Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Gm42580-201ENSMUST00000197223 753 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Actn1Q7TPR4 Gm19088-201ENSMUST00000198800 566 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Actn1Q7TPR4 Gm44422-201ENSMUST00000204142 1025 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Actn1Q7TPR4 Gm31897-202ENSMUST00000206231 604 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Actn1Q7TPR4 Gm18943-201ENSMUST00000207357 1216 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Actn1Q7TPR4 Gm45485-201ENSMUST00000211229 357 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Actn1Q7TPR4 Gm31036-201ENSMUST00000212925 521 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Actn1Q7TPR4 Ms4a5-201ENSMUST00000067673 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Actn1Q7TPR4 Gm26130-201ENSMUST00000083171 138 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Actn1Q7TPR4 Birc6-204ENSMUST00000182133 14604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Actn1Q7TPR4 Birc6-215ENSMUST00000182597 14649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Actn1Q7TPR4 Birc6-220ENSMUST00000182944 14610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Actn1Q7TPR4 Bbx-205ENSMUST00000114488 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Actn1Q7TPR4 Svil-201ENSMUST00000025079 7433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Actn1Q7TPR4 AC121504.1-201ENSMUST00000221385 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Actn1Q7TPR4 Ogdh-203ENSMUST00000093350 4075 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Actn1Q7TPR4 Klhl13-203ENSMUST00000115316 3064 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Actn1Q7TPR4 Vmn2r118-201ENSMUST00000168440 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Actn1Q7TPR4 Zfp560-201ENSMUST00000068079 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Actn1Q7TPR4 2900079G21Rik-202ENSMUST00000144424 2944 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Actn1Q7TPR4 F830045P16Rik-201ENSMUST00000050309 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Actn1Q7TPR4 Trpm7-201ENSMUST00000028843 6985 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Actn1Q7TPR4 St18-204ENSMUST00000131494 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Actn1Q7TPR4 Heph-201ENSMUST00000033553 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Actn1Q7TPR4 Prokr2-201ENSMUST00000049997 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Actn1Q7TPR4 Gm14849-201ENSMUST00000122293 2846 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Actn1Q7TPR4 Slmap-202ENSMUST00000090359 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Actn1Q7TPR4 Amot-202ENSMUST00000112836 6957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Actn1Q7TPR4 Gm45358-201ENSMUST00000209492 2305 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Actn1Q7TPR4 Kif15-201ENSMUST00000040717 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Actn1Q7TPR4 Gm14513-201ENSMUST00000117403 123 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Actn1Q7TPR4 Gm14375-201ENSMUST00000119490 855 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Actn1Q7TPR4 Hspe1-ps4-201ENSMUST00000119538 286 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Actn1Q7TPR4 Gm11553-201ENSMUST00000120682 240 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Actn1Q7TPR4 Gm6451-201ENSMUST00000121488 717 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Actn1Q7TPR4 Gm12833-201ENSMUST00000136112 477 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Actn1Q7TPR4 Gm25435-201ENSMUST00000158277 267 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Actn1Q7TPR4 Gm17149-201ENSMUST00000164712 375 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Actn1Q7TPR4 Gm26570-201ENSMUST00000180672 342 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Actn1Q7TPR4 Gm8192-201ENSMUST00000182196 958 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Actn1Q7TPR4 Gm27601-201ENSMUST00000184794 127 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Actn1Q7TPR4 2610027F03Rik-201ENSMUST00000185443 530 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Actn1Q7TPR4 Gm5260-201ENSMUST00000186157 949 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Actn1Q7TPR4 Olfr587-ps1-202ENSMUST00000209201 477 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Actn1Q7TPR4 Gm5080-201ENSMUST00000220341 743 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Actn1Q7TPR4 2700062C07Rik-201ENSMUST00000097646 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Actn1Q7TPR4 Gm43181-201ENSMUST00000197001 2072 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Actn1Q7TPR4 Psd3-203ENSMUST00000093468 1739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Actn1Q7TPR4 Chd9-205ENSMUST00000209423 9419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Actn1Q7TPR4 Tmcc3-203ENSMUST00000117929 3317 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Actn1Q7TPR4 Obox4-ps28-201ENSMUST00000175654 1362 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Actn1Q7TPR4 Gm37310-201ENSMUST00000195237 2968 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Actn1Q7TPR4 Gm17529-201ENSMUST00000180738 3093 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Actn1Q7TPR4 Psd3-204ENSMUST00000093469 4351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Actn1Q7TPR4 Gm43873-201ENSMUST00000204505 3938 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Actn1Q7TPR4 Vmn2r105-201ENSMUST00000167382 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Actn1Q7TPR4 Gm14496-201ENSMUST00000071760 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Actn1Q7TPR4 Olfr1155-203ENSMUST00000215903 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Actn1Q7TPR4 Smc1a-201ENSMUST00000045312 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Actn1Q7TPR4 Vcam1-203ENSMUST00000196449 2532 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Actn1Q7TPR4 Gm4513-201ENSMUST00000207881 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Actn1Q7TPR4 Gm4565-201ENSMUST00000208134 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Actn1Q7TPR4 Olfr1285-202ENSMUST00000220153 1430 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Actn1Q7TPR4 Vmn1r59-201ENSMUST00000074132 1439 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Actn1Q7TPR4 Oxgr1-201ENSMUST00000058213 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Actn1Q7TPR4 Rdh11-203ENSMUST00000161204 3262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Actn1Q7TPR4 9930111J21Rik2-202ENSMUST00000101295 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Actn1Q7TPR4 AC117232.2-201ENSMUST00000219469 2917 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Actn1Q7TPR4 Lonrf2-201ENSMUST00000039612 5077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Actn1Q7TPR4 Gm3883-201ENSMUST00000098119 3229 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Actn1Q7TPR4 Gm20043-201ENSMUST00000222267 2565 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Actn1Q7TPR4 AC093022.3-201ENSMUST00000226569 1926 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Actn1Q7TPR4 Fam160a1-201ENSMUST00000094148 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Actn1Q7TPR4 Zc3h11a-204ENSMUST00000191896 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Actn1Q7TPR4 Aph1c-202ENSMUST00000169282 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Actn1Q7TPR4 Igkv15-103-201ENSMUST00000103324 375 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Actn1Q7TPR4 Gm12790-201ENSMUST00000106916 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Actn1Q7TPR4 Gm11799-201ENSMUST00000116110 460 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Actn1Q7TPR4 Gm11462-201ENSMUST00000117749 562 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Actn1Q7TPR4 Gm13772-201ENSMUST00000118431 317 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Actn1Q7TPR4 Tex35-203ENSMUST00000119526 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Actn1Q7TPR4 Gm15158-201ENSMUST00000120577 570 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Actn1Q7TPR4 Gm12279-201ENSMUST00000142533 294 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Actn1Q7TPR4 Sbp-206ENSMUST00000183155 882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Actn1Q7TPR4 Mir7072-201ENSMUST00000184542 60 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Actn1Q7TPR4 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Actn1Q7TPR4 1700108F19Rik-208ENSMUST00000191447 660 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Actn1Q7TPR4 Gm37148-201ENSMUST00000195097 716 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Actn1Q7TPR4 Gm37901-201ENSMUST00000195107 514 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Actn1Q7TPR4 Gm9504-201ENSMUST00000196322 468 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Actn1Q7TPR4 4930572K03Rik-201ENSMUST00000196713 931 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Actn1Q7TPR4 Gm43089-201ENSMUST00000199162 275 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Actn1Q7TPR4 Gm43116-201ENSMUST00000199789 195 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Actn1Q7TPR4 AL713985.1-201ENSMUST00000219030 420 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Actn1Q7TPR4 AC131187.2-201ENSMUST00000223936 994 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Actn1Q7TPR4 Thoc7-209ENSMUST00000225325 765 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Actn1Q7TPR4 AC154640.1-202ENSMUST00000227828 496 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Actn1Q7TPR4 Olfr574-201ENSMUST00000052997 1041 ntAPPRIS P2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Actn1Q7TPR4 Vmn1r73-201ENSMUST00000055070 912 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Actn1Q7TPR4 Mir3068-201ENSMUST00000083004 136 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
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