Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Gm44861-201ENSMUST00000208325 1220 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Gm32983-201ENSMUST00000208500 505 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Gm45899-201ENSMUST00000212196 1276 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Gm46364-201ENSMUST00000218548 319 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Fkbp1a-ps2-201ENSMUST00000219474 311 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Gm16497-202ENSMUST00000223480 557 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 AC122290.1-201ENSMUST00000225631 1078 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 CT009600.1-201ENSMUST00000228771 337 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Pifo-202ENSMUST00000066319 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Olfr703-201ENSMUST00000098142 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Bcap29-202ENSMUST00000177962 6155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Olfr305-203ENSMUST00000213869 3530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Gm42630-201ENSMUST00000195908 3448 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Vps13a-201ENSMUST00000068156 10838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 AF366264-201ENSMUST00000071308 3157 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Ampd1-202ENSMUST00000155034 2913 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Reep3-202ENSMUST00000217841 2925 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Scd1-201ENSMUST00000041331 4836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 RMST_1.1-210ENSMUST00000219606 2891 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Cnot2-203ENSMUST00000105267 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 AC122356.1-202ENSMUST00000227328 2758 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Magea10-201ENSMUST00000088481 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Mrpl1-202ENSMUST00000117766 3556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Gm38331-201ENSMUST00000195719 2671 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Vmn2r11-201ENSMUST00000164875 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Olfr435-202ENSMUST00000215565 2491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Ccdc66-201ENSMUST00000050480 2457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Gm10773-201ENSMUST00000218071 3935 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Gm39214-201ENSMUST00000210912 1542 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Gm43410-201ENSMUST00000197510 2234 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Kcnu1-202ENSMUST00000120653 1446 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Pde1c-207ENSMUST00000168944 2126 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Itgb3bp-204ENSMUST00000146258 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Gm37772-201ENSMUST00000191635 1394 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Tsga10-201ENSMUST00000041815 3400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Musk-208ENSMUST00000179951 3376 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 AC022775.1-201ENSMUST00000228163 2698 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 AC139750.1-201ENSMUST00000223962 1300 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Ctnna2-206ENSMUST00000162273 3277 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Gm37786-201ENSMUST00000191714 3225 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Snora35-201ENSMUST00000104579 128 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Gm7058-201ENSMUST00000119209 902 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Gm11504-201ENSMUST00000120211 173 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Gm13578-201ENSMUST00000120849 590 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Gm14380-201ENSMUST00000122298 431 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Gm9428-201ENSMUST00000127214 769 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 3100003L05Rik-201ENSMUST00000130240 664 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 B230118H07Rik-209ENSMUST00000160722 931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 BC050972-202ENSMUST00000169153 467 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Gm21756-201ENSMUST00000178380 930 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Gm21405-201ENSMUST00000179024 930 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Speer4c-202ENSMUST00000179506 480 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Gm18700-201ENSMUST00000185791 553 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Gm28998-201ENSMUST00000186194 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Gm21191-201ENSMUST00000186484 930 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Gm28576-201ENSMUST00000189007 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Gm28490-202ENSMUST00000190946 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Gm29503-201ENSMUST00000191044 930 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Gm37705-201ENSMUST00000195111 577 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Gm31861-201ENSMUST00000204563 672 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Gm19195-201ENSMUST00000222018 511 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Lcn9-201ENSMUST00000023978 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Vpreb3-201ENSMUST00000000926 625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Folh1-201ENSMUST00000001824 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Gm10032-201ENSMUST00000071522 1887 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Itk-203ENSMUST00000109237 4268 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Ctage5-223ENSMUST00000219140 4194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Olfr1299-202ENSMUST00000213511 1783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Ston2-201ENSMUST00000052969 9896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Gm43873-201ENSMUST00000204505 3938 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Gm43398-201ENSMUST00000196584 2742 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Glce-203ENSMUST00000185675 4850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Gm14151-201ENSMUST00000109890 2672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 St18-201ENSMUST00000043578 5862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Alkbh8-206ENSMUST00000212294 2584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Haus2-202ENSMUST00000110706 3055 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Gm16123-201ENSMUST00000118647 1517 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Glrx2-204ENSMUST00000129653 3515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Tarm1-202ENSMUST00000203020 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Tmprss11e-201ENSMUST00000161306 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Trdc-201ENSMUST00000196323 3865 ntAPPRIS P1 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Poln-201ENSMUST00000042954 2897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Pex5l-211ENSMUST00000194016 4206 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Plb1-201ENSMUST00000101376 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Mapk10-206ENSMUST00000133069 2732 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Rnf144b-202ENSMUST00000110111 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Olfr90-206ENSMUST00000217397 2680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Sin3a-201ENSMUST00000049169 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Cfap44-201ENSMUST00000099742 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Klrb1-201ENSMUST00000112110 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Kat6b-203ENSMUST00000112458 997 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Gm13983-201ENSMUST00000118018 865 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Gm5401-201ENSMUST00000122444 365 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Fam229b-202ENSMUST00000124941 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 1700091H14Rik-201ENSMUST00000167772 590 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Mir7008-201ENSMUST00000184398 63 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Gm37322-201ENSMUST00000193409 337 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Gm18467-201ENSMUST00000208805 434 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Olfr587-ps1-202ENSMUST00000209201 477 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 4930521O17Rik-201ENSMUST00000219339 491 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 154.1 ms