Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 BC064078-202ENSMUST00000131176 2299 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 Rabgap1-201ENSMUST00000061179 4967 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 Gm30698-201ENSMUST00000214789 3198 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 Lats1-203ENSMUST00000217931 4186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 Lats1-201ENSMUST00000040043 4155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 Greb1-212ENSMUST00000162112 8058 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 4930431P03Rik-204ENSMUST00000228169 1967 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 Cdon-201ENSMUST00000042842 7213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 Nmur2-201ENSMUST00000037682 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 Stat1-201ENSMUST00000070968 5151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 Igkv4-68-201ENSMUST00000103350 394 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 Igkv4-59-201ENSMUST00000103354 368 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 Trav8d-1-201ENSMUST00000103580 400 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 Gm11462-201ENSMUST00000117749 562 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 Gm11902-201ENSMUST00000118849 270 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 Rpl5-ps2-201ENSMUST00000119057 891 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 Vmn2r-ps131-201ENSMUST00000176094 1046 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 Gm29385-201ENSMUST00000186831 363 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 Eif4a2-224ENSMUST00000187168 1238 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 Gm20751-201ENSMUST00000210260 1270 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 Gm6150-202ENSMUST00000219888 2977 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 AC168062.1-201ENSMUST00000228048 769 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 Arhgdib-201ENSMUST00000032344 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 Olfr350-201ENSMUST00000055130 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 Pkn2-210ENSMUST00000174422 2904 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 Hyal5-202ENSMUST00000200968 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 Il18r1-201ENSMUST00000087983 2826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 Cyp2j13-201ENSMUST00000030305 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 C2cd3-201ENSMUST00000051777 7803 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 Epha5-201ENSMUST00000053733 7328 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 Gm10032-201ENSMUST00000071522 1887 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 Trp53cor1-201ENSMUST00000133221 2956 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 Cd209a-201ENSMUST00000012847 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 Trim43b-202ENSMUST00000189557 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 Dcaf1-201ENSMUST00000055009 4967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 Papolg-201ENSMUST00000020513 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 Srrm4os-201ENSMUST00000126959 3360 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 R3hdm2-202ENSMUST00000077046 4029 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 Gprasp1-203ENSMUST00000113147 5611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 Frmpd4-201ENSMUST00000112145 7924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 Mcmdc2-205ENSMUST00000171802 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 Spaca7-201ENSMUST00000010579 762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 Gm8692-201ENSMUST00000118102 438 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 Gm14300-201ENSMUST00000120800 946 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 Gm24383-201ENSMUST00000122691 333 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 Gm26023-201ENSMUST00000122722 313 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 Gm23259-201ENSMUST00000158318 303 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 Gm10177-201ENSMUST00000160052 444 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 Gm45844-201ENSMUST00000173842 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 Gm9517-201ENSMUST00000195021 874 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 Mageb16-ps2-201ENSMUST00000204513 1093 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 Spaca7-202ENSMUST00000209428 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 Stx3-206ENSMUST00000211047 870 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 AC153537.1-201ENSMUST00000215530 858 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 Gm19212-201ENSMUST00000216642 862 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 AC125117.2-201ENSMUST00000228344 1140 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 Slc17a4-202ENSMUST00000110407 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 Rftn2-201ENSMUST00000027121 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 AC135083.2-201ENSMUST00000228599 1456 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 Gm42523-201ENSMUST00000199378 2872 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 Mrpl48-208ENSMUST00000150042 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 Depdc1a-202ENSMUST00000106041 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 Cyb5r2-201ENSMUST00000052438 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 Gm26807-201ENSMUST00000181132 4363 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 Gm38811-201ENSMUST00000203781 3478 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 Ikbkg-201ENSMUST00000004330 6918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 Txlnb-201ENSMUST00000037964 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 Kcnj6-203ENSMUST00000165538 3637 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Scn3aA2ASI5 Gm12169-201ENSMUST00000109228 1065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Scn3aA2ASI5 Gm23674-201ENSMUST00000157473 131 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Scn3aA2ASI5 Gm24687-201ENSMUST00000157758 241 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Scn3aA2ASI5 Gm17118-201ENSMUST00000164032 335 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Scn3aA2ASI5 Ms4a12-201ENSMUST00000186228 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Scn3aA2ASI5 Slamf7-205ENSMUST00000194791 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Scn3aA2ASI5 Gm37901-201ENSMUST00000195107 514 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Scn3aA2ASI5 Gm42951-201ENSMUST00000199688 684 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Scn3aA2ASI5 Klk1b10-ps-201ENSMUST00000205895 783 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Scn3aA2ASI5 Fxyd1-212ENSMUST00000206305 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Scn3aA2ASI5 Gm18789-201ENSMUST00000216115 550 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Scn3aA2ASI5 Sprr2j-ps-201ENSMUST00000029533 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Scn3aA2ASI5 Olfr109-201ENSMUST00000031086 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Scn3aA2ASI5 Olfr166-201ENSMUST00000074739 1040 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Scn3aA2ASI5 4933411G06Rik-201ENSMUST00000075909 1022 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Scn3aA2ASI5 Rpl31-ps17-201ENSMUST00000097040 378 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Scn3aA2ASI5 Scd1-201ENSMUST00000041331 4836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Scn3aA2ASI5 Vps50-201ENSMUST00000001412 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Scn3aA2ASI5 Zfand4-201ENSMUST00000036503 3123 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Scn3aA2ASI5 Spag17os-202ENSMUST00000145279 3219 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Scn3aA2ASI5 Gm10855-201ENSMUST00000100426 2541 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Scn3aA2ASI5 Pgbd1-202ENSMUST00000122872 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Scn3aA2ASI5 Myo3b-203ENSMUST00000112243 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Scn3aA2ASI5 Gm5431-203ENSMUST00000109212 3063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Scn3aA2ASI5 Cyp2c55-201ENSMUST00000025966 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Scn3aA2ASI5 Exoc1-201ENSMUST00000049469 3272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Scn3aA2ASI5 Slc6a19-201ENSMUST00000022048 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Scn3aA2ASI5 Gm29198-201ENSMUST00000190102 1512 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Scn3aA2ASI5 Gm45902-201ENSMUST00000124331 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Scn3aA2ASI5 Olfr1412-202ENSMUST00000190505 3663 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Scn3aA2ASI5 A830010M20Rik-203ENSMUST00000100951 4545 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Scn3aA2ASI5 Vmn2r16-201ENSMUST00000165180 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms