Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Gm18040-201ENSMUST00000217922 827 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Cldn22Q9D7U6 AC079680.1-202ENSMUST00000219835 654 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Cldn22Q9D7U6 Gm7240-202ENSMUST00000221961 353 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Cldn22Q9D7U6 AC091783.3-201ENSMUST00000223969 681 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Cldn22Q9D7U6 AC114008.1-201ENSMUST00000226193 937 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Cldn22Q9D7U6 AC125405.2-201ENSMUST00000227862 383 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Cldn22Q9D7U6 Fsip1-201ENSMUST00000028820 1025 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Cldn22Q9D7U6 Raet1e-201ENSMUST00000065527 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Cldn22Q9D7U6 Gm17728-201ENSMUST00000076982 399 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Cldn22Q9D7U6 Olfr1510-201ENSMUST00000079459 1014 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Cldn22Q9D7U6 Map2-205ENSMUST00000114015 5440 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Cldn22Q9D7U6 Cntrl-204ENSMUST00000113033 1817 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Cldn22Q9D7U6 Olfr472-203ENSMUST00000216937 5392 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Cldn22Q9D7U6 Abca14-201ENSMUST00000084640 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Cldn22Q9D7U6 Slc6a20a-203ENSMUST00000171647 3894 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Cldn22Q9D7U6 Gm28874-201ENSMUST00000190917 3134 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Cldn22Q9D7U6 AC129308.2-203ENSMUST00000224109 2385 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Cldn22Q9D7U6 Il15ra-210ENSMUST00000128156 1624 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Cldn22Q9D7U6 Hrasls-201ENSMUST00000089824 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Cldn22Q9D7U6 AC159006.2-201ENSMUST00000228734 4144 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Cldn22Q9D7U6 4732465J04Rik-202ENSMUST00000187483 2744 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Cldn22Q9D7U6 Gm6710-201ENSMUST00000109011 1445 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Cldn22Q9D7U6 Vmn1r59-201ENSMUST00000074132 1439 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Cldn22Q9D7U6 Gm9049-201ENSMUST00000178998 2409 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Cldn22Q9D7U6 Gm9030-201ENSMUST00000218405 2410 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Cldn22Q9D7U6 Gm32717-201ENSMUST00000219147 2409 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Cldn22Q9D7U6 Gm9029-201ENSMUST00000219232 2410 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Cldn22Q9D7U6 Gm32802-201ENSMUST00000219565 2409 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Cldn22Q9D7U6 Gm9045-201ENSMUST00000219760 2409 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Cldn22Q9D7U6 Pcbp2-201ENSMUST00000077037 2868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Cldn22Q9D7U6 Gm11541-201ENSMUST00000069852 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Cldn22Q9D7U6 Rs1-201ENSMUST00000033650 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Cldn22Q9D7U6 Erbin-202ENSMUST00000053927 6103 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Cldn22Q9D7U6 Smc5-201ENSMUST00000087556 5683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Cldn22Q9D7U6 Gm8700-201ENSMUST00000222187 3054 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Cldn22Q9D7U6 Ccr9-201ENSMUST00000111454 2620 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Cldn22Q9D7U6 Stat4-201ENSMUST00000027277 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Cldn22Q9D7U6 Gm26766-201ENSMUST00000181411 3677 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Cldn22Q9D7U6 Zc3h11a-204ENSMUST00000191896 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Cldn22Q9D7U6 Vmn1r50-202ENSMUST00000089417 2059 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Cldn22Q9D7U6 Pde1c-202ENSMUST00000114327 6821 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Cldn22Q9D7U6 Nlrp1c-ps-201ENSMUST00000171546 3457 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Cldn22Q9D7U6 Gm10840-201ENSMUST00000100326 309 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Cldn22Q9D7U6 Iglc2-201ENSMUST00000103749 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Cldn22Q9D7U6 Cd209d-201ENSMUST00000011445 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Cldn22Q9D7U6 Gm14865-201ENSMUST00000117523 494 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Cldn22Q9D7U6 Gm7494-201ENSMUST00000121248 441 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Cldn22Q9D7U6 Gm4886-201ENSMUST00000121874 1176 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Cldn22Q9D7U6 Gm14847-201ENSMUST00000121978 519 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Cldn22Q9D7U6 Gm12929-201ENSMUST00000122406 370 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Cldn22Q9D7U6 Gm13837-201ENSMUST00000126326 337 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Cldn22Q9D7U6 Spink10-205ENSMUST00000162365 1076 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Cldn22Q9D7U6 Gm3585-201ENSMUST00000173438 875 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Cldn22Q9D7U6 Tnfsf10-202ENSMUST00000174840 989 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Cldn22Q9D7U6 Rian-215ENSMUST00000183180 633 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Cldn22Q9D7U6 Gm29141-201ENSMUST00000190357 882 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Cldn22Q9D7U6 Ccl2-201ENSMUST00000000193 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Cldn22Q9D7U6 Ighv8-3-201ENSMUST00000194985 295 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Cldn22Q9D7U6 Gm42752-201ENSMUST00000198394 1106 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Cldn22Q9D7U6 Gm43141-201ENSMUST00000199695 274 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Cldn22Q9D7U6 Mrln-201ENSMUST00000020090 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Cldn22Q9D7U6 AC154904.1-201ENSMUST00000219510 312 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Cldn22Q9D7U6 AC124489.3-201ENSMUST00000224037 278 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Cldn22Q9D7U6 4930522N08Rik-201ENSMUST00000031274 916 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Cldn22Q9D7U6 AA467197-201ENSMUST00000047498 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Cldn22Q9D7U6 Scimp-201ENSMUST00000074572 617 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
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Cldn22Q9D7U6 Tmod2-206ENSMUST00000215036 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Cldn22Q9D7U6 Gm43557-201ENSMUST00000197100 2370 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Cldn22Q9D7U6 Gm34921-201ENSMUST00000219528 1406 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Cldn22Q9D7U6 Ttk-201ENSMUST00000070326 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Cldn22Q9D7U6 Akr1c20-202ENSMUST00000080361 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Cldn22Q9D7U6 Gm5157-201ENSMUST00000185914 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Cldn22Q9D7U6 Gm20655-202ENSMUST00000181428 2946 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Cldn22Q9D7U6 Gm29017-201ENSMUST00000190598 2092 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Cldn22Q9D7U6 Gm5454-201ENSMUST00000052030 1453 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Cldn22Q9D7U6 Tmcc3-203ENSMUST00000117929 3317 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Cldn22Q9D7U6 Rfx4-205ENSMUST00000166696 3332 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Cldn22Q9D7U6 Gm20749-201ENSMUST00000186319 3492 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Cldn22Q9D7U6 Ntrk3-202ENSMUST00000039438 3977 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Cldn22Q9D7U6 Csmd1-201ENSMUST00000082104 14182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Cldn22Q9D7U6 Olfr1278-203ENSMUST00000213727 6744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Cldn22Q9D7U6 Gm43339-201ENSMUST00000200032 1606 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Cldn22Q9D7U6 Gm43953-201ENSMUST00000203709 2867 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Cldn22Q9D7U6 Gm38381-201ENSMUST00000193594 2275 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Cldn22Q9D7U6 Gm6494-201ENSMUST00000218604 2298 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Cldn22Q9D7U6 Ank3-215ENSMUST00000182269 4411 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Cldn22Q9D7U6 Sbf2-208ENSMUST00000166020 5481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Cldn22Q9D7U6 Ccdc32-202ENSMUST00000110833 732 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Cldn22Q9D7U6 Kat6b-203ENSMUST00000112458 997 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Cldn22Q9D7U6 Lage3-202ENSMUST00000114152 746 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Cldn22Q9D7U6 Rps12-ps7-201ENSMUST00000117169 385 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Cldn22Q9D7U6 Gm13732-201ENSMUST00000117753 535 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Cldn22Q9D7U6 Prkd3-203ENSMUST00000118991 1265 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Cldn22Q9D7U6 Fabp12-203ENSMUST00000119761 548 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Cldn22Q9D7U6 Gm5166-201ENSMUST00000121332 573 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Cldn22Q9D7U6 Gm12175-201ENSMUST00000122081 345 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Cldn22Q9D7U6 Gm7613-201ENSMUST00000139070 487 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
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