Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm37294-201ENSMUST00000193461 494 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
RxraP28700 Lamtor3-203ENSMUST00000197064 733 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
RxraP28700 Gm4872-201ENSMUST00000205210 1299 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
RxraP28700 Gm30676-202ENSMUST00000214464 793 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
RxraP28700 AC122486.1-201ENSMUST00000221562 196 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
RxraP28700 AC163684.1-201ENSMUST00000223766 927 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
RxraP28700 A1cf-203ENSMUST00000224400 1204 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
RxraP28700 AC124489.1-201ENSMUST00000225852 526 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
RxraP28700 1700011L22Rik-201ENSMUST00000034109 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
RxraP28700 Sry-201ENSMUST00000091178 1188 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
RxraP28700 Gm14935-201ENSMUST00000121528 1708 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
RxraP28700 Gm44584-201ENSMUST00000208395 2880 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
RxraP28700 Olfr1220-203ENSMUST00000213288 4223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
RxraP28700 4931406B18Rik-201ENSMUST00000013497 3970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
RxraP28700 Scn8a-205ENSMUST00000108910 11232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
RxraP28700 Vmn1r184-203ENSMUST00000227232 8472 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
RxraP28700 Spin4-201ENSMUST00000096367 4173 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
RxraP28700 Cldn12-202ENSMUST00000115445 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
RxraP28700 Cnpy1-205ENSMUST00000141601 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
RxraP28700 Sp100-212ENSMUST00000153574 1653 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
RxraP28700 Trappc13-206ENSMUST00000179891 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
RxraP28700 Utrn-201ENSMUST00000076817 12382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
RxraP28700 AC138765.2-202ENSMUST00000228418 3435 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
RxraP28700 Dock10-209ENSMUST00000190983 6672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
RxraP28700 Xcr1-201ENSMUST00000182350 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
RxraP28700 C430042M11Rik-201ENSMUST00000180515 1617 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
RxraP28700 AC163354.1-201ENSMUST00000220620 1630 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
RxraP28700 Crispld1-202ENSMUST00000159958 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
RxraP28700 C130089K02Rik-201ENSMUST00000194534 6960 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
RxraP28700 Golph3l-201ENSMUST00000060323 2652 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
RxraP28700 Prkd3-208ENSMUST00000168887 5884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
RxraP28700 Vmn1r9-203ENSMUST00000228714 4573 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
RxraP28700 Gm44289-201ENSMUST00000204144 1390 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
RxraP28700 AC114585.1-201ENSMUST00000228080 3680 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
RxraP28700 Olfr99-202ENSMUST00000216328 1778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
RxraP28700 Hnrnpc-207ENSMUST00000227536 1301 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
RxraP28700 Cyp2c67-201ENSMUST00000067328 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
RxraP28700 AC113031.7-201ENSMUST00000228609 1928 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
RxraP28700 Gm5600-202ENSMUST00000211589 2331 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
RxraP28700 Ifi207-202ENSMUST00000127730 3145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
RxraP28700 Cnga1-202ENSMUST00000126799 2061 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
RxraP28700 Gm26893-202ENSMUST00000180965 2079 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
RxraP28700 Gm26552-202ENSMUST00000180980 2079 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
RxraP28700 Gm36186-201ENSMUST00000200820 2052 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
RxraP28700 Dnah10-203ENSMUST00000141137 13862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
RxraP28700 Hsf3-201ENSMUST00000059003 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
RxraP28700 Gm24473-201ENSMUST00000104483 131 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
RxraP28700 Gm14729-201ENSMUST00000118373 689 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
RxraP28700 Gm15129-201ENSMUST00000119673 279 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
RxraP28700 Bud31-201ENSMUST00000159018 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
RxraP28700 Lrmda-203ENSMUST00000159777 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
RxraP28700 Svs6-201ENSMUST00000017144 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
RxraP28700 Smim18-201ENSMUST00000179364 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
RxraP28700 Mir8120-201ENSMUST00000185035 139 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
RxraP28700 Platr10-201ENSMUST00000190602 1026 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
RxraP28700 Gm19124-201ENSMUST00000191041 832 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
RxraP28700 Gm43664-201ENSMUST00000196038 734 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
RxraP28700 Gm19185-201ENSMUST00000196365 643 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
RxraP28700 Gm43057-201ENSMUST00000196789 429 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
RxraP28700 4933432G23Rik-201ENSMUST00000213675 840 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
RxraP28700 Gm19056-201ENSMUST00000218220 797 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
RxraP28700 Olfr108-202ENSMUST00000218675 1038 ntAPPRIS P2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
RxraP28700 AC153821.2-201ENSMUST00000220253 468 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
RxraP28700 Mylf-ps-201ENSMUST00000222174 421 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
RxraP28700 Olfr1448-201ENSMUST00000054737 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.82□□□□□ -1.32
RxraP28700 Olfr1093-201ENSMUST00000055273 969 ntAPPRIS P1 BASIC6.82□□□□□ -1.32
RxraP28700 Tas2r130-201ENSMUST00000067597 1090 ntAPPRIS P1 BASIC6.82□□□□□ -1.32
RxraP28700 Bglap3-201ENSMUST00000075523 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
RxraP28700 Olfr108-201ENSMUST00000078207 1038 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
RxraP28700 Lrrc51-201ENSMUST00000078448 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
RxraP28700 Cd226-202ENSMUST00000097496 911 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
RxraP28700 Wdr12-201ENSMUST00000027173 10012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
RxraP28700 Pum1-202ENSMUST00000097862 3991 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
RxraP28700 Olfr798-202ENSMUST00000204979 3590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
RxraP28700 Gm17039-201ENSMUST00000165145 4901 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
RxraP28700 Mad2l1-202ENSMUST00000116605 7557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
RxraP28700 Mettl6-201ENSMUST00000055303 3946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
RxraP28700 Il15ra-210ENSMUST00000128156 1624 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
RxraP28700 Gm38081-201ENSMUST00000192680 1645 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
RxraP28700 AC122024.1-201ENSMUST00000219276 4850 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
RxraP28700 Fut9-201ENSMUST00000084770 12134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
RxraP28700 Olfr1386-202ENSMUST00000204518 2553 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
RxraP28700 Gramd1b-204ENSMUST00000121357 7334 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
RxraP28700 Ankrd17-205ENSMUST00000197021 8067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
RxraP28700 Gm43187-201ENSMUST00000200652 2397 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
RxraP28700 Celf2-226ENSMUST00000183209 3852 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
RxraP28700 Gm43335-201ENSMUST00000198299 3276 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
RxraP28700 Nlrp1c-ps-202ENSMUST00000174668 3422 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
RxraP28700 Eif3s6-ps4-201ENSMUST00000202873 1388 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
RxraP28700 Catsperg1-201ENSMUST00000047846 3566 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
RxraP28700 Esf1-201ENSMUST00000046030 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
RxraP28700 Msantd4-202ENSMUST00000212075 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
RxraP28700 Ap4e1-201ENSMUST00000002063 4600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
RxraP28700 Tnfsf10-201ENSMUST00000046383 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
RxraP28700 Bcap29-202ENSMUST00000177962 6155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
RxraP28700 Copa-201ENSMUST00000027833 4351 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
RxraP28700 Fancd2-208ENSMUST00000204827 4707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
RxraP28700 Vmn2r-ps54-205ENSMUST00000182110 2587 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
RxraP28700 Gm15228-201ENSMUST00000142044 3440 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
RxraP28700 Gm13416-201ENSMUST00000117264 1612 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
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