Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR8

Nsmce3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce3Q9CPR8 4930402F06Rik-202ENSMUST00000113010 1372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Nsmce3Q9CPR8 Ccdc186-201ENSMUST00000076085 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Nsmce3Q9CPR8 Gm43029-201ENSMUST00000201829 1535 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Nsmce3Q9CPR8 AC130661.1-201ENSMUST00000218248 1680 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Nsmce3Q9CPR8 Med23-202ENSMUST00000092646 5098 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Nsmce3Q9CPR8 Pcmtd2-202ENSMUST00000108754 3499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Nsmce3Q9CPR8 Gm21122-201ENSMUST00000191548 3452 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Nsmce3Q9CPR8 Efcab2-201ENSMUST00000027775 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Nsmce3Q9CPR8 Matr3-205ENSMUST00000186796 1854 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Nsmce3Q9CPR8 Ranbp17-201ENSMUST00000037522 3950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Nsmce3Q9CPR8 Olfr195-202ENSMUST00000216957 2077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Nsmce3Q9CPR8 Gm6614-202ENSMUST00000181628 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Nsmce3Q9CPR8 Zfp2-202ENSMUST00000109129 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Nsmce3Q9CPR8 Tlr11-201ENSMUST00000063570 2993 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Nsmce3Q9CPR8 Gramd1c-203ENSMUST00000179565 3159 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Nsmce3Q9CPR8 Spata22-201ENSMUST00000117445 3200 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Nsmce3Q9CPR8 1110059G10Rik-201ENSMUST00000035154 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Nsmce3Q9CPR8 Pcdh15-204ENSMUST00000105426 6802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Nsmce3Q9CPR8 Serpina10-201ENSMUST00000044231 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Nsmce3Q9CPR8 Cep112-202ENSMUST00000106715 1161 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Nsmce3Q9CPR8 Prkd3-203ENSMUST00000118991 1265 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Nsmce3Q9CPR8 Gm11581-201ENSMUST00000122024 763 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Nsmce3Q9CPR8 Gm16277-201ENSMUST00000143595 662 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Nsmce3Q9CPR8 Gm7546-201ENSMUST00000146119 966 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Nsmce3Q9CPR8 Nol12-205ENSMUST00000149580 646 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Nsmce3Q9CPR8 2810403D21Rik-207ENSMUST00000152089 852 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Nsmce3Q9CPR8 Gm22730-201ENSMUST00000158085 171 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Nsmce3Q9CPR8 Gm25717-201ENSMUST00000158631 353 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Nsmce3Q9CPR8 Crxos-205ENSMUST00000171280 571 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Nsmce3Q9CPR8 Vmn2r-ps131-201ENSMUST00000176094 1046 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Nsmce3Q9CPR8 Fastkd5-202ENSMUST00000179273 2424 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Nsmce3Q9CPR8 Mir8094-201ENSMUST00000183361 117 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Nsmce3Q9CPR8 Gm5261-201ENSMUST00000185860 713 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Nsmce3Q9CPR8 Gm8883-201ENSMUST00000187594 454 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Nsmce3Q9CPR8 Gm29230-201ENSMUST00000189687 412 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Nsmce3Q9CPR8 B230110G15Rik-201ENSMUST00000190868 772 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Nsmce3Q9CPR8 Gm29072-201ENSMUST00000191149 678 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Nsmce3Q9CPR8 Gm20754-202ENSMUST00000192642 1357 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Nsmce3Q9CPR8 AF067063-202ENSMUST00000195234 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Nsmce3Q9CPR8 C920008G01Rik-201ENSMUST00000196756 380 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Nsmce3Q9CPR8 Gm42823-201ENSMUST00000197975 256 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Nsmce3Q9CPR8 Chil5-203ENSMUST00000200146 1296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Nsmce3Q9CPR8 Gm7663-201ENSMUST00000201151 1240 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Nsmce3Q9CPR8 Gm18484-201ENSMUST00000204389 991 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Nsmce3Q9CPR8 A330076H08Rik-203ENSMUST00000208822 1164 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Nsmce3Q9CPR8 Gm45764-201ENSMUST00000213047 571 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Nsmce3Q9CPR8 Zranb1-205ENSMUST00000215716 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Nsmce3Q9CPR8 Gm18508-201ENSMUST00000215790 1642 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Nsmce3Q9CPR8 Akr1c21-201ENSMUST00000021628 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Nsmce3Q9CPR8 Olfr643-202ENSMUST00000217217 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Nsmce3Q9CPR8 AC151901.1-201ENSMUST00000218274 180 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Nsmce3Q9CPR8 Gm46424-201ENSMUST00000221567 168 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Nsmce3Q9CPR8 Smim15-202ENSMUST00000223808 808 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Nsmce3Q9CPR8 AC130217.2-201ENSMUST00000224009 2990 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Nsmce3Q9CPR8 AC117769.2-201ENSMUST00000224612 469 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Nsmce3Q9CPR8 Cwf19l1-201ENSMUST00000026218 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Nsmce3Q9CPR8 3300002A11Rik-201ENSMUST00000046994 654 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Nsmce3Q9CPR8 Cxcr4-201ENSMUST00000052172 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Nsmce3Q9CPR8 Tas2r130-201ENSMUST00000067597 1090 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Nsmce3Q9CPR8 Ccdc68-202ENSMUST00000080050 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Nsmce3Q9CPR8 Rpp40-201ENSMUST00000171686 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Nsmce3Q9CPR8 Hlcs-209ENSMUST00000228910 4150 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Nsmce3Q9CPR8 Vps50-203ENSMUST00000170873 3687 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Nsmce3Q9CPR8 Abca4-207ENSMUST00000141135 3606 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Nsmce3Q9CPR8 AC159244.3-201ENSMUST00000222887 3153 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Nsmce3Q9CPR8 Gria3-202ENSMUST00000115103 3081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Nsmce3Q9CPR8 Gm10388-201ENSMUST00000205001 2936 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Nsmce3Q9CPR8 Gm30948-201ENSMUST00000195683 4827 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Nsmce3Q9CPR8 Vmn1r181-204ENSMUST00000227637 4587 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Nsmce3Q9CPR8 Cnga1-202ENSMUST00000126799 2061 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Nsmce3Q9CPR8 Gm9603-201ENSMUST00000165814 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Nsmce3Q9CPR8 Gm3542-201ENSMUST00000169362 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Nsmce3Q9CPR8 Olfr259-203ENSMUST00000215828 4095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Nsmce3Q9CPR8 Tial1-211ENSMUST00000165023 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Nsmce3Q9CPR8 Rgs22-203ENSMUST00000172831 4006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Nsmce3Q9CPR8 Ankfy1-206ENSMUST00000155998 8030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Nsmce3Q9CPR8 Sspo-202ENSMUST00000169350 15571 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Nsmce3Q9CPR8 Gm45117-201ENSMUST00000207250 1774 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Nsmce3Q9CPR8 Ctps2-202ENSMUST00000101095 1665 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Nsmce3Q9CPR8 Ano5-202ENSMUST00000207044 3311 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Nsmce3Q9CPR8 4930544L04Rik-202ENSMUST00000211181 3204 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Nsmce3Q9CPR8 Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 9405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Nsmce3Q9CPR8 Nmd3-201ENSMUST00000029358 9135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Nsmce3Q9CPR8 Gm42772-201ENSMUST00000199945 3041 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Nsmce3Q9CPR8 Gm20559-202ENSMUST00000201831 2993 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Nsmce3Q9CPR8 Tmem182-201ENSMUST00000114765 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Nsmce3Q9CPR8 Gm38368-201ENSMUST00000193181 1335 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Nsmce3Q9CPR8 Gm10773-201ENSMUST00000218071 3935 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Nsmce3Q9CPR8 Ighv1-53-201ENSMUST00000103523 351 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Nsmce3Q9CPR8 Ighv1-69-201ENSMUST00000103539 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Nsmce3Q9CPR8 Gm11383-201ENSMUST00000121346 807 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Nsmce3Q9CPR8 Gm23079-201ENSMUST00000157847 117 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Nsmce3Q9CPR8 Gm22948-201ENSMUST00000158561 243 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Nsmce3Q9CPR8 Gm24735-201ENSMUST00000158859 118 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Nsmce3Q9CPR8 Clec2i-204ENSMUST00000160867 933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Nsmce3Q9CPR8 Gm10552-202ENSMUST00000161763 717 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Nsmce3Q9CPR8 Clec2i-205ENSMUST00000162666 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Nsmce3Q9CPR8 Crip3-206ENSMUST00000165993 735 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Nsmce3Q9CPR8 Gm3585-201ENSMUST00000173438 875 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Nsmce3Q9CPR8 Gm2888-202ENSMUST00000178577 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms