENSMUST00000183526 92 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Gm28023-201ENSMUST00000184556 60 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Gm27825-201ENSMUST00000184586 60 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Snurf-201ENSMUST00000194059 216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Igkv4-83-201ENSMUST00000196933 334 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Gm18838-201ENSMUST00000204855 886 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Gm2926-201ENSMUST00000205625 239 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 AC160138.1-201ENSMUST00000217965 588 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 A1cf-203ENSMUST00000224400 1204 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Lalba-201ENSMUST00000023726 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 1700084J12Rik-201ENSMUST00000079057 734 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Olfr1391-202ENSMUST00000215671 3235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Efcab7-201ENSMUST00000097959 1713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Asxl2-201ENSMUST00000092003 11934 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Elavl2-209ENSMUST00000107124 4127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Bbx-205ENSMUST00000114488 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Exoc1-201ENSMUST00000049469 3272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Lrrc6-201ENSMUST00000023006 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Epb41-201ENSMUST00000030739 6565 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Gm21663-201ENSMUST00000196214 2864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Arfgef1-201ENSMUST00000088615 6978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Ank3-207ENSMUST00000181974 3751 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Olfr1348-210ENSMUST00000214383 2582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Cep290-210ENSMUST00000220346 8211 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Zcchc6-201ENSMUST00000071703 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Cfap74-203ENSMUST00000105619 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Tgif1-211ENSMUST00000186358 1455 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 C030029H02Rik-202ENSMUST00000210356 2980 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Sema6a-201ENSMUST00000019791 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Gm21103-201ENSMUST00000112737 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Gm8534-201ENSMUST00000118553 766 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Defb28-201ENSMUST00000121912 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Gm3047-201ENSMUST00000164069 822 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Gm3029-201ENSMUST00000168306 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Vmn2r-ps37-201ENSMUST00000174682 1044 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Gm20475-201ENSMUST00000174884 263 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 1700120O09Rik-201ENSMUST00000177127 977 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Gm43354-201ENSMUST00000196862 346 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 BC024386-204ENSMUST00000209842 688 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Gm45732-201ENSMUST00000212460 586 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 AC163621.3-201ENSMUST00000221738 1033 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 AC154481.1-201ENSMUST00000223532 331 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Olfr282-201ENSMUST00000075851 928 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Agtpbp1-201ENSMUST00000022040 8174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Olfr20-202ENSMUST00000120137 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Gcnt2-202ENSMUST00000069958 3929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Agtpbp1-202ENSMUST00000109830 2879 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Zfp773-202ENSMUST00000211240 4073 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Mapk10-205ENSMUST00000128869 2518 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Gm18409-201ENSMUST00000218988 2506 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Rapgef6-210ENSMUST00000207429 5164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Lpin1-204ENSMUST00000221230 4114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Ints9-201ENSMUST00000043914 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Exd1-203ENSMUST00000171024 5290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 D030034A15Rik-201ENSMUST00000215835 3953 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Klhl23-201ENSMUST00000053087 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Adar-201ENSMUST00000029563 3753 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 U2surp-201ENSMUST00000078374 3520 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Spin4-201ENSMUST00000096367 4173 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Snora35-201ENSMUST00000104579 128 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Gm9112-201ENSMUST00000113610 420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Gm16196-201ENSMUST00000137730 464 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Gm14950-201ENSMUST00000149500 1155 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Gm12867-201ENSMUST00000151216 457 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
OtofQ9ESF1 Cfhr3-201ENSMUST00000170441 1022 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
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