Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Mug-ps1-202ENSMUST00000189975 3293 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 A730017C20Rik-201ENSMUST00000058633 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 Gk-206ENSMUST00000142152 4229 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 Sorbs2-207ENSMUST00000130011 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 Ccdc180-204ENSMUST00000178561 5081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 Zc3h12c-202ENSMUST00000213645 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 Smcr8-201ENSMUST00000056907 7391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 Abr-204ENSMUST00000108407 4811 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 Ctnnd1-218ENSMUST00000111692 6170 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 Gm12919-201ENSMUST00000119855 1594 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 Gm13040-201ENSMUST00000094521 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 Sytl2-207ENSMUST00000190837 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 Svil-203ENSMUST00000126977 7907 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 Gm38386-201ENSMUST00000194293 3421 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 Gm33843-201ENSMUST00000219313 1637 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
NischQ80TM9 Gm13222-201ENSMUST00000119638 138 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
NischQ80TM9 n-R5s19-201ENSMUST00000122793 120 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
NischQ80TM9 Gm27167-201ENSMUST00000183752 511 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.22
NischQ80TM9 Ms4a12-201ENSMUST00000186228 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
NischQ80TM9 Gm20770-201ENSMUST00000193474 694 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
NischQ80TM9 Ppp1r36-204ENSMUST00000220187 504 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.22
NischQ80TM9 Olfr826-201ENSMUST00000078322 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
NischQ80TM9 Olfr651-201ENSMUST00000098176 1069 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
NischQ80TM9 Gm10184-201ENSMUST00000086423 1939 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NischQ80TM9 Slc12a1-203ENSMUST00000110495 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NischQ80TM9 Myh8-202ENSMUST00000108685 2306 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NischQ80TM9 Erc2-201ENSMUST00000090302 6083 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NischQ80TM9 Sis-201ENSMUST00000094190 5887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NischQ80TM9 Gm18310-201ENSMUST00000206494 3912 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
NischQ80TM9 Olfr1425-202ENSMUST00000214918 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NischQ80TM9 Itgb8-201ENSMUST00000026360 8403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NischQ80TM9 Gm15638-203ENSMUST00000154775 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NischQ80TM9 Olfr1232-203ENSMUST00000215679 2389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NischQ80TM9 Zfp661-203ENSMUST00000110368 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NischQ80TM9 Gm15158-201ENSMUST00000120577 570 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
NischQ80TM9 1700006E09Rik-203ENSMUST00000176722 608 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NischQ80TM9 Gm19182-201ENSMUST00000207139 577 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
NischQ80TM9 Gm9088-201ENSMUST00000220237 508 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
NischQ80TM9 AC163743.1-201ENSMUST00000224309 270 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
NischQ80TM9 Vmn1r199-203ENSMUST00000227689 5537 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NischQ80TM9 Mroh2a-201ENSMUST00000061013 7526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NischQ80TM9 Ank3-230ENSMUST00000182795 3557 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NischQ80TM9 Wdfy3-205ENSMUST00000174598 10581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NischQ80TM9 Nemp1-201ENSMUST00000048099 6002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NischQ80TM9 Efhb-201ENSMUST00000024725 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NischQ80TM9 Sptbn1-201ENSMUST00000006629 8461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NischQ80TM9 Hmgn3-203ENSMUST00000185315 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NischQ80TM9 Fmo9-202ENSMUST00000148677 2462 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NischQ80TM9 Xlr3b-201ENSMUST00000101486 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NischQ80TM9 Cfap58-201ENSMUST00000066308 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NischQ80TM9 Adgrl3-206ENSMUST00000118034 4947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NischQ80TM9 Mup-ps28-201ENSMUST00000120686 289 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
NischQ80TM9 Gm6472-201ENSMUST00000178147 651 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
NischQ80TM9 Gm18409-202ENSMUST00000220105 529 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
NischQ80TM9 Gm18405-201ENSMUST00000220743 511 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
NischQ80TM9 Olfr523-205ENSMUST00000215785 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NischQ80TM9 CT030185.1-201ENSMUST00000222940 2289 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
NischQ80TM9 Kcnj15-208ENSMUST00000113862 5705 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NischQ80TM9 Ssr1-201ENSMUST00000021864 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NischQ80TM9 Vps50-201ENSMUST00000001412 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NischQ80TM9 Pot1b-201ENSMUST00000086876 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NischQ80TM9 Gm38322-201ENSMUST00000194074 2300 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
NischQ80TM9 Card6-201ENSMUST00000118365 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NischQ80TM9 Gm5512-201ENSMUST00000218013 1353 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
NischQ80TM9 Rab11b-201ENSMUST00000057373 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NischQ80TM9 Gm21655-202ENSMUST00000199295 2975 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NischQ80TM9 Gm21680-201ENSMUST00000200447 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NischQ80TM9 Ttc12-201ENSMUST00000055096 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NischQ80TM9 Zfp445-206ENSMUST00000216063 6189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NischQ80TM9 A730017C20Rik-203ENSMUST00000118510 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NischQ80TM9 Gm15835-201ENSMUST00000127697 356 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NischQ80TM9 Gm25906-201ENSMUST00000158489 126 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
NischQ80TM9 Gm26381-201ENSMUST00000174895 92 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
NischQ80TM9 Gm45411-201ENSMUST00000209647 345 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NischQ80TM9 Gm2996-201ENSMUST00000211398 537 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
NischQ80TM9 AC118476.1-201ENSMUST00000216237 349 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NischQ80TM9 Ctag2-201ENSMUST00000033524 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NischQ80TM9 Olfr137-201ENSMUST00000057394 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NischQ80TM9 n-R5s56-201ENSMUST00000082521 105 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
NischQ80TM9 Gm15448-203ENSMUST00000108620 1828 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NischQ80TM9 Gm42507-201ENSMUST00000201187 2555 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
NischQ80TM9 Nckap5-208ENSMUST00000161954 7090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NischQ80TM9 Akr1c20-201ENSMUST00000078239 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NischQ80TM9 Rufy3-201ENSMUST00000031229 4049 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NischQ80TM9 D630023O14Rik-201ENSMUST00000191913 3099 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
NischQ80TM9 Gm45554-203ENSMUST00000211410 2137 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NischQ80TM9 4930563E22Rik-201ENSMUST00000066087 3313 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
NischQ80TM9 Ttc38-203ENSMUST00000146088 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NischQ80TM9 F830112A20Rik-201ENSMUST00000194249 3552 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
NischQ80TM9 Mroh4-201ENSMUST00000023271 3583 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NischQ80TM9 Pard3-220ENSMUST00000162456 3204 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NischQ80TM9 Gm33167-201ENSMUST00000201933 2643 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
NischQ80TM9 Pkd1l3-201ENSMUST00000057344 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NischQ80TM9 Baz2a-203ENSMUST00000217851 8385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NischQ80TM9 Trmt2b-203ENSMUST00000113252 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NischQ80TM9 Gm24989-201ENSMUST00000104461 88 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
NischQ80TM9 Gm13179-202ENSMUST00000151994 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NischQ80TM9 Gm29353-201ENSMUST00000185801 620 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NischQ80TM9 Gm2225-201ENSMUST00000209570 377 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
NischQ80TM9 Tmem45b-204ENSMUST00000217007 783 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
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