Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Traj18-201ENSMUST00000103723 66 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 n-R5s72-201ENSMUST00000104518 119 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Cd209d-201ENSMUST00000011445 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Gm14865-201ENSMUST00000117523 494 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Gm15203-201ENSMUST00000117668 455 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Gm11553-201ENSMUST00000120682 240 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Gm12152-201ENSMUST00000122465 684 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Gm25178-201ENSMUST00000122633 325 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Tctex1d1-203ENSMUST00000125417 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Gm15407-201ENSMUST00000136919 634 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Tbata-208ENSMUST00000143207 982 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Gm13727-201ENSMUST00000154480 424 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Gm23740-201ENSMUST00000157385 100 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Gm6428-201ENSMUST00000161062 345 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Speer1-201ENSMUST00000172106 1123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Gm27018-201ENSMUST00000181136 225 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Mir6973b-201ENSMUST00000184185 80 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Gm29337-201ENSMUST00000185425 284 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 1700012I11Rik-201ENSMUST00000187233 1039 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Gm28425-202ENSMUST00000191542 621 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Gm36935-201ENSMUST00000192526 292 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Gm30708-201ENSMUST00000202183 312 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Ndufa4-204ENSMUST00000204714 452 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Gm38840-201ENSMUST00000204716 843 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Gm31812-201ENSMUST00000210323 1170 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Gm45334-201ENSMUST00000211118 1227 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Gm33838-201ENSMUST00000214038 786 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 CT030709.2-201ENSMUST00000215521 399 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Prss58-201ENSMUST00000063523 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Uqcrh-202ENSMUST00000078676 547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Wdr7-201ENSMUST00000072726 7109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Specc1-201ENSMUST00000049836 6091 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Gm4806-201ENSMUST00000222704 1690 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Zfp113-204ENSMUST00000165640 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Olfr671-203ENSMUST00000217091 3225 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Zscan18-201ENSMUST00000046245 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Dcx-201ENSMUST00000033642 9074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Cdk5rap2-206ENSMUST00000144099 11847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Adam3-209ENSMUST00000171438 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Gm8279-202ENSMUST00000165713 1760 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Gm5795-203ENSMUST00000171150 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Gm28667-201ENSMUST00000189873 2171 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Csde1-201ENSMUST00000029446 4318 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Gm37147-201ENSMUST00000193756 1498 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Itih5-201ENSMUST00000026886 7900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Ccdc7a-201ENSMUST00000095158 1547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Tnik-202ENSMUST00000159308 3831 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Slc26a7-201ENSMUST00000042221 5165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Trrap-203ENSMUST00000100467 12479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Trrap-202ENSMUST00000094120 12456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Plcb1-201ENSMUST00000070724 3853 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Atp6v0d2-201ENSMUST00000029900 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Vwde-201ENSMUST00000054530 3979 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Olfr1386-202ENSMUST00000204518 2553 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Klhl13-203ENSMUST00000115316 3064 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Sp100-212ENSMUST00000153574 1653 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Tmem236-201ENSMUST00000077517 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 C130075A20Rik-201ENSMUST00000198178 4176 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 4933401B06Rik-202ENSMUST00000142024 1219 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Gm12279-201ENSMUST00000142533 294 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 1700129C05Rik-202ENSMUST00000159858 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Gm27653-201ENSMUST00000185037 136 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 1700031M16Rik-205ENSMUST00000189907 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Gm9504-201ENSMUST00000196322 468 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
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Pramef12Q9D2F1 Gm43538-201ENSMUST00000200416 849 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
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Pramef12Q9D2F1 Olfr958-201ENSMUST00000062545 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Gm26807-201ENSMUST00000181132 4363 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Stab2-201ENSMUST00000035288 8228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Gm4221-202ENSMUST00000181765 2988 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
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Pramef12Q9D2F1 Nudt12-201ENSMUST00000025065 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Sh2d4b-201ENSMUST00000070328 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Lilra6-202ENSMUST00000090689 1977 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Cep112it-201ENSMUST00000143781 4813 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Ifi207-202ENSMUST00000127730 3145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Hao2-201ENSMUST00000029464 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Sytl2-203ENSMUST00000107211 3790 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Sytl2-207ENSMUST00000190837 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Slc6a20a-203ENSMUST00000171647 3894 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 BC080695-201ENSMUST00000105765 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Tpk1-203ENSMUST00000114644 2148 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Spam1-203ENSMUST00000202569 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Focad-201ENSMUST00000097992 5791 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 4930579H20Rik-201ENSMUST00000187815 1516 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 AC162301.1-201ENSMUST00000228785 1542 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Ranbp6-201ENSMUST00000099525 4575 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Urb2-201ENSMUST00000034457 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Gm44916-201ENSMUST00000208664 2194 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Gm35850-201ENSMUST00000210956 4653 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Ampd3-201ENSMUST00000005829 4094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Ice2-201ENSMUST00000034761 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Gm17491-201ENSMUST00000180411 2311 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Gm4847-201ENSMUST00000046662 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Cpsf6-201ENSMUST00000069168 6526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Mlip-211ENSMUST00000184415 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Nlrc3-204ENSMUST00000180200 3842 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Gm44275-201ENSMUST00000203442 2519 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Pramef12Q9D2F1 Col6a6-201ENSMUST00000060896 3954 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 266.8 ms