Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 3110043O21Rik-202ENSMUST00000108126 2644 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 A530076I17Rik-202ENSMUST00000228352 1524 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 Gm43557-201ENSMUST00000197100 2370 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 Gm25445-201ENSMUST00000158996 299 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 Mir3572-201ENSMUST00000175549 86 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 Gm26969-201ENSMUST00000183203 648 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 Gm37770-201ENSMUST00000192855 772 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 Gm43098-201ENSMUST00000199989 1297 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 Gm45850-201ENSMUST00000212536 338 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 Gm36262-201ENSMUST00000223274 499 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 AC122393.2-201ENSMUST00000226404 1093 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 Ankrd6-201ENSMUST00000035719 4683 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 Olfr447-201ENSMUST00000055763 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 Fam183b-202ENSMUST00000094156 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 Add2-209ENSMUST00000204059 8182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 Alcam-203ENSMUST00000164728 1885 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 Gm38178-201ENSMUST00000194502 2471 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 Pogz-204ENSMUST00000107269 5966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 4921528I07Rik-202ENSMUST00000213446 3798 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 9330158H04Rik-206ENSMUST00000161161 3103 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 1700014D04Rik-203ENSMUST00000180139 3231 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 Cyld-203ENSMUST00000109626 7945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 6430584L05Rik-201ENSMUST00000204412 3151 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 Kidins220-210ENSMUST00000222941 6277 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 Rtel1-202ENSMUST00000054622 4401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 Gm37084-201ENSMUST00000191688 5898 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 Skiv2l2-201ENSMUST00000022281 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 Psg26-201ENSMUST00000094798 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 Actr6-201ENSMUST00000020109 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 Tbc1d24-202ENSMUST00000040474 6269 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 Trav14n-3-201ENSMUST00000103635 280 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 4930402F06Rik-201ENSMUST00000113009 1150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 Olfr1069-ps1-201ENSMUST00000120755 965 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 Gm12147-201ENSMUST00000144024 182 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 Gm27970-201ENSMUST00000184854 407 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 Gm38131-201ENSMUST00000192449 430 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 Gm20926-201ENSMUST00000194457 696 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 Gm20751-201ENSMUST00000210260 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 Gm39336-201ENSMUST00000214933 260 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 H60c-203ENSMUST00000216211 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 Olfr1076-201ENSMUST00000076263 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 Cep85l-201ENSMUST00000095691 2560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 Gja6-201ENSMUST00000069417 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 Sh3rf2-202ENSMUST00000074679 4444 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 Gm44620-201ENSMUST00000209183 2887 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 Kif2a-204ENSMUST00000122233 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 Gm9603-201ENSMUST00000165814 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 Gm3542-201ENSMUST00000169362 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 Zfp825-202ENSMUST00000202645 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 Vmn2r98-201ENSMUST00000170424 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 Rbm6-ps1-201ENSMUST00000186192 2870 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 CT009757.6-201ENSMUST00000220661 2312 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 Blm-202ENSMUST00000170315 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 Bcas3os1-202ENSMUST00000151652 3138 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 Nmur2-201ENSMUST00000037682 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 Zfp971-201ENSMUST00000108925 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 4930412B13Rik-201ENSMUST00000149239 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 Sumo2-207ENSMUST00000153892 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 Gm6061-201ENSMUST00000175860 492 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 AC153566.2-201ENSMUST00000213841 330 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 Zfp970-201ENSMUST00000099002 794 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 Gm14391-201ENSMUST00000099028 473 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 AC159308.1-201ENSMUST00000216615 1351 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 Slf2-201ENSMUST00000096053 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 Olfr1340-204ENSMUST00000217334 2001 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 Gucy1a3-201ENSMUST00000048976 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 BC106179-201ENSMUST00000055369 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 Alg6-201ENSMUST00000097961 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 Ighv1-20-201ENSMUST00000103506 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 Gm22194-201ENSMUST00000116869 95 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 Gm26211-201ENSMUST00000158578 129 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 Gm17198-201ENSMUST00000171792 1154 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 Gm8895-201ENSMUST00000172300 1223 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 Gm28883-201ENSMUST00000189256 369 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 Gm29678-201ENSMUST00000193966 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 Gm45350-201ENSMUST00000210560 509 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 Olfr1447-201ENSMUST00000071484 1113 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 Olfr195-201ENSMUST00000075381 995 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 Gm15930-201ENSMUST00000156603 2037 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 Tial1-211ENSMUST00000165023 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 Cfhr2-201ENSMUST00000094489 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 Gm5799-201ENSMUST00000169023 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 Kif24-201ENSMUST00000030148 4333 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 Gm14762-201ENSMUST00000105109 1771 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 Gm38142-201ENSMUST00000194093 3555 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 Mcm10-201ENSMUST00000027980 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 Gm31562-201ENSMUST00000213973 2747 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 Disp2-201ENSMUST00000037547 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 Gm28667-201ENSMUST00000189873 2171 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 Gm14935-201ENSMUST00000121528 1708 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 AC122769.3-201ENSMUST00000227739 3245 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 Sub1-202ENSMUST00000110504 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 Smt3h1-ps-201ENSMUST00000117126 280 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 Smim24-202ENSMUST00000118206 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 Gm3715-201ENSMUST00000172308 617 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 1700006H21Rik-201ENSMUST00000188490 627 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 Gm44251-201ENSMUST00000204963 442 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 Cox7b-201ENSMUST00000033582 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 Ccdc54-201ENSMUST00000062439 1296 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NischQ80TM9 Adgrl3-207ENSMUST00000118078 4871 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116 ms