Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Speer4d-202ENSMUST00000119100 857 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Gm12590-201ENSMUST00000134226 404 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 4933411O13Rik-203ENSMUST00000146849 607 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Gm14742-201ENSMUST00000148284 381 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Serpina4-ps1-201ENSMUST00000166601 1287 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Gm26729-201ENSMUST00000180744 352 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Gm28610-201ENSMUST00000187716 406 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Gm29214-201ENSMUST00000190216 570 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 B230112G18Rik-201ENSMUST00000192979 851 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Gm37436-201ENSMUST00000193842 1085 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Gm43192-201ENSMUST00000198002 637 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Vmn2r-ps24-201ENSMUST00000199364 858 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Gm43725-201ENSMUST00000200122 369 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Gm44112-201ENSMUST00000204787 372 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Gm30790-202ENSMUST00000208527 809 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 4933431C10Rik-201ENSMUST00000208973 1266 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Gm45301-201ENSMUST00000211359 933 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Gm18860-201ENSMUST00000212029 764 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Olfr342-202ENSMUST00000216275 3818 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 AC166323.1-201ENSMUST00000217756 367 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 AC118230.1-201ENSMUST00000220196 656 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 AC154517.1-201ENSMUST00000222785 629 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 AC135292.2-201ENSMUST00000227559 367 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 3300002A11Rik-201ENSMUST00000046994 654 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Olfr1364-201ENSMUST00000057453 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Gm22504-201ENSMUST00000082963 139 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 n-R5s60-201ENSMUST00000083299 119 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Serpina1e-201ENSMUST00000085054 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Gm10354-201ENSMUST00000096953 1215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Rbm46-202ENSMUST00000182637 2058 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Gm498-207ENSMUST00000207630 1483 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Nedd9-201ENSMUST00000021794 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Slmap-204ENSMUST00000112330 3962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Amer1-201ENSMUST00000084535 8496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Il18r1-202ENSMUST00000108044 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Mum1l1-202ENSMUST00000113042 4182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Nol8-203ENSMUST00000221142 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 4930544L04Rik-202ENSMUST00000211181 3204 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Rc3h2-201ENSMUST00000100143 8799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Zbtb44-202ENSMUST00000167346 1308 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 AC022682.2-202ENSMUST00000224394 3943 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Ube2n-201ENSMUST00000099329 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Vmn2r97-201ENSMUST00000168710 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Gm30211-201ENSMUST00000197227 3078 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Olfr1293-ps-201ENSMUST00000102551 888 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Btf3l4-202ENSMUST00000102740 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Gm26016-201ENSMUST00000104403 129 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Gm11970-201ENSMUST00000116105 320 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Gm12710-201ENSMUST00000119011 216 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Gm11653-201ENSMUST00000119992 1009 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Gm5039-201ENSMUST00000177747 435 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Gm8332-201ENSMUST00000179468 435 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Gm2035-201ENSMUST00000180053 435 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Pea15b-201ENSMUST00000182806 387 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Gm29483-201ENSMUST00000188188 1078 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Gm28416-201ENSMUST00000188334 292 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Gm2979-201ENSMUST00000193442 463 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
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Sh3bp1P55194 Gm43160-201ENSMUST00000196453 421 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Mark1-ps2-201ENSMUST00000197823 384 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Gm45045-201ENSMUST00000207368 218 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 1700034P13Rik-206ENSMUST00000207445 1146 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Gm35998-201ENSMUST00000212862 838 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 CT030709.2-201ENSMUST00000215521 399 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 CT030166.4-201ENSMUST00000220640 404 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Gm21936-201ENSMUST00000221442 435 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 9430031K09Rik-201ENSMUST00000222913 925 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
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Sh3bp1P55194 Dbi-201ENSMUST00000027634 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
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Sh3bp1P55194 Gm25189-201ENSMUST00000083911 164 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Gm29220-201ENSMUST00000185862 1501 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Gm28966-201ENSMUST00000188951 1501 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Gm5175-201ENSMUST00000218458 1703 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Gm37147-201ENSMUST00000193756 1498 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Ppp1r9a-201ENSMUST00000035813 9547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Grm8-202ENSMUST00000115323 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Zhx1-203ENSMUST00000175805 4839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Zfp27-202ENSMUST00000159920 3381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Wdr35-202ENSMUST00000111113 4312 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Specc1-217ENSMUST00000202905 3841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Olfr1166-201ENSMUST00000099833 1628 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Nlrp1a-201ENSMUST00000048514 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Gm21781-201ENSMUST00000178920 4838 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Hmgn3-203ENSMUST00000185315 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Nipa2-203ENSMUST00000119041 2979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 4933406B17Rik-201ENSMUST00000212602 4333 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Gm6614-203ENSMUST00000181791 2450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Zfp148-ps1-201ENSMUST00000211201 2453 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 4933409F18Rik-202ENSMUST00000222026 1584 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Adgrl3-207ENSMUST00000118078 4871 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Lrrc49-201ENSMUST00000053171 3086 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Scn1a-202ENSMUST00000094951 5946 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 4930579H20Rik-201ENSMUST00000187815 1516 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Tph1-201ENSMUST00000049298 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Sntg1-210ENSMUST00000191683 4510 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Gm44231-201ENSMUST00000204106 4075 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Itpr2-201ENSMUST00000053273 8331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Sh3bp1P55194 Olfr1062-201ENSMUST00000105213 956 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.3 ms