Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Gm6428-201ENSMUST00000161062 345 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Olfr443-ps1-201ENSMUST00000163240 915 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Gm7651-201ENSMUST00000173398 901 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Obox4-ps31-201ENSMUST00000177210 1137 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Gm29072-201ENSMUST00000191149 678 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 9530018H14Rik-201ENSMUST00000192253 1243 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Gm4602-201ENSMUST00000203198 308 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Gm44988-201ENSMUST00000203835 1161 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Gm21054-201ENSMUST00000203981 380 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Olfr440-ps1-201ENSMUST00000204044 917 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Gm44020-201ENSMUST00000204618 664 ntTSL 3 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Gm44508-201ENSMUST00000206943 1157 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Olfr706-201ENSMUST00000209025 1087 ntAPPRIS P1 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Gm9652-201ENSMUST00000209345 163 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Gm18645-201ENSMUST00000209593 651 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Ccl7-201ENSMUST00000021011 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Cwc15-202ENSMUST00000213913 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 AC170913.1-201ENSMUST00000221418 758 ntTSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 AC154635.1-201ENSMUST00000221433 400 ntTSL 3 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 AC154636.3-201ENSMUST00000221489 1214 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 AC116589.3-202ENSMUST00000221770 649 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 AC116589.6-201ENSMUST00000222252 649 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Gm10160-201ENSMUST00000085094 201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Olfr1053-201ENSMUST00000099897 942 ntAPPRIS P1 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 AC166574.5-201ENSMUST00000227438 1432 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Ank3-239ENSMUST00000183148 7404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Gm10259-201ENSMUST00000091289 1590 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Olfr119-202ENSMUST00000213732 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 AC122356.1-202ENSMUST00000227328 2758 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Amer1-201ENSMUST00000084535 8496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Larp1b-201ENSMUST00000026862 1541 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Rbms3-207ENSMUST00000164018 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Zbtb18-202ENSMUST00000094276 4204 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Bdnf-204ENSMUST00000111044 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Nipa2-203ENSMUST00000119041 2979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Gm37060-201ENSMUST00000194997 2397 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 D030045P18Rik-203ENSMUST00000214947 1938 ntTSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Usp7-207ENSMUST00000160405 4745 ntTSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Gm37952-202ENSMUST00000192516 1497 ntTSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Gpr87-203ENSMUST00000200095 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Gm11758-202ENSMUST00000107327 1325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Zbtb44-202ENSMUST00000167346 1308 ntTSL 3 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Il18bp-201ENSMUST00000094134 1311 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Gm38070-201ENSMUST00000191850 6480 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 AC135669.2-201ENSMUST00000215636 4958 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
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Spocd1B1ASB6 Scaper-201ENSMUST00000037408 5158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Cspp1-217ENSMUST00000186294 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
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Spocd1B1ASB6 Mgst1-202ENSMUST00000118091 1030 ntTSL 2 BASIC8.07□□□□□ -1.12
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Spocd1B1ASB6 Gm13735-201ENSMUST00000120217 670 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
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Spocd1B1ASB6 1700011I03Rik-204ENSMUST00000135806 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Gm11267-201ENSMUST00000137477 1071 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Gm13840-201ENSMUST00000149608 256 ntTSL 2 BASIC8.07□□□□□ -1.12
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Spocd1B1ASB6 Tmem27-201ENSMUST00000015545 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
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Spocd1B1ASB6 2010103J01Rik-201ENSMUST00000192375 388 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
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Spocd1B1ASB6 Olfr1101-201ENSMUST00000099870 933 ntAPPRIS P1 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Gucy2g-201ENSMUST00000069183 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Agbl1-203ENSMUST00000156166 3369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Myo6-205ENSMUST00000127779 4067 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Olfr1264-202ENSMUST00000216616 4311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Fbxl5-203ENSMUST00000114047 2762 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Fam60a-211ENSMUST00000204435 2785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
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Spocd1B1ASB6 Gm10623-201ENSMUST00000209081 2639 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Gabpb2-205ENSMUST00000136139 8661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Gm26512-201ENSMUST00000181874 3042 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 CT025639.1-201ENSMUST00000223906 1375 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Hepacam2-201ENSMUST00000049985 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Itih3-201ENSMUST00000006697 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Gm4319-201ENSMUST00000191139 2048 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 4933427D14Rik-201ENSMUST00000108505 1495 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Serpina1f-203ENSMUST00000118101 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Mphosph9-201ENSMUST00000031344 7747 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Hspg2-201ENSMUST00000030547 14187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Obox3-206ENSMUST00000174443 1979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Spocd1B1ASB6 Olfr324-203ENSMUST00000216965 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms