Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT53

BB287469, Expressed sequence BB287469, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BB287469Q3UT53 Pknox2-207ENSMUST00000177218 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
BB287469Q3UT53 Cdk5rap2-206ENSMUST00000144099 11847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
BB287469Q3UT53 Zbtb6-201ENSMUST00000053098 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
BB287469Q3UT53 Scfd1-201ENSMUST00000021335 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
BB287469Q3UT53 Kcnb2-202ENSMUST00000175681 3963 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
BB287469Q3UT53 Nol8-203ENSMUST00000221142 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
BB287469Q3UT53 CT025535.2-201ENSMUST00000228572 7441 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
BB287469Q3UT53 Il15ra-217ENSMUST00000148748 1542 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
BB287469Q3UT53 Zfp128-202ENSMUST00000144578 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
BB287469Q3UT53 Gm16427-202ENSMUST00000200745 1749 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
BB287469Q3UT53 Ston1-201ENSMUST00000064035 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
BB287469Q3UT53 Olfr738-202ENSMUST00000214320 2114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
BB287469Q3UT53 Ptk6-201ENSMUST00000016511 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
BB287469Q3UT53 Urb2-201ENSMUST00000034457 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
BB287469Q3UT53 Gm37855-201ENSMUST00000192571 3700 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
BB287469Q3UT53 Gm8246-202ENSMUST00000180788 1753 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BB287469Q3UT53 Gm6093-202ENSMUST00000222963 2163 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
BB287469Q3UT53 Tmem30c-201ENSMUST00000023434 2973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BB287469Q3UT53 Ube4a-204ENSMUST00000138559 3374 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
BB287469Q3UT53 Zc3h11a-201ENSMUST00000027736 4395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
BB287469Q3UT53 Gm42973-201ENSMUST00000197913 3200 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
BB287469Q3UT53 AI182371-207ENSMUST00000226972 1642 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BB287469Q3UT53 Morc1-201ENSMUST00000023330 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
BB287469Q3UT53 Ect2-207ENSMUST00000176242 3985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BB287469Q3UT53 Gm14932-201ENSMUST00000117112 453 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
BB287469Q3UT53 Gm13352-201ENSMUST00000117515 262 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
BB287469Q3UT53 Gm11810-201ENSMUST00000118311 333 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
BB287469Q3UT53 Gm15754-201ENSMUST00000119191 478 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
BB287469Q3UT53 Gm14426-201ENSMUST00000128562 249 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BB287469Q3UT53 AI847159-203ENSMUST00000141786 915 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BB287469Q3UT53 Il1rn-205ENSMUST00000142093 321 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BB287469Q3UT53 Gm15200-201ENSMUST00000149950 410 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BB287469Q3UT53 Gm14009-201ENSMUST00000152439 656 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
BB287469Q3UT53 Iltifb-201ENSMUST00000163808 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
BB287469Q3UT53 Gm17973-201ENSMUST00000174509 520 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
BB287469Q3UT53 Gm20655-201ENSMUST00000176132 473 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BB287469Q3UT53 Gm20625-201ENSMUST00000177065 698 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BB287469Q3UT53 Gm24923-201ENSMUST00000178201 88 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
BB287469Q3UT53 Gm27542-201ENSMUST00000184184 256 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
BB287469Q3UT53 Snhg14-204ENSMUST00000185890 756 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BB287469Q3UT53 Gm3121-201ENSMUST00000187086 406 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
BB287469Q3UT53 Gm5268-201ENSMUST00000189212 940 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
BB287469Q3UT53 Gm29008-201ENSMUST00000189387 298 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
BB287469Q3UT53 Rpap3-ps1-201ENSMUST00000190928 454 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
BB287469Q3UT53 Gm38141-201ENSMUST00000192540 317 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BB287469Q3UT53 Gm37947-201ENSMUST00000192740 894 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BB287469Q3UT53 Gm44356-201ENSMUST00000196731 111 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
BB287469Q3UT53 4930580E04Rik-201ENSMUST00000197377 690 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
BB287469Q3UT53 Gm31306-201ENSMUST00000197517 508 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
BB287469Q3UT53 Gm3103-201ENSMUST00000198073 752 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
BB287469Q3UT53 Trav13n-1-201ENSMUST00000198359 331 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BB287469Q3UT53 Gm43004-201ENSMUST00000201872 703 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
BB287469Q3UT53 Gm42646-201ENSMUST00000202233 914 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
BB287469Q3UT53 Gm18855-201ENSMUST00000206689 570 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
BB287469Q3UT53 4930402F11Rik-202ENSMUST00000207781 1178 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BB287469Q3UT53 Gm31172-201ENSMUST00000210068 321 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BB287469Q3UT53 Olfr563-ps1-201ENSMUST00000210909 873 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
BB287469Q3UT53 Gm45506-201ENSMUST00000211620 280 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
BB287469Q3UT53 Gm7368-201ENSMUST00000213307 367 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
BB287469Q3UT53 F930017D23Rik-202ENSMUST00000213342 2141 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BB287469Q3UT53 AC163621.3-201ENSMUST00000221738 1033 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BB287469Q3UT53 AC118006.3-201ENSMUST00000223948 1176 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
BB287469Q3UT53 AC117656.3-205ENSMUST00000224606 1205 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
BB287469Q3UT53 Cthrc1-204ENSMUST00000226433 596 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
BB287469Q3UT53 AC106830.2-201ENSMUST00000226624 943 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
BB287469Q3UT53 Olfr680-ps1-201ENSMUST00000042676 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BB287469Q3UT53 Gm15421-201ENSMUST00000051985 443 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BB287469Q3UT53 Olfr1321-201ENSMUST00000088876 1056 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BB287469Q3UT53 Gm22444-201ENSMUST00000093693 108 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
BB287469Q3UT53 Gm10704-201ENSMUST00000098952 730 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
BB287469Q3UT53 Samd3-206ENSMUST00000220219 1744 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BB287469Q3UT53 Zfp180-205ENSMUST00000207002 3690 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
BB287469Q3UT53 Vmn1r201-202ENSMUST00000226330 4770 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BB287469Q3UT53 Gm45182-201ENSMUST00000207579 2404 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
BB287469Q3UT53 Gm42942-201ENSMUST00000196086 1328 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
BB287469Q3UT53 Csmd1-201ENSMUST00000082104 14182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
BB287469Q3UT53 Trps1-204ENSMUST00000183757 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
BB287469Q3UT53 Gm37426-201ENSMUST00000195241 2470 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
BB287469Q3UT53 Cept1-201ENSMUST00000039153 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
BB287469Q3UT53 Mbd4-201ENSMUST00000032469 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
BB287469Q3UT53 Slirp-204ENSMUST00000161023 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
BB287469Q3UT53 Ankrd55-203ENSMUST00000165593 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BB287469Q3UT53 Mstn-201ENSMUST00000027269 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
BB287469Q3UT53 Gm43769-201ENSMUST00000201871 4323 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
BB287469Q3UT53 Gm43982-201ENSMUST00000204995 1829 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
BB287469Q3UT53 Gm10637-202ENSMUST00000184702 3233 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
BB287469Q3UT53 Zfp438-201ENSMUST00000063989 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
BB287469Q3UT53 Duxbl3-201ENSMUST00000100804 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
BB287469Q3UT53 Gm29824-201ENSMUST00000213183 3285 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
BB287469Q3UT53 Glrx2-204ENSMUST00000129653 3515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
BB287469Q3UT53 Cytip-201ENSMUST00000028175 6110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
BB287469Q3UT53 Olfr622-204ENSMUST00000216570 2149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
BB287469Q3UT53 Gm37618-201ENSMUST00000192891 3075 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
BB287469Q3UT53 Cmah-208ENSMUST00000224819 9482 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
BB287469Q3UT53 Gm9256-201ENSMUST00000198106 1420 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
BB287469Q3UT53 Kcnmb2-201ENSMUST00000119310 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
BB287469Q3UT53 Panct2-201ENSMUST00000181489 3849 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
BB287469Q3UT53 Pik3r3-201ENSMUST00000030464 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
BB287469Q3UT53 4933416E14Rik-202ENSMUST00000137955 1938 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
BB287469Q3UT53 Armc2-203ENSMUST00000160262 4810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.2 ms