Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Gm23071-201ENSMUST00000158242 115 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 Frmd8os-202ENSMUST00000187697 516 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 Rpap3-ps1-201ENSMUST00000190928 454 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 E230032D23Rik-201ENSMUST00000207189 848 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 Gm19033-201ENSMUST00000208516 964 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 Gm33619-201ENSMUST00000215633 662 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 CT009600.1-201ENSMUST00000228771 337 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 Olfr478-202ENSMUST00000210173 2477 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 Hmgn5-201ENSMUST00000033597 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 Ifi202b-201ENSMUST00000000266 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 Gm37100-201ENSMUST00000193344 1353 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 Tiam1-213ENSMUST00000163370 7255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 Efl1-205ENSMUST00000179489 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 Smad2-201ENSMUST00000025453 2410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 Gm4524-201ENSMUST00000161614 2152 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccdc18Q640L5 Nlrp3-201ENSMUST00000079476 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccdc18Q640L5 Exoc2-201ENSMUST00000021785 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccdc18Q640L5 1110002J07Rik-201ENSMUST00000181710 2229 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccdc18Q640L5 Plec-207ENSMUST00000076442 15439 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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Ccdc18Q640L5 Gm15322-201ENSMUST00000142621 739 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccdc18Q640L5 Gm14457-201ENSMUST00000148069 1161 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccdc18Q640L5 Gm23259-201ENSMUST00000158318 303 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccdc18Q640L5 Gm20506-201ENSMUST00000172952 589 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccdc18Q640L5 1700003I22Rik-201ENSMUST00000186048 424 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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Ccdc18Q640L5 E330011O21Rik-208ENSMUST00000211650 1225 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccdc18Q640L5 1700019A02Rik-201ENSMUST00000072235 646 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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Ccdc18Q640L5 AI427809-203ENSMUST00000123127 2033 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccdc18Q640L5 Gm29824-201ENSMUST00000213183 3285 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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Ccdc18Q640L5 Zbtb18-212ENSMUST00000195612 3790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccdc18Q640L5 Odf2-204ENSMUST00000113756 3826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ccdc18Q640L5 Odf2-206ENSMUST00000113759 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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Ccdc18Q640L5 Sorbs2-202ENSMUST00000067107 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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Ccdc18Q640L5 Gm15956-201ENSMUST00000153352 502 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ccdc18Q640L5 Gm17140-201ENSMUST00000169163 627 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
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Ccdc18Q640L5 Olfr934-201ENSMUST00000074211 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ccdc18Q640L5 Zfp970-201ENSMUST00000099002 794 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ccdc18Q640L5 Gm14391-201ENSMUST00000099028 473 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
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Ccdc18Q640L5 Helz2-202ENSMUST00000108831 10109 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ccdc18Q640L5 Vmn1r33-202ENSMUST00000227418 2414 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ccdc18Q640L5 Olfr1380-202ENSMUST00000215360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ccdc18Q640L5 Hypk-202ENSMUST00000110612 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ccdc18Q640L5 Olfr716-205ENSMUST00000214819 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ccdc18Q640L5 Nhsl2-201ENSMUST00000101339 12971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccdc18Q640L5 Uvssa-204ENSMUST00000202816 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccdc18Q640L5 Trav14n-3-201ENSMUST00000103635 280 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccdc18Q640L5 4930412B13Rik-201ENSMUST00000149239 1276 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccdc18Q640L5 Gm16139-201ENSMUST00000160015 420 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccdc18Q640L5 Gm27972-201ENSMUST00000184720 137 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccdc18Q640L5 Gm38131-201ENSMUST00000192449 430 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccdc18Q640L5 Gm37493-201ENSMUST00000193167 433 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccdc18Q640L5 Gm8930-201ENSMUST00000201693 768 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccdc18Q640L5 Cx3cl1-205ENSMUST00000211947 377 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccdc18Q640L5 AC135353.1-201ENSMUST00000215330 630 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccdc18Q640L5 AC124426.2-201ENSMUST00000220886 404 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccdc18Q640L5 Gm5142-201ENSMUST00000066558 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccdc18Q640L5 Kif14-201ENSMUST00000047817 8770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccdc18Q640L5 Arfgef1-201ENSMUST00000088615 6978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccdc18Q640L5 Slc7a2-204ENSMUST00000118432 3681 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccdc18Q640L5 Adgrl3-205ENSMUST00000117985 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccdc18Q640L5 Gm37310-201ENSMUST00000195237 2968 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccdc18Q640L5 Depdc5-204ENSMUST00000119705 7929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccdc18Q640L5 Pan2-206ENSMUST00000219721 4316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccdc18Q640L5 Fblim1-201ENSMUST00000006381 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccdc18Q640L5 Pdzd2-201ENSMUST00000075317 10756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccdc18Q640L5 Gm7700-201ENSMUST00000120273 970 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccdc18Q640L5 Gm4789-201ENSMUST00000121708 1216 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Ccdc18Q640L5 Gm11368-201ENSMUST00000139576 609 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
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