Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 AC140288.1-201ENSMUST00000226329 503 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Irx1P81068 AC165106.1-201ENSMUST00000227580 408 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Irx1P81068 CT025630.2-201ENSMUST00000228293 487 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Irx1P81068 Olfr1364-201ENSMUST00000057453 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Irx1P81068 Gm5321-201ENSMUST00000072050 447 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Irx1P81068 Sry-201ENSMUST00000091178 1188 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Irx1P81068 Gm18701-201ENSMUST00000188281 1536 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Irx1P81068 AC121960.2-201ENSMUST00000227349 3446 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Irx1P81068 AC153962.2-202ENSMUST00000219391 1382 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Irx1P81068 Olfr532-203ENSMUST00000213801 4232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Irx1P81068 1500004A13Rik-203ENSMUST00000183966 3743 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Irx1P81068 Olfr591-202ENSMUST00000216581 4802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Irx1P81068 Kcnj16-205ENSMUST00000178798 3678 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Irx1P81068 Gm10603-202ENSMUST00000184420 4520 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Irx1P81068 Vmn1r31-203ENSMUST00000177318 2076 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Irx1P81068 A930004J17Rik-201ENSMUST00000192689 4610 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Irx1P81068 Zfp607a-202ENSMUST00000205534 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Irx1P81068 Foxp1-206ENSMUST00000113326 7029 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Irx1P81068 Gm18757-201ENSMUST00000207938 3141 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Irx1P81068 Slc24a2-204ENSMUST00000107158 10499 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Irx1P81068 Tex28-202ENSMUST00000114328 1421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Irx1P81068 Gm7945-201ENSMUST00000164948 1428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Irx1P81068 Xpo7-203ENSMUST00000226448 3663 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Irx1P81068 Olfr308-202ENSMUST00000214977 4991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Irx1P81068 Ube2n-201ENSMUST00000099329 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Irx1P81068 Gm44901-201ENSMUST00000208157 3977 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Irx1P81068 Atp12a-201ENSMUST00000007340 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Irx1P81068 Zfp87-204ENSMUST00000181767 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Irx1P81068 P2ry14-203ENSMUST00000196081 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Irx1P81068 Gm25396-201ENSMUST00000103981 133 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Irx1P81068 Kat6b-203ENSMUST00000112458 997 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Irx1P81068 Gm12601-201ENSMUST00000118994 846 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Irx1P81068 Gm17205-201ENSMUST00000168370 1207 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Irx1P81068 Fam47e-207ENSMUST00000176621 746 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Irx1P81068 Gm28610-201ENSMUST00000187716 406 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Irx1P81068 Ighv8-15-201ENSMUST00000197770 294 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Irx1P81068 4930568A13Rik-201ENSMUST00000199961 1061 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Irx1P81068 Gm45198-201ENSMUST00000206796 591 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Irx1P81068 Gm44565-201ENSMUST00000208194 269 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Irx1P81068 Gm45463-202ENSMUST00000210735 1188 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
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Irx1P81068 Gm34654-201ENSMUST00000217012 535 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
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Irx1P81068 Gm29154-253ENSMUST00000217229 1207 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Irx1P81068 AC139568.1-201ENSMUST00000222878 486 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Irx1P81068 Dbi-201ENSMUST00000027634 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
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Irx1P81068 Gm26544-201ENSMUST00000181404 2763 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
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Irx1P81068 4930449A18Rik-201ENSMUST00000094228 2071 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Irx1P81068 Gm43864-201ENSMUST00000204452 4028 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
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Irx1P81068 Slc22a29-201ENSMUST00000113298 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
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Irx1P81068 Cep55-201ENSMUST00000096096 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Irx1P81068 Stc1-201ENSMUST00000014957 4197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Irx1P81068 A2m-201ENSMUST00000032203 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
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Irx1P81068 Wdr12-201ENSMUST00000027173 10012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
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Irx1P81068 Eqtn-202ENSMUST00000107097 1164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
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Irx1P81068 Gm6061-201ENSMUST00000175860 492 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Irx1P81068 Gm23139-201ENSMUST00000179454 132 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Irx1P81068 Gm27026-201ENSMUST00000183003 892 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Irx1P81068 Gm27866-201ENSMUST00000184459 171 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Irx1P81068 Gm18501-201ENSMUST00000185363 664 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
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Irx1P81068 Scgb2b13-ps-201ENSMUST00000190420 328 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Irx1P81068 Gm3841-201ENSMUST00000191399 451 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
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Irx1P81068 2010103J01Rik-201ENSMUST00000192375 388 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Irx1P81068 Gm17833-201ENSMUST00000197629 1065 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Irx1P81068 4933417G07Rik-202ENSMUST00000199732 964 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Irx1P81068 Gm44044-201ENSMUST00000205178 1089 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Irx1P81068 Gm7706-201ENSMUST00000209946 388 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Irx1P81068 Gm45732-201ENSMUST00000212460 586 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Irx1P81068 Gm6667-201ENSMUST00000217169 564 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Irx1P81068 AC131795.1-201ENSMUST00000219632 426 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Irx1P81068 AC079680.1-202ENSMUST00000219835 654 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Irx1P81068 AC130217.2-201ENSMUST00000224009 2990 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Irx1P81068 AC154747.4-201ENSMUST00000224802 903 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Irx1P81068 Bglap3-201ENSMUST00000075523 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Irx1P81068 Olfr282-201ENSMUST00000075851 928 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Irx1P81068 Mcm7-208ENSMUST00000148879 1351 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82 ms