Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Gm17995-201ENSMUST00000209266 530 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
P10404 Gm34623-201ENSMUST00000210900 977 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
P10404 Erc2-213ENSMUST00000211684 1074 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
P10404 Gm4800-201ENSMUST00000215776 1266 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
P10404 AC151971.2-201ENSMUST00000217540 909 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
P10404 Gm7240-201ENSMUST00000220769 664 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
P10404 Gm33684-201ENSMUST00000221119 263 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
P10404 Gm18629-201ENSMUST00000222496 884 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
P10404 AC131068.1-201ENSMUST00000226891 482 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
P10404 AC107452.2-201ENSMUST00000228415 363 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
P10404 Emc2-201ENSMUST00000022962 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
P10404 Olfr680-ps1-201ENSMUST00000042676 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
P10404 Defb34-201ENSMUST00000064475 246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
P10404 Olfr504-201ENSMUST00000075595 958 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
P10404 Gm10123-201ENSMUST00000075723 490 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
P10404 Gm8882-201ENSMUST00000080849 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
P10404 Grxcr1-201ENSMUST00000094715 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
P10404 Ifit3-201ENSMUST00000102825 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
P10404 Nyap2-202ENSMUST00000113494 4540 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
P10404 Cxcl9-201ENSMUST00000113093 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
P10404 Gm15189-201ENSMUST00000121164 1966 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
P10404 Jcad-201ENSMUST00000037029 6730 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
P10404 Mef2c-213ENSMUST00000197681 2753 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
P10404 Pglyrp4-203ENSMUST00000169698 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
P10404 Golph3l-202ENSMUST00000098861 2221 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
P10404 Cxcr2-202ENSMUST00000106899 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
P10404 T2-201ENSMUST00000163578 1755 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
P10404 Deup1-202ENSMUST00000115592 2918 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
P10404 Adgb-204ENSMUST00000172530 5215 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
P10404 Gm13619-201ENSMUST00000155722 2138 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
P10404 Olfr452-204ENSMUST00000217701 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
P10404 Ndnf-201ENSMUST00000054351 10101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
P10404 Cntn4-206ENSMUST00000113264 5262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
P10404 Kif4-ps-201ENSMUST00000184686 3665 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
P10404 Il5ra-203ENSMUST00000205004 2271 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
P10404 2610203C20Rik-215ENSMUST00000212373 1574 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
P10404 Gm3669-201ENSMUST00000126712 1846 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
P10404 Gm2165-202ENSMUST00000129963 1846 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
P10404 Gm2101-203ENSMUST00000133794 1846 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
P10404 Gm2117-203ENSMUST00000147993 1846 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
P10404 Glra4-201ENSMUST00000018739 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
P10404 Cep85-202ENSMUST00000121566 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
P10404 Rubcnl-201ENSMUST00000036072 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
P10404 Olfr1199-203ENSMUST00000131038 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
P10404 Stra6l-203ENSMUST00000107783 3669 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
P10404 Elovl6-201ENSMUST00000071402 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
P10404 AC153501.1-201ENSMUST00000218156 1860 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
P10404 Arfgef1-201ENSMUST00000088615 6978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
P10404 Rnf170-203ENSMUST00000110575 966 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
P10404 Bdnf-203ENSMUST00000111043 3839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
P10404 Gm26469-201ENSMUST00000116765 121 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
P10404 Gm14624-201ENSMUST00000117746 192 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
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P10404 Sel1l2-201ENSMUST00000120133 579 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
P10404 Gm11838-201ENSMUST00000121999 231 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
P10404 Gm12819-201ENSMUST00000122223 629 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
P10404 Pla2g2a-203ENSMUST00000135748 788 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
P10404 Gm15339-201ENSMUST00000153577 506 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
P10404 Gm23822-201ENSMUST00000158739 128 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
P10404 Polr3g-204ENSMUST00000161920 733 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
P10404 Traj54-201ENSMUST00000165071 54 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
P10404 Lgals1-ps2-201ENSMUST00000170221 519 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
P10404 Gm8895-201ENSMUST00000172300 1223 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
P10404 Gm20452-201ENSMUST00000174686 513 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
P10404 Obox4-ps38-201ENSMUST00000175961 724 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
P10404 Gm20627-202ENSMUST00000176275 564 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
P10404 Tdgf1-ps1-201ENSMUST00000179882 516 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
P10404 Gm8167-201ENSMUST00000183320 958 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
P10404 Shisa5-207ENSMUST00000197483 534 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
P10404 Igkv12-49-201ENSMUST00000197714 278 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
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P10404 Mir1897-202ENSMUST00000198006 79 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
P10404 Gm35667-201ENSMUST00000199122 711 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
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P10404 Gm18599-201ENSMUST00000206729 1125 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
P10404 Gm19032-201ENSMUST00000208584 592 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
P10404 1600027J07Rik-201ENSMUST00000209501 489 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
P10404 Gm45283-201ENSMUST00000210593 628 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
P10404 AC156832.3-201ENSMUST00000215591 435 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
P10404 Gm11427-204ENSMUST00000216233 999 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
P10404 AC118733.1-201ENSMUST00000217387 1217 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
P10404 AC156560.1-201ENSMUST00000221425 256 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
P10404 Gm34215-202ENSMUST00000223024 492 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
P10404 CT030170.6-202ENSMUST00000223186 544 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
P10404 Glycam1-203ENSMUST00000228060 528 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
P10404 AC152394.2-202ENSMUST00000228503 1064 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
P10404 Tmem225-201ENSMUST00000046333 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
P10404 Olfr911-ps1-201ENSMUST00000074987 940 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
P10404 Olfr888-201ENSMUST00000075228 945 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
P10404 Gm25259-201ENSMUST00000083048 193 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
P10404 Gm23970-201ENSMUST00000083319 107 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
P10404 Klk1b3-201ENSMUST00000085450 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
P10404 Vmn1r43-201ENSMUST00000089418 1069 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
P10404 Ifna4-201ENSMUST00000094973 561 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
P10404 Rpl27-ps3-201ENSMUST00000097682 475 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
P10404 Gm37968-201ENSMUST00000195131 3201 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
P10404 Atp1a4-201ENSMUST00000111243 3470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
P10404 Gm37855-201ENSMUST00000192571 3700 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
P10404 Kcnb2-202ENSMUST00000175681 3963 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
P10404 Kcnj15-205ENSMUST00000113858 5309 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
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