Protein–RNA interactions for Protein: P55066

Ncan, Neurocan core protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcanP55066 Mir3085-201ENSMUST00000175493 89 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
NcanP55066 Gm37604-201ENSMUST00000191749 1272 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
NcanP55066 Gm38250-201ENSMUST00000192691 766 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
NcanP55066 Gm37322-201ENSMUST00000193409 337 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
NcanP55066 1700013M08Rik-201ENSMUST00000197709 683 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
NcanP55066 Gm20223-201ENSMUST00000199932 805 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
NcanP55066 Mageb16-ps2-201ENSMUST00000204513 1093 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
NcanP55066 Gm18103-201ENSMUST00000216621 779 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
NcanP55066 1700007K09Rik-201ENSMUST00000033146 360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
NcanP55066 1700011L22Rik-201ENSMUST00000034109 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
NcanP55066 Gm9800-201ENSMUST00000052615 336 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
NcanP55066 Sprr2b-201ENSMUST00000061038 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
NcanP55066 Gmfg-201ENSMUST00000078845 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
NcanP55066 Mir412-201ENSMUST00000083636 80 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
NcanP55066 Gcm2-201ENSMUST00000021791 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
NcanP55066 Vwde-201ENSMUST00000054530 3979 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
NcanP55066 Gramd2-203ENSMUST00000128944 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
NcanP55066 Tnik-203ENSMUST00000159680 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
NcanP55066 Sorbs2-214ENSMUST00000134675 1692 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
NcanP55066 Inpp5f-203ENSMUST00000118605 3220 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
NcanP55066 Trappc13-201ENSMUST00000022224 2342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
NcanP55066 Olfr701-202ENSMUST00000166880 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
NcanP55066 9330199G10Rik-201ENSMUST00000221601 2072 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
NcanP55066 Gm37647-201ENSMUST00000194556 3143 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
NcanP55066 Myof-201ENSMUST00000041475 6902 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
NcanP55066 BC051142-203ENSMUST00000114175 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
NcanP55066 AC165260.6-206ENSMUST00000223884 3698 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
NcanP55066 Mir124-2hg-201ENSMUST00000185804 3844 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
NcanP55066 Atxn7l1-208ENSMUST00000136644 3155 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
NcanP55066 Dgkh-206ENSMUST00000228362 3308 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
NcanP55066 Smpd4-204ENSMUST00000163476 4532 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
NcanP55066 Tdrkh-207ENSMUST00000197901 2652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
NcanP55066 Gm17203-201ENSMUST00000164379 4017 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
NcanP55066 Gm37924-201ENSMUST00000195470 3647 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
NcanP55066 Pkd1l1-203ENSMUST00000178195 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
NcanP55066 Mospd2-202ENSMUST00000112247 2479 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
NcanP55066 Map1a-201ENSMUST00000094639 11825 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
NcanP55066 Cpa2-201ENSMUST00000096066 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
NcanP55066 Gm42866-201ENSMUST00000195919 3304 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
NcanP55066 Reep3-202ENSMUST00000217841 2925 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
NcanP55066 Pramel4-202ENSMUST00000091676 2399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
NcanP55066 Stat1-201ENSMUST00000070968 5151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
NcanP55066 Igkv6-15-201ENSMUST00000103393 347 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
NcanP55066 Gm23910-201ENSMUST00000104597 132 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
NcanP55066 Gm14352-201ENSMUST00000119250 449 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
NcanP55066 Gm14520-201ENSMUST00000119258 387 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
NcanP55066 Gm11625-201ENSMUST00000119535 296 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
NcanP55066 Gm16144-201ENSMUST00000131093 827 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
NcanP55066 Gm12227-201ENSMUST00000147847 563 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
NcanP55066 Gm14950-201ENSMUST00000149500 1155 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
NcanP55066 Gm16110-201ENSMUST00000161473 892 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
NcanP55066 Stx5a-215ENSMUST00000176570 563 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
NcanP55066 D13Ertd608e-201ENSMUST00000179131 417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
NcanP55066 Gm8321-201ENSMUST00000181691 980 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
NcanP55066 Mir6952-201ENSMUST00000185092 61 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
NcanP55066 Gm9238-201ENSMUST00000196181 329 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
NcanP55066 Gm19185-201ENSMUST00000196365 643 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
NcanP55066 Pvrig-ps-201ENSMUST00000199472 204 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
NcanP55066 Gm4742-201ENSMUST00000200261 771 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
NcanP55066 Gm44287-201ENSMUST00000203069 290 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
NcanP55066 1700110I07Rik-201ENSMUST00000205487 726 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
NcanP55066 Gm31374-202ENSMUST00000214913 914 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
NcanP55066 Olfr809-203ENSMUST00000218237 1100 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
NcanP55066 CT030645.2-201ENSMUST00000224321 1012 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
NcanP55066 Olfr809-201ENSMUST00000059891 1100 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
NcanP55066 Olfr161-201ENSMUST00000061541 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
NcanP55066 Vmn1r202-201ENSMUST00000078642 909 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
NcanP55066 Mir7-2-201ENSMUST00000083675 97 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
NcanP55066 Gm22865-201ENSMUST00000083949 214 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
NcanP55066 Spint3-201ENSMUST00000099097 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
NcanP55066 4930503L19Rik-207ENSMUST00000212982 1415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
NcanP55066 Ankrd6-203ENSMUST00000084749 4573 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
NcanP55066 Pter-203ENSMUST00000134794 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
NcanP55066 Mak-206ENSMUST00000225084 3573 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
NcanP55066 Vmn2r16-201ENSMUST00000165180 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
NcanP55066 Vezt-201ENSMUST00000047711 4479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
NcanP55066 Ggta1-204ENSMUST00000113001 3340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
NcanP55066 Gm29364-201ENSMUST00000185289 2167 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
NcanP55066 Gm28547-201ENSMUST00000186357 2167 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
NcanP55066 Gm29446-201ENSMUST00000190887 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
NcanP55066 Garnl3-201ENSMUST00000049618 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
NcanP55066 Mast4-201ENSMUST00000099202 7709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
NcanP55066 Gm43429-201ENSMUST00000197889 2251 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
NcanP55066 Psg17-201ENSMUST00000004655 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
NcanP55066 AC124516.2-201ENSMUST00000221455 1829 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
NcanP55066 Gm18879-201ENSMUST00000221187 1537 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
NcanP55066 Gm5512-201ENSMUST00000218013 1353 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
NcanP55066 Smarca1-203ENSMUST00000101616 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
NcanP55066 Synpo2-207ENSMUST00000198584 9203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
NcanP55066 B930025P03Rik-201ENSMUST00000207718 3085 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
NcanP55066 Vmn1r181-202ENSMUST00000226843 4496 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
NcanP55066 8030451A03Rik-203ENSMUST00000141428 2618 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
NcanP55066 Pcnx4-201ENSMUST00000044352 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
NcanP55066 Gm13083-201ENSMUST00000105773 2464 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
NcanP55066 Ralgapa1-212ENSMUST00000226244 8841 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
NcanP55066 Uba1y-202ENSMUST00000190013 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
NcanP55066 Mrpl17-202ENSMUST00000124482 7300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
NcanP55066 Gm43335-201ENSMUST00000198299 3276 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
NcanP55066 Psg22-202ENSMUST00000108481 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
NcanP55066 Psg22-203ENSMUST00000208221 1871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms