Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

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Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 n-R5s56-201ENSMUST00000082521 105 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Faddos-201ENSMUST00000097928 1053 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 5330413P13Rik-203ENSMUST00000150466 2173 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Gm21846-201ENSMUST00000179257 3073 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 D830026I12Rik-203ENSMUST00000151170 1607 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Olfr1396-204ENSMUST00000215553 4237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Ctnna3-202ENSMUST00000105440 3682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Vcan-206ENSMUST00000159910 8332 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 4930594C11Rik-201ENSMUST00000192316 2755 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Gabpb2-205ENSMUST00000136139 8661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Gm37953-201ENSMUST00000195293 1884 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Olfr1427-203ENSMUST00000216069 1863 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Gm11397-201ENSMUST00000050276 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 9530086O07Rik-201ENSMUST00000203503 2685 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Gm13872-202ENSMUST00000143995 1408 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Gnat3-201ENSMUST00000030561 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Ugt2b34-201ENSMUST00000031181 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Pcdh15-217ENSMUST00000134009 3300 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Gm23748-201ENSMUST00000104227 131 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Gm24473-201ENSMUST00000104483 131 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Synj2bp-202ENSMUST00000114201 1121 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Gm13265-201ENSMUST00000118090 421 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Klra4-201ENSMUST00000119096 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Gm12447-201ENSMUST00000119110 470 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Gm14038-201ENSMUST00000121500 807 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Gm12929-201ENSMUST00000122406 370 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Gm13746-201ENSMUST00000133981 605 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Gm20429-202ENSMUST00000174168 820 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 AA465934-205ENSMUST00000177533 308 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Gm5930-202ENSMUST00000178002 489 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Gm4221-202ENSMUST00000181765 2988 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Mir8097-201ENSMUST00000185150 119 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Gm4856-201ENSMUST00000192696 1091 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 4930597L12Rik-201ENSMUST00000196286 911 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Gm43089-201ENSMUST00000199162 275 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Gm34272-201ENSMUST00000208886 253 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Gm31812-201ENSMUST00000210323 1170 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Gm35274-201ENSMUST00000217709 646 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 AC155709.1-201ENSMUST00000218794 162 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 CT030238.4-202ENSMUST00000226143 745 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 AC154618.2-201ENSMUST00000228299 452 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Klre1-201ENSMUST00000053708 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Atp10d-201ENSMUST00000094710 2365 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Ccdc127-201ENSMUST00000022063 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Slc38a6-202ENSMUST00000101313 1546 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
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Usp49Q6P9L4 Gm38120-201ENSMUST00000195506 4642 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Gm4806-201ENSMUST00000222704 1690 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Olfr1340-202ENSMUST00000213436 1948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Olfr90-206ENSMUST00000217397 2680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Olfr1338-202ENSMUST00000214922 2947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Lrguk-204ENSMUST00000228187 10475 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Fam107a-203ENSMUST00000121887 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Gm15232-201ENSMUST00000146929 2318 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Vmn1r44-210ENSMUST00000227747 1811 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 AC152946.1-201ENSMUST00000218446 3474 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Unc13b-216ENSMUST00000207708 6574 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Atf7-211ENSMUST00000184906 1457 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Sox6-210ENSMUST00000206034 8668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Gm17354-201ENSMUST00000170933 3039 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Gm4847-201ENSMUST00000046662 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Gm20597-201ENSMUST00000218774 5486 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Zfp870-202ENSMUST00000228075 5222 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
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Usp49Q6P9L4 Grik2-202ENSMUST00000105484 3992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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Usp49Q6P9L4 Aph1c-202ENSMUST00000169282 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Gm29571-201ENSMUST00000191547 1909 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Rnf24-202ENSMUST00000110194 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Sox5-214ENSMUST00000170367 7184 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
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Usp49Q6P9L4 Gm2200-201ENSMUST00000124814 764 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Gm2117-201ENSMUST00000130478 764 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Hmgb4os-201ENSMUST00000131581 518 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Gm2101-202ENSMUST00000131997 764 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Gm2165-203ENSMUST00000137981 764 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Gm3669-204ENSMUST00000140946 764 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Ctcflos-202ENSMUST00000142207 918 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Gm24781-201ENSMUST00000157636 117 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Gm24545-201ENSMUST00000158651 85 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Gm6047-201ENSMUST00000167221 574 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Gm20615-201ENSMUST00000177503 705 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 G530012D18Rik-201ENSMUST00000178024 420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Gm8883-204ENSMUST00000189680 699 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Gm43377-201ENSMUST00000201640 455 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 1700028E10Rik-204ENSMUST00000201853 767 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Gm44213-201ENSMUST00000204977 703 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Gm17918-201ENSMUST00000205315 574 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Gm45703-201ENSMUST00000212293 891 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Tespa1-202ENSMUST00000217702 1102 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 AC122327.2-201ENSMUST00000220883 120 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 AC122327.3-201ENSMUST00000221852 120 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 AC154517.1-201ENSMUST00000222785 629 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 AC166341.1-201ENSMUST00000223360 105 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 CT009495.1-201ENSMUST00000224221 862 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 AC138329.1-201ENSMUST00000225040 471 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
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