Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 AC125543.2-201ENSMUST00000222114 105 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 CT030170.7-201ENSMUST00000223372 103 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 5530400C23Rik-201ENSMUST00000048459 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 4930433N12Rik-201ENSMUST00000048921 1204 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Trex1-201ENSMUST00000061973 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Arl9-201ENSMUST00000071199 402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Olfr385-201ENSMUST00000071553 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Olfr1131-201ENSMUST00000090712 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Olfr2-201ENSMUST00000094109 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm10719-201ENSMUST00000099047 681 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Olfr1253-201ENSMUST00000099765 957 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Bex6-201ENSMUST00000099990 764 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Olfr523-204ENSMUST00000214272 3780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Naa11-201ENSMUST00000060265 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Cops2-203ENSMUST00000110463 3392 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm28720-201ENSMUST00000190728 3156 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm38099-201ENSMUST00000193280 3170 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 CT010514.1-201ENSMUST00000214088 2969 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Crb1-202ENSMUST00000196402 2711 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm4951-201ENSMUST00000031549 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm42546-201ENSMUST00000201584 2592 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Arhgap21-210ENSMUST00000154230 6972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 AC164883.2-201ENSMUST00000227931 3815 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Olfr305-204ENSMUST00000216700 3734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Mbd4-201ENSMUST00000032469 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Ppp1r7-201ENSMUST00000027494 10315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm8107-201ENSMUST00000117477 2009 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm10862-201ENSMUST00000193956 3350 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm37968-201ENSMUST00000195131 3201 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Nucb2-203ENSMUST00000183175 1913 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 1700027J07Rik-203ENSMUST00000217501 1884 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Dip2b-201ENSMUST00000023768 4323 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm19176-201ENSMUST00000222149 1831 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Brd8-202ENSMUST00000097626 3005 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 St8sia4-201ENSMUST00000043336 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Chid1-207ENSMUST00000153191 4182 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Ppp1r9a-204ENSMUST00000168998 2966 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Parp8-203ENSMUST00000223949 2965 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 4930453H23Rik-201ENSMUST00000125569 1719 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Aspa-206ENSMUST00000184572 1746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm44581-201ENSMUST00000206227 1693 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Nphp3-207ENSMUST00000194774 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Svs2-202ENSMUST00000109374 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm28999-201ENSMUST00000188063 1498 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm28393-201ENSMUST00000191261 1498 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Adgrd1-203ENSMUST00000156437 4141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Zfp280d-217ENSMUST00000184517 3919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm14879-201ENSMUST00000117308 507 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm11969-201ENSMUST00000118848 356 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm11907-201ENSMUST00000118918 1007 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm15572-201ENSMUST00000119248 593 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Dnase1-202ENSMUST00000120009 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm12123-201ENSMUST00000120348 472 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm13649-201ENSMUST00000122325 606 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm23867-201ENSMUST00000122649 274 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm13480-201ENSMUST00000125095 1000 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm11186-201ENSMUST00000137096 1179 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm12126-201ENSMUST00000147717 619 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm11339-201ENSMUST00000154766 490 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm17129-201ENSMUST00000168168 505 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm20612-201ENSMUST00000176318 236 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
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Hoxd9P28357 Gm6472-201ENSMUST00000178147 651 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
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Hoxd9P28357 Gm5586-201ENSMUST00000206264 795 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 E230032D23Rik-203ENSMUST00000208797 856 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm32486-201ENSMUST00000209810 3816 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm8189-203ENSMUST00000211159 1225 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Olfr369-ps1-201ENSMUST00000212589 836 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm18378-201ENSMUST00000216245 628 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 AC153500.1-201ENSMUST00000219794 625 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 AC132587.1-201ENSMUST00000220562 166 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm40538-201ENSMUST00000220610 578 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm7239-201ENSMUST00000220981 860 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm9628-201ENSMUST00000222169 725 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 AC126554.3-201ENSMUST00000223131 493 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 AC154747.4-202ENSMUST00000223826 852 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 AC154371.1-201ENSMUST00000226600 412 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 AC154806.3-201ENSMUST00000227376 439 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 AC154806.4-201ENSMUST00000227406 439 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Asb12-201ENSMUST00000033549 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Olfr794-201ENSMUST00000059957 963 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Prl7a2-201ENSMUST00000006660 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Olfr195-201ENSMUST00000075381 995 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm10717-201ENSMUST00000075573 684 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm26064-201ENSMUST00000083381 109 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Mir16-2-201ENSMUST00000083672 95 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Ssxb5-201ENSMUST00000089370 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Car1-201ENSMUST00000094365 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Anapc15-ps-201ENSMUST00000099328 426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm14661-201ENSMUST00000152669 2051 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Zc3h12c-201ENSMUST00000165519 6133 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm37159-201ENSMUST00000192720 3605 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
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