Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 Gm13237-201ENSMUST00000122151 635 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
H2-Q1O19441 Gm10130-201ENSMUST00000133235 303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
H2-Q1O19441 Gm14097-201ENSMUST00000147868 470 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
H2-Q1O19441 Mir1930-201ENSMUST00000158799 84 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
H2-Q1O19441 Gm16006-201ENSMUST00000160938 566 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
H2-Q1O19441 Gm24756-201ENSMUST00000177002 96 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
H2-Q1O19441 Gm2888-202ENSMUST00000178577 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
H2-Q1O19441 Gm8883-204ENSMUST00000189680 699 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
H2-Q1O19441 Gm2453-201ENSMUST00000193383 357 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
H2-Q1O19441 Gm8479-201ENSMUST00000203825 718 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
H2-Q1O19441 Gm44213-201ENSMUST00000204977 703 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
H2-Q1O19441 Olfr451-ps1-201ENSMUST00000205127 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
H2-Q1O19441 Gm44836-201ENSMUST00000205869 336 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
H2-Q1O19441 Gm5418-201ENSMUST00000206932 528 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
H2-Q1O19441 Gm39271-201ENSMUST00000212881 434 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
H2-Q1O19441 Gm45725-201ENSMUST00000212962 337 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
H2-Q1O19441 AC108846.4-201ENSMUST00000216783 341 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
H2-Q1O19441 Gm8275-201ENSMUST00000219732 424 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
H2-Q1O19441 AC153821.2-201ENSMUST00000220253 468 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
H2-Q1O19441 Gm31711-201ENSMUST00000220687 196 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
H2-Q1O19441 AC115304.1-202ENSMUST00000226850 837 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
H2-Q1O19441 Olfr535-201ENSMUST00000074897 991 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
H2-Q1O19441 Olfr653-201ENSMUST00000098174 1046 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
H2-Q1O19441 Gm17203-201ENSMUST00000164379 4017 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
H2-Q1O19441 Csnk1g1-213ENSMUST00000206528 1740 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
H2-Q1O19441 Adam3-209ENSMUST00000171438 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
H2-Q1O19441 Kat7-201ENSMUST00000072621 3324 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
H2-Q1O19441 AC107742.1-201ENSMUST00000227769 1390 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
H2-Q1O19441 AC139754.2-201ENSMUST00000218037 1455 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
H2-Q1O19441 AC187103.1-201ENSMUST00000224641 1475 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
H2-Q1O19441 Tlr4-201ENSMUST00000048096 4077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
H2-Q1O19441 Ikzf3-201ENSMUST00000103141 3658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
H2-Q1O19441 Zfp934-209ENSMUST00000222746 2206 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
H2-Q1O19441 Osbpl9-214ENSMUST00000160774 2765 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
H2-Q1O19441 Tsix-201ENSMUST00000152916 4306 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
H2-Q1O19441 Kdm5d-201ENSMUST00000055032 7974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
H2-Q1O19441 Ptpra-202ENSMUST00000077303 3066 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
H2-Q1O19441 Gsdme-202ENSMUST00000101405 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
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H2-Q1O19441 Zc4h2-202ENSMUST00000119640 2075 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
H2-Q1O19441 Gm31520-202ENSMUST00000203574 1524 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
H2-Q1O19441 Olfr119-201ENSMUST00000080483 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
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H2-Q1O19441 Il13ra2-201ENSMUST00000033646 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
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H2-Q1O19441 Gm26417-201ENSMUST00000104274 135 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
H2-Q1O19441 BC080695-201ENSMUST00000105765 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
H2-Q1O19441 Gm12635-201ENSMUST00000117285 752 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
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H2-Q1O19441 Gm13179-202ENSMUST00000151994 978 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
H2-Q1O19441 Gm12863-201ENSMUST00000155069 536 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
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H2-Q1O19441 CT030238.4-202ENSMUST00000226143 745 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
H2-Q1O19441 Tipin-201ENSMUST00000034964 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
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H2-Q1O19441 Olfr1361-201ENSMUST00000055615 954 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
H2-Q1O19441 4933400A11Rik-201ENSMUST00000068874 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
H2-Q1O19441 Gm4876-203ENSMUST00000139701 2225 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
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H2-Q1O19441 Gm45175-201ENSMUST00000208295 1375 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
H2-Q1O19441 Gbp4-201ENSMUST00000100962 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
H2-Q1O19441 Olfr645-201ENSMUST00000057104 3677 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
H2-Q1O19441 Olfr239-203ENSMUST00000214406 3773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
H2-Q1O19441 Map2-203ENSMUST00000114012 5119 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
H2-Q1O19441 Lpin2-203ENSMUST00000126681 4167 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
H2-Q1O19441 Gsdmc4-201ENSMUST00000063530 1988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
H2-Q1O19441 Timm17a-201ENSMUST00000081104 7280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
H2-Q1O19441 Gm42611-201ENSMUST00000199446 3407 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
H2-Q1O19441 Gm28798-201ENSMUST00000186372 2161 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
H2-Q1O19441 Gm42940-201ENSMUST00000200361 2362 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
H2-Q1O19441 Mtpap-201ENSMUST00000025077 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
H2-Q1O19441 AC164567.3-201ENSMUST00000217743 2869 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
H2-Q1O19441 Gm43842-201ENSMUST00000202890 2982 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
H2-Q1O19441 Gm26648-201ENSMUST00000181925 5831 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
H2-Q1O19441 Gm38276-201ENSMUST00000192446 1343 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms