Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 F930017D23Rik-202ENSMUST00000213342 2141 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Gk-206ENSMUST00000142152 4229 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Zbtb6-201ENSMUST00000053098 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Mroh4-201ENSMUST00000023271 3583 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Gm10687-201ENSMUST00000180670 3233 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Gm15930-201ENSMUST00000156603 2037 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Gm44620-201ENSMUST00000209183 2887 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Trappc2-202ENSMUST00000112194 1418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cux1P53564 BC064078-202ENSMUST00000131176 2299 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Hypk-202ENSMUST00000110612 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Ptrhd1-201ENSMUST00000179139 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Gm15348-201ENSMUST00000151188 3655 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Cdc42bpa-218ENSMUST00000212756 5247 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Gm9603-201ENSMUST00000165814 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Gm3542-201ENSMUST00000169362 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Entpd5-201ENSMUST00000021662 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Fam107a-203ENSMUST00000121887 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Gm13641-201ENSMUST00000117993 473 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Gm16511-201ENSMUST00000120019 564 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Gm16226-203ENSMUST00000161197 395 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Gm6061-201ENSMUST00000175860 492 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Mir7235-201ENSMUST00000183796 56 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Gm38122-201ENSMUST00000192679 885 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Gm37430-201ENSMUST00000193039 196 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Gm42865-201ENSMUST00000197981 613 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Gm44366-201ENSMUST00000204933 674 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Gm35453-201ENSMUST00000210304 331 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Uqcrh-ps1-201ENSMUST00000038391 270 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Olfr714-201ENSMUST00000054629 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Pan2-206ENSMUST00000219721 4316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Slc12a6-202ENSMUST00000053666 6060 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Fbxo3-202ENSMUST00000102565 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Lama3-202ENSMUST00000188815 5551 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Alcam-203ENSMUST00000164728 1885 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Pln-201ENSMUST00000046221 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Kdm4c-201ENSMUST00000030102 4196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Tbc1d8b-201ENSMUST00000096313 5094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cux1P53564 6430584L05Rik-201ENSMUST00000204412 3151 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Hrasls-201ENSMUST00000089824 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Ifi207-202ENSMUST00000127730 3145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Gm8126-201ENSMUST00000169587 1764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Gm5431-203ENSMUST00000109212 3063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Cyp2j7-201ENSMUST00000162514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Gm43719-201ENSMUST00000200088 2199 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Zscan4e-201ENSMUST00000166753 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Igkv16-104-201ENSMUST00000103323 378 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Gm12565-201ENSMUST00000119004 649 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Olfr1199-202ENSMUST00000124021 2967 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cux1P53564 4933406K04Rik-202ENSMUST00000124363 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Gm22530-201ENSMUST00000158820 118 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Gm18833-201ENSMUST00000173218 862 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Gm27854-201ENSMUST00000175578 244 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cux1P53564 D3Ertd751e-212ENSMUST00000194346 744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Gm42753-201ENSMUST00000196718 1268 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Gm5065-202ENSMUST00000207531 807 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cux1P53564 AC079680.1-202ENSMUST00000219835 654 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cux1P53564 AC116591.1-201ENSMUST00000227919 351 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Olfr1307-202ENSMUST00000099606 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Gm26789-201ENSMUST00000181342 2502 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Zfp473-204ENSMUST00000120798 3559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cux1P53564 B020004J07Rik-201ENSMUST00000084386 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Gm12388-201ENSMUST00000119112 1887 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Olfr943-202ENSMUST00000213176 8275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Olfr1380-202ENSMUST00000215360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Piwil2-201ENSMUST00000048129 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Entpd5-202ENSMUST00000072061 4858 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Gm15093-201ENSMUST00000179021 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Srrm4os-201ENSMUST00000126959 3360 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Olfr449-204ENSMUST00000214687 1921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Hmgn5-201ENSMUST00000033597 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cux1P53564 C530043A13Rik-202ENSMUST00000188155 1512 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Lmbrd2-201ENSMUST00000090380 3210 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cux1P53564 AC159195.2-201ENSMUST00000223670 3757 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Adar-201ENSMUST00000029563 3753 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Srek1ip1-201ENSMUST00000022230 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Eppin-201ENSMUST00000103100 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Gm3033-201ENSMUST00000112792 438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Gm13626-201ENSMUST00000119435 402 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Tmem216-205ENSMUST00000145210 774 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Mup7-203ENSMUST00000166098 1033 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Gm9597-201ENSMUST00000171913 602 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Gm20506-201ENSMUST00000172952 589 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cux1P53564 E230032D23Rik-201ENSMUST00000207189 848 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Gm45732-201ENSMUST00000212460 586 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Mup4-201ENSMUST00000075973 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Nckap5-203ENSMUST00000094610 739 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Mup13-202ENSMUST00000098042 984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Bex6-201ENSMUST00000099990 764 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Gm29226-201ENSMUST00000186871 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Utrn-205ENSMUST00000218635 11801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Gm37735-201ENSMUST00000193995 1406 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Pik3r4-201ENSMUST00000065778 4711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Csrnp3-201ENSMUST00000053910 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Vps50-201ENSMUST00000001412 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Gm16204-201ENSMUST00000117864 1897 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Rapgef6-210ENSMUST00000207429 5164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Kcnd2-201ENSMUST00000081542 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Gm43982-201ENSMUST00000204995 1829 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Cux1P53564 Ehf-202ENSMUST00000111174 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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