Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Olfr461-201ENSMUST00000089490 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 Fmr1-204ENSMUST00000114655 4199 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 Afm-202ENSMUST00000128740 2465 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 Gbp7-202ENSMUST00000171263 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 Hist1h1d-201ENSMUST00000045301 7425 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 Zhx3-201ENSMUST00000103111 9563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 Cd59a-203ENSMUST00000168176 1806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 Srcap-206ENSMUST00000186954 9345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 Gm12388-201ENSMUST00000119112 1887 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 Dlg2-203ENSMUST00000107193 4910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 Hdlbp-202ENSMUST00000170883 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 Gm3591-201ENSMUST00000164408 1745 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 Fasl-201ENSMUST00000000834 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 Rp1-203ENSMUST00000208660 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 Olfr286-201ENSMUST00000073612 3821 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 Adarb2-202ENSMUST00000123187 4002 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 Plec-202ENSMUST00000054449 15018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 Armc2-203ENSMUST00000160262 4810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 Erc1-210ENSMUST00000184864 5428 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 7420700N18Rik-201ENSMUST00000209524 1644 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 BC028471-203ENSMUST00000202022 4113 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 C030029H02Rik-202ENSMUST00000210356 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 Muc6-201ENSMUST00000062451 8650 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 Trav6-6-201ENSMUST00000103584 344 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 Trav6n-5-201ENSMUST00000103611 338 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 Gm11624-201ENSMUST00000118579 1041 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 Gm13029-201ENSMUST00000137283 594 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 Gm11940-201ENSMUST00000153599 417 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 Gm22820-201ENSMUST00000157205 329 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 Trav6d-7-201ENSMUST00000178650 358 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 Trav6n-7-201ENSMUST00000179607 358 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 D3Ertd751e-212ENSMUST00000194346 744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 Gm3544-201ENSMUST00000196129 305 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 Trav6d-6-201ENSMUST00000197754 344 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 Gm38840-201ENSMUST00000204716 843 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 Gm45026-201ENSMUST00000205292 833 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 Gm34225-201ENSMUST00000205469 443 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 Gm45127-201ENSMUST00000205984 1015 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 Gm33326-201ENSMUST00000209741 3815 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 Gm6056-201ENSMUST00000221253 488 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 AC168062.1-201ENSMUST00000228048 769 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 Olfr777-201ENSMUST00000080313 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 Olfr657-201ENSMUST00000098171 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 Gm28475-201ENSMUST00000187645 1497 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 Wdr37-202ENSMUST00000054251 4626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 4933411E08Rik-201ENSMUST00000217950 1689 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 Apol10a-202ENSMUST00000119997 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 F2rl2-201ENSMUST00000022182 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 Psg17-201ENSMUST00000004655 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 Alkbh8-206ENSMUST00000212294 2584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 BC035044-201ENSMUST00000160290 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 Tmem232-201ENSMUST00000062161 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 Psg26-201ENSMUST00000094798 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 AC165260.6-205ENSMUST00000224190 9762 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 Cntrl-212ENSMUST00000156933 7189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 Gm13821-201ENSMUST00000202029 3201 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 Cflar-205ENSMUST00000114313 6572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 Zfp935-204ENSMUST00000223247 1949 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 Zscan4e-201ENSMUST00000166753 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 Mup19-202ENSMUST00000107477 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 Gm12901-201ENSMUST00000118690 532 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 Mup-ps28-201ENSMUST00000120686 289 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 Gm25459-201ENSMUST00000157953 114 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 Gm16164-201ENSMUST00000160078 468 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 Gm16333-201ENSMUST00000161416 318 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 Gm9597-201ENSMUST00000171913 602 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 Naa60-210ENSMUST00000176224 501 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 Gm27252-201ENSMUST00000183782 689 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 Gm6525-201ENSMUST00000193882 1029 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 Gm4332-201ENSMUST00000196114 346 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 AC140409.4-201ENSMUST00000215757 538 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 1190001M18Rik-201ENSMUST00000215937 1270 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 AC156832.1-201ENSMUST00000217609 811 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 Gm3942-201ENSMUST00000218495 666 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 AC154250.1-201ENSMUST00000224775 489 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 Krtap14-201ENSMUST00000099562 216 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 Gm37534-201ENSMUST00000194483 5222 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 Ryr1-208ENSMUST00000214374 15300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 Arhgef9-205ENSMUST00000113883 5399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 Gm37663-201ENSMUST00000191887 2299 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 Pou1f1-204ENSMUST00000176330 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 Zfp661-201ENSMUST00000077422 2765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 Golph3l-207ENSMUST00000177390 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 Gm42462-201ENSMUST00000196543 1363 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 Gm13490-201ENSMUST00000143870 2409 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 Cltc-202ENSMUST00000103186 6519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 AC153959.1-201ENSMUST00000213617 1694 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 Gm42577-201ENSMUST00000201367 3211 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 Serpina3c-201ENSMUST00000085050 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 Gm12043-201ENSMUST00000131570 2788 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 Amot-201ENSMUST00000112835 6519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 Olfr1414-201ENSMUST00000062353 6017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 Zfp239-207ENSMUST00000172088 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 Myo6-203ENSMUST00000113266 7632 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 Ighv1-20-201ENSMUST00000103506 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 Gm13428-201ENSMUST00000117540 365 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 Gm15078-201ENSMUST00000118371 782 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 Gm14870-201ENSMUST00000118414 156 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 Gm11622-201ENSMUST00000120525 691 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ccdc18Q640L5 Gm12400-201ENSMUST00000120915 1003 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1075.4 ms