Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM3

Trim17, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM17, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim17Q7TPM3 Tmprss15-202ENSMUST00000060402 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Hsd3b3-202ENSMUST00000094050 1327 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Ralyl-203ENSMUST00000171075 1459 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Nfib-201ENSMUST00000050872 8770 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Rab39b-201ENSMUST00000033545 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Mcm4-201ENSMUST00000023353 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Pcdh15-203ENSMUST00000105424 6932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Pcdh15-202ENSMUST00000092420 6917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Olfr1441-203ENSMUST00000216506 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm15950-201ENSMUST00000162902 1973 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm36388-201ENSMUST00000191663 1675 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Oscp1-201ENSMUST00000035497 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Olfr972-203ENSMUST00000216167 1522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 AC154141.1-201ENSMUST00000208403 4136 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Robo2-202ENSMUST00000117200 5988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Alg6-201ENSMUST00000097961 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm38120-201ENSMUST00000195506 4642 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm37896-201ENSMUST00000195611 2791 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Nol8-203ENSMUST00000221142 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm13856-201ENSMUST00000126498 1742 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Ptbp2-207ENSMUST00000197464 1742 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Trdmt1-202ENSMUST00000124488 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 BC147527-202ENSMUST00000225029 1595 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm37234-201ENSMUST00000193259 1441 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm43187-201ENSMUST00000200652 2397 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Trav8d-1-201ENSMUST00000103580 400 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Eloc-201ENSMUST00000115352 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm22342-201ENSMUST00000122647 298 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Olfr636-ps1-201ENSMUST00000134827 935 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm11963-201ENSMUST00000149826 500 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm14343-201ENSMUST00000154524 731 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm6507-201ENSMUST00000159767 652 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Fabp12-204ENSMUST00000172126 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm20454-201ENSMUST00000172713 221 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm22990-201ENSMUST00000175427 89 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm20713-201ENSMUST00000176344 435 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm28739-201ENSMUST00000185415 696 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm28219-201ENSMUST00000185452 696 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm28542-201ENSMUST00000185545 696 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm28303-201ENSMUST00000185642 747 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm29244-201ENSMUST00000185825 696 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm29437-201ENSMUST00000185865 696 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm29412-201ENSMUST00000185869 696 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm28910-201ENSMUST00000185921 696 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm28812-201ENSMUST00000185963 696 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm29468-201ENSMUST00000185978 696 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm28335-201ENSMUST00000186204 696 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm28854-201ENSMUST00000186218 696 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm28636-201ENSMUST00000186353 696 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm28452-201ENSMUST00000186623 696 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm29298-201ENSMUST00000186704 696 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm28185-201ENSMUST00000186815 694 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm29385-201ENSMUST00000186831 363 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm28227-201ENSMUST00000186862 696 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm28796-201ENSMUST00000186905 696 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm29659-201ENSMUST00000187063 696 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm28473-201ENSMUST00000187325 696 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm28558-201ENSMUST00000187373 696 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm28682-201ENSMUST00000187430 696 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm28738-201ENSMUST00000187480 696 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm28949-201ENSMUST00000187805 696 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm28773-201ENSMUST00000187925 696 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm29319-201ENSMUST00000188060 696 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm29422-201ENSMUST00000188062 694 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm28734-201ENSMUST00000188104 696 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm28787-201ENSMUST00000188357 696 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm29312-201ENSMUST00000188724 696 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm29451-201ENSMUST00000188862 696 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm29637-201ENSMUST00000188877 696 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm29033-201ENSMUST00000189114 696 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm29614-201ENSMUST00000189263 694 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm28751-201ENSMUST00000189287 696 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm29559-201ENSMUST00000189412 696 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm28272-201ENSMUST00000189512 696 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm28483-201ENSMUST00000189519 696 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm28123-201ENSMUST00000189725 696 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm28368-201ENSMUST00000189804 696 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm29119-201ENSMUST00000189973 696 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 2310008N11Rik-201ENSMUST00000189978 568 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm28716-201ENSMUST00000190217 696 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm29239-201ENSMUST00000190304 696 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm28837-201ENSMUST00000190397 696 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm28968-201ENSMUST00000190413 696 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm28531-201ENSMUST00000190529 696 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm28165-201ENSMUST00000190669 694 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm29181-201ENSMUST00000191288 696 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm38229-201ENSMUST00000191931 696 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm32347-201ENSMUST00000192944 696 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm38121-201ENSMUST00000193213 696 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm17895-201ENSMUST00000194028 874 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm38035-201ENSMUST00000194427 696 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm38350-201ENSMUST00000194789 696 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm37990-201ENSMUST00000195821 696 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm43656-201ENSMUST00000197882 434 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm43964-201ENSMUST00000203570 301 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Olfr181-203ENSMUST00000205742 1104 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm34368-201ENSMUST00000209512 1111 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 2310008N11Rik-203ENSMUST00000210732 601 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 Gm19324-201ENSMUST00000213229 1169 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Trim17Q7TPM3 AC153537.1-201ENSMUST00000215530 858 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms