Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 5031434C07Rik-202ENSMUST00000188014 3244 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Camk2d-205ENSMUST00000106401 3059 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 AC171003.1-201ENSMUST00000221667 1665 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gm24544-201ENSMUST00000103862 110 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gm22778-201ENSMUST00000104090 128 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gm13224-201ENSMUST00000119586 94 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gm15242-201ENSMUST00000122459 283 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Mageb6-ps-201ENSMUST00000126612 1032 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Il4-203ENSMUST00000140684 530 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gm7008-203ENSMUST00000171356 476 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Olfr1089-201ENSMUST00000214317 1118 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 AC166078.1-201ENSMUST00000217211 584 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gm25682-201ENSMUST00000083942 164 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Raet1d-201ENSMUST00000095795 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Olfr703-201ENSMUST00000098142 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gm37786-201ENSMUST00000191714 3225 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Olfr1412-202ENSMUST00000190505 3663 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gm16123-201ENSMUST00000118647 1517 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Slfn4-202ENSMUST00000167596 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 AL670757.1-201ENSMUST00000223668 1959 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gm9519-201ENSMUST00000206108 1337 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Fam107a-203ENSMUST00000121887 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Etv5-203ENSMUST00000168774 3773 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Cyfip2-202ENSMUST00000093166 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Slc6a18-203ENSMUST00000109680 4052 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Sh3rf2-202ENSMUST00000074679 4444 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Pnisr-202ENSMUST00000098238 4407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Pfkfb1-202ENSMUST00000112713 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Trappc8-206ENSMUST00000225661 5191 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Nwd1-209ENSMUST00000228312 10789 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Pclo-201ENSMUST00000030691 20084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Ap1g1-201ENSMUST00000034171 3692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Stat4-201ENSMUST00000027277 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Pcdhb13-201ENSMUST00000056915 3710 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Slc12a6-202ENSMUST00000053666 6060 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Fbxw20-201ENSMUST00000079548 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gm15332-201ENSMUST00000118386 357 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 AI646519-201ENSMUST00000140987 351 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gm17096-201ENSMUST00000172037 733 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Rian-215ENSMUST00000183180 633 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gm28976-201ENSMUST00000188070 144 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gm37328-201ENSMUST00000193191 640 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gm43141-201ENSMUST00000199695 274 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Vmn2r-ps61-201ENSMUST00000207286 889 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 4933432G23Rik-201ENSMUST00000213675 840 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gm46223-201ENSMUST00000215196 675 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gm8058-201ENSMUST00000217247 587 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 AC163684.1-201ENSMUST00000223766 927 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Dgkh-204ENSMUST00000227767 3319 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gm36380-201ENSMUST00000210339 4379 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Mapk10-202ENSMUST00000112846 2617 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Slc25a40-202ENSMUST00000170496 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Elf4-201ENSMUST00000033429 5847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gm13301-201ENSMUST00000121728 2446 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Kif6-207ENSMUST00000162854 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gm44916-201ENSMUST00000208664 2194 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Bbx-205ENSMUST00000114488 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Tmem236-201ENSMUST00000077517 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Snrnp200-201ENSMUST00000103220 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gm6493-201ENSMUST00000159889 1786 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Nlrc5-207ENSMUST00000211816 7578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Map7d2-201ENSMUST00000043151 3087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Svs1-201ENSMUST00000037696 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gm5386-201ENSMUST00000121749 2450 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 BC051142-203ENSMUST00000114175 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gm44889-203ENSMUST00000208346 1589 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Espl1-201ENSMUST00000064924 6630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Abca14-201ENSMUST00000084640 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Trbv23-201ENSMUST00000103279 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Hikeshi-203ENSMUST00000117354 297 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gm15568-201ENSMUST00000118589 1213 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gm12808-201ENSMUST00000120597 404 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gm14380-201ENSMUST00000122298 431 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gm12088-201ENSMUST00000137364 520 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Sox5os3-202ENSMUST00000154167 765 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gm25271-201ENSMUST00000157273 290 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gm8032-201ENSMUST00000171009 574 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Mlip-214ENSMUST00000185039 1295 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gm5372-201ENSMUST00000187540 409 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Zfp799-202ENSMUST00000201499 651 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gm39078-201ENSMUST00000207973 704 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 AC153505.2-201ENSMUST00000217741 277 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 AC139197.1-201ENSMUST00000228332 813 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Prl2a1-201ENSMUST00000023602 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gm24451-201ENSMUST00000083353 133 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Mir337-201ENSMUST00000083592 97 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gm17165-201ENSMUST00000096155 493 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 4930432M17Rik-201ENSMUST00000098646 525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Pecam1-202ENSMUST00000080853 3283 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Grk1-202ENSMUST00000209909 7431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Grk1-201ENSMUST00000033827 7425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Ctnnd1-210ENSMUST00000111684 6021 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Irak3-205ENSMUST00000145665 2869 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Ubr5-204ENSMUST00000226414 8397 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 D930016D06Rik-202ENSMUST00000181620 3805 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gm37216-201ENSMUST00000193817 3478 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gm42658-201ENSMUST00000197199 1575 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Tns4-201ENSMUST00000017751 4755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms