Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 1700031M16Rik-204ENSMUST00000189724 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
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Ccdc97Q9DBT3 Gm29435-201ENSMUST00000191310 689 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 1700021F02Rik-201ENSMUST00000197576 350 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 Gm43558-201ENSMUST00000200155 210 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 Traf1-209ENSMUST00000201690 386 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 Gm4270-201ENSMUST00000209666 406 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 Gm45608-201ENSMUST00000210948 389 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 Gm45307-201ENSMUST00000211122 751 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 AC121793.1-201ENSMUST00000214211 633 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 Gm8058-201ENSMUST00000217247 587 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 CT954323.2-201ENSMUST00000222056 213 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 CT010472.1-201ENSMUST00000224000 704 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 CT025579.4-201ENSMUST00000224598 627 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 Lmbrd2-204ENSMUST00000227556 8099 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 Olfr905-201ENSMUST00000051111 937 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 Vmn1r218-201ENSMUST00000074992 897 ntAPPRIS P2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 Olfr948-201ENSMUST00000076516 966 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 Vmn1r52-201ENSMUST00000079832 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 Rfwd3-201ENSMUST00000038739 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 Serpinb7-201ENSMUST00000086690 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 Gm31410-201ENSMUST00000217302 4048 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 AC122426.2-201ENSMUST00000216522 2947 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 Il7-201ENSMUST00000168269 2307 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 Gm26545-201ENSMUST00000181082 1746 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 Gm36186-201ENSMUST00000200820 2052 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 4933406B17Rik-201ENSMUST00000212602 4333 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 Pcdh15-203ENSMUST00000105424 6932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 Pcdh15-202ENSMUST00000092420 6917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 Zik1-201ENSMUST00000032551 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 Olfr293-202ENSMUST00000214401 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 Rab3b-202ENSMUST00000106650 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 Gm42658-201ENSMUST00000197199 1575 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 Gk-206ENSMUST00000142152 4229 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 Gm42885-201ENSMUST00000200763 4214 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 Gm18726-201ENSMUST00000218175 2010 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 Zfp568-202ENSMUST00000146074 6867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 3830408C21Rik-202ENSMUST00000223895 1689 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 Cbll1-202ENSMUST00000085487 1332 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 Etl4-209ENSMUST00000114627 7413 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 Olfr1302-202ENSMUST00000214708 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 Psg17-201ENSMUST00000004655 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 Skint7-204ENSMUST00000163281 1423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
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Ccdc97Q9DBT3 C87977-204ENSMUST00000105757 1885 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 1110008L16Rik-201ENSMUST00000021411 3122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 Gm18537-202ENSMUST00000206215 1503 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 Gm19667-201ENSMUST00000188984 3334 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 Zkscan7-204ENSMUST00000214957 5650 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 4932435O22Rik-202ENSMUST00000148405 3406 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 Lrrc6-201ENSMUST00000023006 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 Trmt10b-201ENSMUST00000044673 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
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Ccdc97Q9DBT3 Gm16325-201ENSMUST00000141199 3174 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 Zmat4-201ENSMUST00000042352 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
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Ccdc97Q9DBT3 Klra8-201ENSMUST00000014476 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
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Ccdc97Q9DBT3 Txn-ps1-201ENSMUST00000186385 309 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 Gm20918-202ENSMUST00000188637 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
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Ccdc97Q9DBT3 5033403H07Rik-203ENSMUST00000198580 467 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 Gm8190-201ENSMUST00000199603 586 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 Klk1b2-ps-201ENSMUST00000206099 786 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 Gm44707-201ENSMUST00000206293 1216 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 E230029C05Rik-204ENSMUST00000208266 875 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 Gm45446-201ENSMUST00000209348 216 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 Olfr494-202ENSMUST00000210291 947 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 Gm45269-201ENSMUST00000210359 282 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
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Ccdc97Q9DBT3 Gm34983-201ENSMUST00000219484 396 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 AL591207.2-201ENSMUST00000222991 337 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc97Q9DBT3 Zfp874a-208ENSMUST00000225479 1092 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
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